我们报告了一系列具有新型 P3 支架的二肽型
抑制剂的设计和合成,这些
抑制剂对
SARS-CoV 3CLpro 显示出有效的抑制活性。一项涉及二肽先导化合物 4 和 3CLpro 之间结合的对接研究表明,用 4 中的各种刚性 P3 部分对结构灵活的 P3 N-(3-
甲氧基苯基)甘
氨酸进行修饰。这些修饰导致了几种有效衍
生物的鉴定,包括 5c -k 和 5n 的抑制活性(Ki 或 IC50)在亚微摩尔至纳摩尔范围内。尤其是化合物 5h,显示出最有效的抑制活性,Ki 值为 0.006 μM。该效力比先导化合物 4 的效力高 65 倍 (Ki=0.39 μM)。此外,5h 的 Ki 值与等温滴定量热法 (ITC) 中观察到的结合亲和力 (16 nM) 非常吻合。围绕先导 4 中 P3 基团的
SAR 研究发现刚性
吲哚-2-羰基单元是最佳 P3 部分之一 (5c)。进一步优化表明,
吲哚单元4位的甲氧基取代非常有利于增强抑制效力。