(S)-2-(1-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-methylpropyl)thiazole-4-carboxylic acid | 668489-48-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (S)-2-(1-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-methylpropyl)thiazole-4-carboxylic acid
• 英文别名: 2-[(1S)-1-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-2-methylpropyl]-1,3-thiazole-4-carboxylic acid
• CAS: 668489-48-3
• 化学式: C₂₃H₂₂N₂O₄S
• 分子量: 422.505
• InChiKey: ZJEFJTIFBRVRKY-FQEVSTJZSA-N

物化性质

• 沸点：
  633.2±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.315±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.8
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.26
• 拓扑面积：
  117
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-2-(1-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-methylpropyl)thiazole-4-carboxylic acid 在 palladium diacetate 4-二甲氨基吡啶 、 polystyrene-triphenylphosphine 、 苯硅烷 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 苯硫酚 、 二乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 30.17h， 生成 bistratamide J
  参考文献：
  名称：

  Lissoclinum bistratum中双双酰胺E和J的高效仿生全合成和结构验证。

  摘要：

  在过去的20年中，从海洋生物中分离出的含杂环的环状肽衍生的天然产物，其有趣的生物活性吸引了许多合成和天然产物化学家的兴趣。Bistratamides EJ是最近从双歧Lissoclinum bistratum中分离出来的此类天然产物的成员，对人结肠肿瘤（HCT-116）细胞系表现出细胞毒活性。在这里，我们报告了双链酰胺E（1）和J（2）的首次总合成，总收率分别为19％和34％。噻唑亚结构是通过氧化相应的噻唑啉亚结构而合成的，所述噻唑亚结构是使用新颖的仿生方法从含半胱氨酸的肽中获得的，其中Val-Cys二肽单元被双salt盐转化为噻唑啉。使用PyBOP和DMAP的组合可以有效地促进最终的大环化。这种方法允许使用容易获得的Fmoc保护的氨基酸来制备复杂的含噻唑和恶唑啉的天然产物。

  DOI：

  10.1002/chem.200305504
• 作为产物：
  描述：

  (S)-2-[1-(tert-butoxycarbonylamino)-2-methylpropyl]thiazole-4-carboxylic acid 在 碳酸氢钠 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 (S)-2-(1-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-2-methylpropyl)thiazole-4-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  吡啶合酶识别序列的鉴定允许对硫肽变体进行模块化固相途径

  摘要：

  硫肽是结构复杂、具有生物活性的天然产物，来源于核糖体合成和翻译后修饰的肽。最近发现一组显着的酶通过正式的 [4 + 2] 环加成催化硫肽核心三噻唑基吡啶的形成。这些吡啶合酶通常在硫肽生物合成的后期作用以影响 N 末端前导肽的大环化和切割，使其成为制备新硫肽变体的潜在有用的生物催化剂。在这里，我们研究了蜡样芽孢杆菌 ATCC 14579 中硫西林生物合成对 TclM 的前导肽要求。通过一系列截断，我们定义了 TclM 活性所必需和充分的最小识别序列 (RS)。这种 RS 可以很容易地合成并连接到通过固相肽合成 (SPPS) 制备的线性硫肽核心，从而为硫肽变体提供高效和模块化的途径。我们利用这种策略来定义 C 末端核心肽的要求，并探索两种吡啶合酶 TclM 和 TbtD 的混杂性差异，最终检查它们获得新结构变体的能力。

  DOI：

  10.1021/jacs.6b05389

文献信息

• A Compact Reprogrammed Genetic Code for De Novo Discovery of Proteolytically Stable Thiopeptides
  作者：Alexander A. Vinogradov、Yue Zhang、Keisuke Hamada、Shunsuke Kobayashi、Kazuhiro Ogata、Toru Sengoku、Yuki Goto、Hiroaki Suga

  DOI：10.1021/jacs.3c12037

  日期：2024.3.27

  that the utilization of compact reprogrammed genetic codes in mRNA display libraries can lead to the discovery of thiopeptides predominantly composed of nonproteinogenic structural elements. We demonstrate the feasibility of our designs by conducting affinity selections against Traf2- and NCK-interacting kinase (TNIK). The experiment identified a series of thiopeptides with high affinity to the target

  硫肽是一组结构复杂的肽类天然产物，在生物工程应用中具有广阔的前景。先前建立的硫肽/mRNA展示平台能够从头发现具有设计生物活性的类似天然产物的硫肽。然而，与天然硫肽相比，所发现的结构主要由蛋白氨基酸组成，这在许多情况下导致代谢稳定性较低。在这里，我们重新开发了该平台，并证明在 mRNA 展示库中利用紧凑的重编程遗传密码可以发现主要由非蛋白结构元件组成的硫肽。我们通过针对 Traf2 和 NCK 相互作用激酶 (TNIK) 进行亲和力选择来证明我们设计的可行性。实验鉴定出一系列与目标蛋白具有高亲和力（最佳K D = 2.1 nM）和激酶抑制活性（最佳IC 50 = 0.15 μM）的硫肽。这些发现的化合物在 18 个残基大环中含有多达 15 个非蛋白氨基酸，在人血清中表现出高代谢稳定性，半衰期长达 99 小时。 TNIK 与发现的硫肽复合物的 X 射线共晶结构揭示了非蛋白结构单元如何促进靶标
• Identification of Pyridine Synthase Recognition Sequences Allows a Modular Solid-Phase Route to Thiopeptide Variants
  作者：Walter J. Wever、Jonathan W. Bogart、Albert A. Bowers

  DOI：10.1021/jacs.6b05389

  日期：2016.10.19

  Bacillus cereus ATCC 14579. Through a series of truncations, we define a minimum recognition sequence (RS) that is necessary and sufficient for TclM activity. This RS can be readily synthesized and ligated to linear thiopeptide cores prepared via solid-phase peptide synthesis (SPPS), giving an efficient and modular route to thiopeptide variants. We exploit this strategy to define C-terminal core peptide requirements

  硫肽是结构复杂、具有生物活性的天然产物，来源于核糖体合成和翻译后修饰的肽。最近发现一组显着的酶通过正式的 [4 + 2] 环加成催化硫肽核心三噻唑基吡啶的形成。这些吡啶合酶通常在硫肽生物合成的后期作用以影响 N 末端前导肽的大环化和切割，使其成为制备新硫肽变体的潜在有用的生物催化剂。在这里，我们研究了蜡样芽孢杆菌 ATCC 14579 中硫西林生物合成对 TclM 的前导肽要求。通过一系列截断，我们定义了 TclM 活性所必需和充分的最小识别序列 (RS)。这种 RS 可以很容易地合成并连接到通过固相肽合成 (SPPS) 制备的线性硫肽核心，从而为硫肽变体提供高效和模块化的途径。我们利用这种策略来定义 C 末端核心肽的要求，并探索两种吡啶合酶 TclM 和 TbtD 的混杂性差异，最终检查它们获得新结构变体的能力。
• Highly Efficient Biomimetic Total Synthesis and Structural Verification of Bistratamides E and J fromLissoclinum bistratum
  作者：Shu-Li You、Jeffery W. Kelly

  DOI：10.1002/chem.200305504

  日期：2004.1.5

  cell line. Here we report the first total syntheses of bistratamides E (1) and J (2) in overall yields of 19 and 34 %, respectively. The thiazole substructures have been synthesized by oxidation of their corresponding thiazoline substructures, which were obtained from cysteine containing peptides using a novel biomimetic approach wherein Val-Cys dipeptide units were converted to thiazolines by a bisphosphonium

  在过去的20年中，从海洋生物中分离出的含杂环的环状肽衍生的天然产物，其有趣的生物活性吸引了许多合成和天然产物化学家的兴趣。Bistratamides EJ是最近从双歧Lissoclinum bistratum中分离出来的此类天然产物的成员，对人结肠肿瘤（HCT-116）细胞系表现出细胞毒活性。在这里，我们报告了双链酰胺E（1）和J（2）的首次总合成，总收率分别为19％和34％。噻唑亚结构是通过氧化相应的噻唑啉亚结构而合成的，所述噻唑亚结构是使用新颖的仿生方法从含半胱氨酸的肽中获得的，其中Val-Cys二肽单元被双salt盐转化为噻唑啉。使用PyBOP和DMAP的组合可以有效地促进最终的大环化。这种方法允许使用容易获得的Fmoc保护的氨基酸来制备复杂的含噻唑和恶唑啉的天然产物。