4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-methylhexanoate | 1075206-51-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-methylhexanoate
• 英文别名: (3S,4R)-allyl 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-methylhexanoate；prop-2-enyl (3S,4R)-4-[[(2S)-2-amino-3-tritylsulfanylpropanoyl]amino]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-methylhexanoate
• CAS: 1075206-51-7
• 化学式: C₃₈H₅₂N₂O₄SSi
• 分子量: 660.993
• InChiKey: BGJVRKWXDUPWGJ-RDUMUFLSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.69
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-methylhexanoate 在 吗啉 、 四(三苯基膦)钯 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 N,N-二异丙基乙胺 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 5.5h， 生成 (7S,11R,14S,17R,18S,E)-18-(tert-butyldimethylsilyloxy)-7-hydroxy-17-isopropyl-11-methyl-9,12,15-trioxo-1,1,1-triphenyl-14-tritylthiomethyl-2-thia-10,13,16-triazaicos-5-en-20-oic acid
  参考文献：
  名称：

  Total Synthesis of Spiruchostatin A — A Potent Histone Deacetylase Inhibitor

  摘要：

  DOI：

  10.3987/com-07-s(n)5
• 作为产物：
  描述：

  (3R,4R)-ethyl 4-(tert-butoxycarbonylamino)-3-hydroxy-5-methylhexanoate 在 咪唑 、 2,6-二甲基吡啶 、 钾硼氢 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 硫酸 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 三氧化铬 、 potassium carbonate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 、 乙腈 为溶剂， 反应 46.5h， 生成 4-[(S)-2-amino-3-(tritylthio)propanamido]-3-(tert-butyldimethylsiloxy)-5-methylhexanoate
  参考文献：
  名称：

  Total Synthesis of Spiruchostatin A — A Potent Histone Deacetylase Inhibitor

  摘要：

  DOI：

  10.3987/com-07-s(n)5

文献信息

• Total synthesis of burkholdacs A and B and 5,6,20-tri-epi-burkholdac A: HDAC inhibition and antiproliferative activity
  作者：Yurie Fukui、Koichi Narita、Singo Dan、Takao Yamori、Akihiro Ito、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1016/j.ejmech.2014.02.044

  日期：2014.4

  The bicyclic depsipeptide histone deacetylase (HDAC) inhibitors burkholdacs A and B were efficiently synthesized in a highly convergent and unified manner. The synthesis features the amide coupling of a d-valine-d-cysteine- or d-allo-isoleucine-d-cysteine-containing segment with a d-methionine-containing segment to directly assemble the corresponding seco-acids, key precursors for macrolactonization

  双环二肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂burkholDACs A和B以高度收敛和统一的方式高效合成。合成功能的酰胺耦合d -valine- d -cysteine-或d -异体-isoleucine- d段与含半胱氨酸- d含蛋氨酸片段直接装配相应的开环-acids，用于macrolactonization关键前体。使用同样的方法，5,6,20三-外延还合成了-burkholDACA。合成的双肽肽的HDAC抑制试验和细胞生长抑制分析表明，与临床批准的双肽肽FK228（romidepsin）相比，这类双环双肽肽的效价顺序更高。还揭示了这类化合物中的新型结构-活性关系。
• Total Synthesis of the Bicyclic Depsipeptide HDAC Inhibitors Spiruchostatins A and B, 5′′-<i>epi</i>-Spiruchostatin B, FK228 (FR901228) and Preliminary Evaluation of Their Biological Activity
  作者：Koichi Narita、Takuya Kikuchi、Kazuhiro Watanabe、Toshiya Takizawa、Takamasa Oguchi、Kyosuke Kudo、Keisuke Matsuhara、Hideki Abe、Takao Yamori、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1002/chem.200901552

  日期：2009.10.26

  Julia–Kocienski olefination of a 1,3‐propanediol‐derived sulfone and a L‐ or D‐malic acid‐derived aldehyde to access the most synthetically challenging unit, (3S or 3R,4E)‐3‐hydroxy‐7‐mercaptohept‐4‐enoic acid, present in a D‐alanine‐ or D‐valine‐containing segment; ii) a condensation of a D‐valine‐D‐cysteine‐ or D‐allo‐isoleucine‐D‐cysteine‐containing segment with a D‐alanine‐ or D‐valine‐containing

  双环去肽肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂spiruchostatins A和B，5'′- epi- spiruchostatin B和FK228可以通过聚合和统一的方式高效合成。合成方法涉及以下关键步骤：i）1，3-丙二醇衍生的砜和L-或D-苹果酸衍生的醛的Julia-Kocienski烯化反应，以合成最具挑战性的单元（3 S或3 R，4 E）-3-羟基-7-巯基庚基-4-烯酸，存在于含有D-丙氨酸或D-缬氨酸的链段中；ii）D-缬氨酸-D-半胱氨酸-或D的缩合-同种异体-isoleucine- d -半胱氨酸含与段d -alanine-或d含缬氨酸段直接组装相应的开环-acids; 和iii）的大环化开环使用椎名法或光延法构造必需15-或16-元大环内酯-酸。本合成已建立了螺旋藻抑素B的C5'立体化学。此外，对合成的二肽的HDAC抑制测定和细胞生长抑制分析确定了其效力的顺序，并揭示了
• Facile Total Synthesis of Thailandepsins D–F: Novel Bicyclic Depsipeptide Histone Deacetylase Inhibitors Isolated from a Microorganism
  作者：Tadashi Katoh、Noel Sayar、Koichi Narita

  DOI：10.1055/s-0037-1611707

  日期：2019.3

  Shiina method to construct the requisite 15-member macrocycles. The naturally occurring bicyclic depsipeptide histone deacetylase inhibitors thailandepsins D–F were efficiently synthesized for the first time in 49–61% overall yield over five steps, starting from known amine and carboxylic acid segments. The synthesis includes the condensation of the two known starting materials to directly assemble the

  专用于清富冈教授，同志社女子大学，日本在他70日生日 抽象的 天然存在的双环二肽组蛋白脱乙酰基酶抑制剂Thaiepsins D-F可以从已知的胺和羧酸片段开始，通过五个步骤以49-61％的总收率首次高效合成。合成包括两种已知起始原料的缩合，以直接组装相应的癸二酸，它们是大环内酯化的关键前体。然后使用Shiina方法将癸二酸大环内酯化，以构建必要的15元大环。 天然存在的双环二肽组蛋白脱乙酰基酶抑制剂Thaiepsins D-F可以从已知的胺和羧酸片段开始，通过五个步骤以49-61％的总收率首次高效合成。合成包括两种已知起始原料的缩合，以直接组装相应的癸二酸，它们是大环内酯化的关键前体。然后使用Shiina方法将癸二酸大环内酯化，以构建必要的15元大环。
• Total synthesis of bicyclic depsipeptides spiruchostatins C and D and investigation of their histone deacetylase inhibitory and antiproliferative activities
  作者：Koichi Narita、Yurie Fukui、Yui Sano、Takao Yamori、Akihiro Ito、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1016/j.ejmech.2012.12.023

  日期：2013.2

  The bicyclic depsipeptide histone deacetylase (HDAC) inhibitors spiruchostatins C and D were synthesized for the first time in a highly convergent and unified manner. The method features the amide coupling of a d-leucine–d-cysteine- or d-valine–d-cysteine-containing segment with a d-alanine- or d-valine-containing segment to directly assemble the corresponding seco-acids, key precursors of macrolactonization

  双环二肽组蛋白去乙酰化酶（HDAC）抑制剂spiruchostatins C和D首次以高度收敛和统一的方式合成。该方法采用了酰胺的耦合d -leucine- d -cysteine-或d -valine- d段与含半胱氨酸- d -alanine-或d含缬氨酸段直接组装相应的开环-酸，大内酯化的关键前体。合成的大肽肽的HDAC抑制分析和细胞生长抑制分析确定了螺旋藻抑素A–D与临床批准的大肽肽FK228（romidepsin）相比的效力顺序。揭示了结构-活性关系（SAR）的新颖方面。