allyl (11aS)-8-(benzyloxy)-11-hydroxy-7-methoxy-5-oxo-2,3,11,11a-tetrahydro-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-10(5H)-carboxylate | 550356-50-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: allyl (11aS)-8-(benzyloxy)-11-hydroxy-7-methoxy-5-oxo-2,3,11,11a-tetrahydro-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-10(5H)-carboxylate
• 英文别名: (11aS)-allyl 8-(benzyloxy)-11-hydroxy-7-methoxy-5-oxo-2,3,11,11a-tetrahydro-1H-benzo[e]pyrrolo[1,2-a][1,4]diazepine-10(5H)-carboxylate
• CAS: 550356-50-8
• 化学式: C₂₄H₂₆N₂O₆
• 分子量: 438.48
• InChiKey: PAVWADLCJVROIU-XNUZUHMRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.34
• 重原子数：
  32.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  88.54
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  allyl (11aS)-8-(benzyloxy)-11-hydroxy-7-methoxy-5-oxo-2,3,11,11a-tetrahydro-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-10(5H)-carboxylate 在 palladium on activated charcoal 四氢吡咯 、 四(三苯基膦)钯 、 1,4-环己二烯 、 三苯基膦 作用下， 以 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 4.17h， 生成 (11aS)-7-甲氧基-8-羟基-2,3,5,11ab-四氢-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯并二氮杂卓-5-酮
  参考文献：
  名称：

  Unsymmetrical DNA Cross-Linking Agents:  Combination of the CBI and PBD Pharmacophores

  摘要：

  A set of 10 compounds, each combining the seco-1,2,9,9a-tetrahydrocyclopropa[c]benz[e]indol-4-one (seco-CBI) and pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine (PBD) pharmacophores, was designed and prepared. These compounds were anticipated to cross-link between N3 of adenine and N2 of guanine in the minor groove of DNA. The compounds, which differ in the chain length separating the two alkylation subunits, and the configuration of the CBI portion, showed great variation in cellular toxicity (over 4 orders of magnitude in a cell line panel) with the most potent example exhibiting IC50S in the pM range. Cytotoxicity correlated with the ability of the compounds to cross-link naked DNA. Cross-linking was also observed in living cells, at much lower concentrations than for a related symmetrical PBD dimer. A thermal cleavage assay was used to assess sequence selectivity, demonstrating that the CBI portion controlled the alkylation sites, while the PBD substituent increased the overall efficiency of alkylation. Several compounds were tested for in vivo activity using a tumor growth delay assay against WiDr human colon carcinoma xenografts, with one compound (the most cytotoxic and most efficient cross-linker) showing a statistically significant increase in survival time following a single iv dose.

  DOI：

  10.1021/jm020526p
• 作为产物：
  描述：

  4-苄氧基-3-甲氧基苯甲醛 在 吡啶 、 sodium chlorite 、 sodium dihydrogenphosphate 、 草酰氯 、 2,2,6,6-四甲基哌啶氧化物 、 hydrazine hydrate 、 碘苯二乙酸 、 双氧水 、 硝酸 、 乙酸酐 、 三乙胺 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 氯仿 、 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 10.17h， 生成 allyl (11aS)-8-(benzyloxy)-11-hydroxy-7-methoxy-5-oxo-2,3,11,11a-tetrahydro-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-10(5H)-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  新型 C8-吡咯并苯二氮卓 (PBD) 腺苷缀合物的合成和生物学评价。PBD 环在 PBD 偶联物生物活性中的作用研究

  摘要：

  在这里，我们试图评估 PBD 单元对 PBD 偶联物的生物活性的贡献，为此，将腺苷核苷连接到 PBD A 环 C8 位置。聚合方法被成功用于合成新型 C8 连接的吡咯 (2,1-c)(1,4) 苯并二氮杂 (PBD)-腺苷 (ADN) 杂化物。PBD 和腺苷 (ADN) 部分分别合成，然后通过戊炔基接头连接。据我们所知，这是与核苷相关的 PBD 的第一份报告。令人惊讶的是，该化合物对鼠细胞没有细胞毒性，对金分枝杆菌和牛分枝杆菌菌株无活性，并且不与含鸟嘌呤的 DNA 序列结合，如 DNase I 足迹实验所示。分子动力学模拟表明，PBD-ADN 偶联物在包含 AGA-PBD 结合基序的两个 DNA 序列的 DNA 小沟中的容纳性较差，配体的腺苷部分阻止了 PBD 单元与鸟嘌呤氨基的共价结合DNA双链体。这些有趣的发现进一步阐明了连接在 PBD 的 C8 位置上的取代基影响和调节 PBD 杂交体的生物学和生物物理特性的能力。

  DOI：

  10.3390/molecules25051243