was previously shown to undergo a two site exchange process in the micro- to millisecond time regime. Using proton relaxation dispersion experiments the exchange parameters determined earlier could be recapitulated, thus validating the proposed approach. We further investigated the dynamics of the cTAR DNA, a DNA transcript that is involved in the viral replication cycle of HIV-1. Again, an exchange
在这项工作中,引入了一种改进的核酸稳定同位素标记方案。新颖的构建模块消除/最小化同核 (13) C 和 (1) H 标量耦合,从而允许质子弛豫分散 (RD) 实验准确报告核酸的
化学交换。使用位点特异性 (2) H 和 (13) C 标记,将自旋拓扑引入 DNA 和 RNA 中,使 (1) H 弛豫分散实验能够以简单的方式应用。新型 RNA/DNA 构建模块已成功整合到两种核酸中。先前显示 A 位点 RNA 在微秒至毫秒的时间内经历了两个位点交换过程。使用质子弛豫色散实验,可以概括之前确定的交换参数,从而验证所提出的方法。我们进一步研究了 cTAR DNA 的动力学,cTAR DNA 是一种参与 HIV-1 病毒复制周期的 DNA 转录物。同样,交换过程可以被表征和量化。这显示了新标记方案对于(1)核酸HRD实验的普遍适用性。