2',3'-dihydroxyftorafur | 74259-49-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2',3'-dihydroxyftorafur
• 英文别名: 5-fluoro-1-β-D-erythro-pentofuranosyluracil；1-β-D-erythrofuranosyl-5-fluorouracil；1-(β-D-erythrofuranosyl)-5-fluoroorotic acid；FEU
• CAS: 74259-49-7
• 化学式: C₈H₉FN₂O₅
• 分子量: 232.168
• InChiKey: DXLBHTLMVGZLFO-WYDQCIBASA-N

物化性质

• 密度：
  1.73±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.07
• 重原子数：
  16.0
• 可旋转键数：
  1.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  104.55
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3'-dihydroxyftorafur 在 碳酸二苯酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 生成 5-fluoro-2,2'-anhydro-1-(β-D-threofuranosyl)uracil
  参考文献：
  名称：

  固态和溶液态抗肿瘤药的合成，结构和构象：氟托拉非的羟基衍生物。

  摘要：

  嘧啶抗代谢药Ftorafur [FT; 5-氟-1-（四氢-2-呋喃基）尿嘧啶]在几种腺癌中显示出显着的抗肿瘤活性，其活性谱与5-氟尿嘧啶（5-FU）相似，但毒性较小。它被认为是前药，可以作为5-FU的长效制剂，因此这两种药物表现出相似的化学治疗活性。当将羟基引入四氢呋喃部分时，呋喃糠在动物和人类中代谢。这些代谢物也被认为与氟呋喃一样有活性，但毒性不如5-FU。羟基衍生物：2'-羟基呋喃糠（III），3'-羟基呋喃糠（IV）和2'，3' 合成了-dihydroxyftorafur（II），并在我们的实验室中对这些羟基衍生物进行了X射线和NMR研究，以研究Ftorafur及其代谢物在固体和溶液状态下的结构和构象特征。用在CAD-4衍射仪上收集的数据进行X射线晶体学研究。在PDP 11/34和Microvax计算机上使用Enraf-Nonius的SDP晶体学软件包对结构进行了解析和改进。所有研

  DOI：

  10.1081/ncn-120016611
• 作为产物：
  描述：

  1-(2',3'-di-O-acetyl-β-D-erythrofuranosyl)-5-fluorouracil 在 甲醇 、 sodium methylate 作用下， 以59%的产率得到2',3'-dihydroxyftorafur
  参考文献：
  名称：

  OMP 脱羧酶：磷酸二氢阴离子结合能用于稳定乙烯基碳负离子中间体

  摘要：

  奥罗替丁 5'-单磷酸脱羧酶 (OMPDC) 催化 1-(β-d-赤呋喃糖基)-5-氟尿嘧啶 (FEU) 的 C-6 质子的溶剂 D(2)O 中的氘交换，这是一种磷酸二阴离子截短的产物类似物. FEU 的氘交换反应被 1 M 亚磷酸酯二价阴离子 (HPO(3)(2-)) 加速了 1.8 × 10(4) 倍。这对应于类乙烯基碳负离子过渡态的 5.8 kcal/mol 稳定性，这类似于 OMPDC 催化的结合 HPO(3)(2 -)。这些结果表明，亚磷酸酯二阴离子的固有结合能用于稳定脱羧和氘交换反应中常见的乙烯基碳负离子状过渡态。

  DOI：

  10.1021/ja201734z

文献信息

• Conformational Changes in Orotidine 5′-Monophosphate Decarboxylase: A Structure-Based Explanation for How the 5′-Phosphate Group Activates the Enzyme
  作者：Bijoy J. Desai、B. McKay Wood、Alexander A. Fedorov、Elena V. Fedorov、Bogdana Goryanova、Tina L. Amyes、John P. Richard、Steven C. Almo、John A. Gerlt

  DOI：10.1021/bi301188k

  日期：2012.10.30

  The binding of a ligand to orotidine 5′-monophosphate decarboxylase (OMPDC) is accompanied by a conformational change from an open, inactive conformation (Eo) to a closed, active conformation (Ec). As the substrate traverses the reaction coordinate to form the stabilized vinyl carbanion/carbene intermediate, interactions that destabilize the carboxylate group of the substrate and stabilize the intermediate

  配体与 orotidine 5'-单磷酸脱羧酶 (OMPDC) 的结合伴随着从开放的非活性构象 (E o ) 到封闭的活性构象 (E c ) 的构象变化。当底物穿过反应坐标以形成稳定的乙烯基负碳离子/卡宾中间体时，会加强使底物的羧酸根不稳定并稳定中间体（在 E c ·S ⧧络合物中）的相互作用。关注来自热自养甲烷嗜热杆菌的 OMPDC ，我们发现底物的“远程”5'-磷酸基团激活酶 2.4 × 10 8-折叠; 活化等效地由 11.4 kcal/mol 的固有结合能 (IBE) 描述。我们研究了活化中的残基，(1) 直接接触 5'-磷酸基团，(2) 参与活性位点环底部附近的疏水簇，将结合的底物与溶剂隔离，以及 (3) 形成氢(β/α) 8桶结构的“移动”和“固定”半桶域之间界面的键合相互作用。我们的数据支持一个模型，其中由 5'-磷酸基团提供的 IBE 用于允许在活性位点环的 N 末端附近和跨域界面的相互作用，从而稳定
• Role of a Guanidinium Cation–Phosphodianion Pair in Stabilizing the Vinyl Carbanion Intermediate of Orotidine 5′-Phosphate Decarboxylase-Catalyzed Reactions
  作者：Bogdana Goryanova、Lawrence M. Goldman、Tina L. Amyes、John A. Gerlt、John P. Richard

  DOI：10.1021/bi401117y

  日期：2013.10.22

  with the transition state for the decarboxylation reaction is 50% of the total 11.2 kcal/mol transition state stabilization by interactions with the phosphodianion of OMP, whereas the 7.2 kcal/mol side chain interaction with the transition state for the deuterium exchange reaction is a larger 78% of the total 9.2 kcal/mol transition state stabilization by interactions with the phosphodianion of FUMP

  Arg235 的侧链阳离子为来自酿酒酵母的乳清酸 5'-单磷酸 ( OMP ) 脱羧酶 (OMPDC)的过渡态提供了 5.6 和 2.6 kcal/mol 的稳定性，OMP和 5-氟乳清酸 5'-单磷酸 ( FOMP )催化反应分别为 7.2 kcal/mol 的类乙烯基碳负离子过渡态稳定，用于酶催化交换 5-氟尿苷 5'-单磷酸 ( FUMP )的 C-6 质子，但没有稳定酶的过渡态-截短底物 1-(β- d-赤呋喃糖基)乳清酸和 1-(β- d ) 的催化脱羧-erythrofuranosyl) 5-氟尿嘧啶。这些观察结果表明，过渡态稳定是由蛋白质阳离子-磷酸二价阴离子对的形成引起的，并且侧链和底物嘧啶环之间的相互作用没有可检测到的稳定。5.6 kcal/mol 侧链与脱羧反应过渡态的相互作用是通过与OMP的磷酸二价阴离子相互作用实现的 11.2 kcal/mol 过渡态总稳定性的 50%
• Catalysis by Orotidine 5′-Monophosphate Decarboxylase: Effect of 5-Fluoro and 4′-Substituents on the Decarboxylation of Two-Part Substrates
  作者：Bogdana Goryanova、Krisztina Spong、Tina L. Amyes、John P. Richard

  DOI：10.1021/bi301650d

  日期：2013.1.22

  identical destabilizations of the transition state for the unactivated decarboxylation of 2.9 kcal/mol. By contrast, the 4′-CH3 group of 5′-dFO and the 4′-CH2OH group of orotidine result in very different 4.7 and 8.3 kcal/mol destabilizations of the transition state for the phosphite-activated decarboxylation. Here, the destabilizing effect of the 4′-CH3 substituent at 5′-dFO is masked by the rate-limiting

  据报道，合成了具有增强脱羧反应性的天然底物乳清酸 5'-单磷酸酯 ( OMP )的两种新型截短类似物，用于乳清酸 5'-单磷酸脱羧酶 (OMPDC)：1-(β- d-赤呋喃糖基)-5-氟乳清酸（FEO）和5'-脱氧-5- fluoroorotidine（5 ' -dFO）。OMPDC 催化的FEO (10 M –1 s –1 ) 和 1-(β- d -赤呋喃糖基) 乳清酸 ( EO , 0.026 M –1 s –1 )脱羧的二级速率常数比较) 表明通过与FEO的 5-F 取代基相互作用，乙烯基碳负离子过渡态稳定了 3.5 kcal/mol 。OMPDC 催化的FEO和EO脱羧均被外源性亚磷酸酯二价阴离子 (HPO 3 2– )激活，但 5-F 取代基仅导致FEO亚磷酸酯活化反应的过渡态稳定 0.8 kcal 。这为亚磷酸酯活化的 OMPDC 催化的FEO反应提供了强有力的证据。不受酶结合
• Synthesis and in vivo antitumor activity of potential 5-fluorouracil prodrugs
  作者：A. Rosowsky、S. H. Kim、D. Trites、M. Wick

  DOI：10.1021/jm00351a006

  日期：1982.9