(3R/S)-(1S,4R,7S)-7-benzyloxy-1-benzyloxymethyl-3-(thymin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane | 290348-24-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: (3R/S)-(1S,4R,7S)-7-benzyloxy-1-benzyloxymethyl-3-(thymin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• CAS: 290348-24-2
• 化学式: C₂₅H₂₆N₂O₆
• 分子量: 450.491
• InChiKey: DKVXNJXEAXHEHA-ADYVQIGASA-N

物化性质

• 密度：
  1.35±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.31
• 重原子数：
  33.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  91.78
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (3R/S)-(1S,4R,7S)-7-benzyloxy-1-benzyloxymethyl-3-(thymin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 在 20percent Pd(OH)2/C 吡啶 、 咪唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 ammonium hydroxide 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 silver nitrate 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 323.75h， 生成 (1R,3S,4R,7S)-3-(4-N-benzoyl-5-methylcytosin-1-yl)-1-(4,4'-dimethoxytrityl)oxymethyl-7-(O-2-cyanoethyl-N,N-diisopropylphosphityl)oxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  α-LNA (Locked Nucleic Acid withα-D-Configuration): Synthesis and Selective Parallel Recognition of RNA

  摘要：

  alpha-LNA is presented as a stereoisomer of LNA (locked nucleic acid) with alpha-D-configuration. Three different approaches towards the thymine a-LNA monomer as well as the 5-methylcytosine alpha-LNA monomer are presented. Different alpha-LNA sequences have been synthesised and their hybridisation with complementary DNA and RNA has been evaluated by means of thermal stability experiments and circular dichroism spectroscopy. In a mixed pyrimidine sequence, alpha-LNA displays unprecedented parallel-stranded and selective RNA binding. Furthermore, a remarkable selectivity for hybridisation with RNA over DNA is indicated.

  DOI：

  10.1002/1521-3765(20020201)8:3<712::aid-chem712>3.0.co;2-0
• 作为产物：
  描述：

  1,2-O-(异丙亚基)-4-C-[(苯基甲氧基)甲基]-3-O-(苯基甲基)-beta-L-来苏呋喃糖 在 吡啶 、 盐酸 、 N-溴代丁二酰亚胺(NBS) 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 4 A molecular sieve 、 氨 、 水 、 sodium hydride 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 (3R/S)-(1S,4R,7S)-7-benzyloxy-1-benzyloxymethyl-3-(thymin-1-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  Synthesis and chemoselective activation of phenyl 3,5-di-O-benzyl-2-O,4-C-methylene-1-thio-β-d-ribofuranoside: a key synthon towards α-LNA

  摘要：

  一种双环硫呋喃苷（苯基3,5-二-O-苄基-2-O,4-C-亚甲基-β-D-核糖呋喃苷）被高效合成并作为α-和β-LNA核苷的聚合合成中的关键合成物引入；还描述了相应双环甲基呋喃苷的酸诱导开环反应。

  DOI：

  10.1039/a806817h

文献信息

• α-LNA, locked nucleic acid with α-d-configuration
  作者：Poul Nielsen、Jakob Kragh Dalskov

  DOI：10.1039/b003104f

  日期：——

  The bicyclic thymine monomer of α-LNA (αTL) was efficiently synthesised and used in the synthesis of α-LNA sequences: incorporation of single αTL-monomers in α-configured oligothymidylates destabilises the affinity towards both complementary DNA and RNA, whereas a fully modified α-LNA sequence displays a very efficient recognition of complementary RNA.

  有效合成了α-LNA的双环胸腺嘧啶单体（αTL），并用于合成α-LNA序列：在α-配置的寡胸腺苷酸中加入单个αTL单体会降低对互补DNA和RNA的亲和力，而完全改性的α-LNA序列对互补RNA表现出非常高效的识别能力。