6-(6-Chloro-9-methylacridin-2-yl)oxyhexan-1-ol | 173034-40-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 6-(6-Chloro-9-methylacridin-2-yl)oxyhexan-1-ol
• CAS: 173034-40-7
• 化学式: C₂₀H₂₂ClNO₂
• 分子量: 343.853
• InChiKey: DHHAPDKHYMTXOM-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.2
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  42.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-(6-Chloro-9-methylacridin-2-yl)oxyhexan-1-ol 在 水 作用下， 反应 0.17h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of oligonucleotides labelled with a novel type of chemically stable acridine dye

  摘要：

  Alkoxy derivatives of 6-chloro-2-methoxy-9-methylacridine 1 have been attached to oligonucleotides 6-10. The coupling step may be performed either with phosphoramidite-, H-phosphonate or phosphodiester reagents prepared from 2. This dye, in contrast to 9-aminoacridines, is completely stable under the conditions of oligonucleotide deprotection (NH3 or CH3NH2). The dye conjugates tightly bind to complementary strands and are useful tools in the study of nonenzymatic oligomerizations of ribonucleotides according to L. Orgel.

  DOI：

  10.1016/0040-4039(95)01801-n
• 作为产物：
  描述：

  6-氯-2-甲氧基-9-甲基-吖啶 在 盐酸 、 氢溴酸 、 caesium carbonate 作用下， 以 乙醇 、 水 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 31.0h， 生成 6-(6-Chloro-9-methylacridin-2-yl)oxyhexan-1-ol
  参考文献：
  名称：

  cr啶标记的引物作为研究非酶RNA寡聚化的工具

  摘要：

  短的，染料标记的寡核苷酸已用作RNA的模板控制聚合反应中的引物。描述了合适的a啶衍生物的合成及其与核酸的连接。在2-甲基-1 H-咪唑活化的鸟苷5'-单磷酸的非酶促低聚反应中，有两个发现值得特别注意：（1）反应速度几乎不受Na +浓度变化的影响；（2）引物-模板双链体的构象类型（A对B）对RNA寡聚化的速率和产率具有相当大的影响。在1M Na +或K +存在下研究胞苷的掺入，该过程几乎被oligo-dG模板的四链体形成所抑制。但是，如果省略这些阳离子，则使用高达100μM的模板浓度可以观察到有效的引物延伸。RNA的非酶促自我复制的机会因此可能比以前设想的要好得多。

  DOI：

  10.1002/hlca.19980810528

文献信息

• Hydrolytical Cleavage of TAR-RNA, the<i>trans</i>-Activation Responsive Region of HIV-1, by a Bis(guanidinium) Catalyst Attached to Arginine
  作者：Kristina Kurz、Michael W. Göbel

  DOI：10.1002/hlca.19960790719

  日期：1996.10.30

  Guanidinium compounds imitating the bis(arginine) structural motif of staphylococcal nuclease (e.g.3) are known to be powerful catalysts for phosphoryl transfer reactions in dipolar aprotic solvents. Compound 3 also accelerates the hydrolysis of RNA (H2O, pH 7). However, due to diminished substrate affinity in H2O, the rate effects are less pronounced in aqueous than in aprotic solution. To test if

  已知模仿金黄色葡萄球菌核酸酶（例如3）的双（精氨酸）结构基序的胍盐化合物是在偶极非质子溶剂中进行磷酰基转移反应的有力催化剂。化合物3还促进RNA的水解（H 2 O，pH 7）。然而，由于在H 2 O中底物亲和力的降低，在水溶液中的速率效应不如在非质子溶液中明显。为了测试，如果合成的核糖核酸酶可从的双（胍）部分中得到3通过加入RNA结合子结构，HIV-1的序列TAR被选为靶。化合物4的精氨酸残基作为TAt的极为简化的模仿物，TAt是一种通过与TAR形成复合物来促进病毒转录的蛋白质。在这里，我们介绍4的合成及其结合和有效切割截短的TAR序列1的能力。另外，以初步形式报道了cr啶精氨酸缀合物19的合成。化合物19与1缔合并完全阻断4诱导的裂解。