1-(N(3)-脱氧胞啶基)-2-(N(1)-脱氧鸟苷基)乙烷 | 83008-59-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 中文名称: 1-(N(3)-脱氧胞啶基)-2-(N(1)-脱氧鸟苷基)乙烷
• 中文别名: 5(2H)-嘧啶亚胺
• 英文名称: [1-(3-deoxycytidyl)-2-(1-deoxyguanosinyl)]ethane
• 英文别名: 1-(3-deoxycytidyl) 2-(1-deoxyguanosinyl)ethane；1-[N3-deoxycytidyl]-2-[N1-deoxyguanosyl]ethane；1-DC-DG-E；2-amino-9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1-[2-[3-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-imino-2-oxopyrimidin-1-yl]ethyl]purin-6-one
• CAS: 83008-59-7
• 化学式: C₂₁H₂₈N₈O₈
• 分子量: 520.502
• InChiKey: IJKWEHCJBZGOAD-SWTKMSQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.57
• 拓扑面积：
  223
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3',5'-bis-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2'-deoxyguanosine 在 potassium tert-butylate 、 四丁基氟化铵 、 溶剂黄146 、 甲胺 、 sodium iodide 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 6.68h， 生成 1-(N(3)-脱氧胞啶基)-2-(N(1)-脱氧鸟苷基)乙烷
  参考文献：
  名称：

  KL-50（一种治疗耐药脑癌的候选咪唑四嗪）的作用机制

  摘要：

  异常的 DNA 修复是癌症的一个标志，许多肿瘤表现出 DNA 修复能力下降，从而使它们对基因毒素敏感。在这里，我们证明健康组织和转化组织的不同 DNA 修复能力可用于获得高度选择性的化疗。我们发现新型 N3-(2-氟乙基)咪唑四嗪“KL-50”是一种针对缺乏 DNA 修复蛋白 O 6 -甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶 (MGMT) 的肿瘤的选择性毒素，该蛋白可逆转 O 6 -烷基鸟嘌呤损伤。我们确定 KL-50 通过多步骤过程产生 DNA 链间交联 (ICL)，包括 DNA 烷基化以产生 O 6 -(2-氟乙基)鸟嘌呤 (O 6 FEtG) 损伤，缓慢单分子置换氟化物以形成 N1 ,O 6 -乙醇鸟嘌呤(N1,O 6 EtG)中间体，并通过相邻胞苷开环。 N1,O 6 EtG 形成的缓慢速率使得表达 MGMT 的健康细胞能够在最初的 O 6 FEtG 病变发展为 N1,O 6 EtG 之前逆转它，从而抑制有毒

  DOI：

  10.1021/jacs.3c06483

文献信息

• Quantification of DNA interstrand crosslinks induced by ACNU in NIH/3T3 and L1210 cells using high-performance liquid chromatography/electrospray ionization tandem mass spectrometry
  作者：Lili Li、Lijiao Zhao、Rugang Zhong

  DOI：10.1002/rcm.6800

  日期：2014.3.15

  the clinical treatment of cancer. The cellular toxicity of CENUs is primarily due to induction of DNA interstrand crosslinks (ICLs), which has been characterized as l‐(3‐deoxycytidyl), 2‐(l‐deoxyguanosinyl)ethane (dG‐dC). However, the formation of dG‐dC crosslinks can be prevented by O6‐alkylguanine‐DNA alkyltransferase (AGT), which removes the O6‐chloroethyl group from O6‐chloroethylguanine (O6‐ClEt‐Gua)

  氯乙基亚硝基脲（CENU）是用于临床治疗癌症的重要烷基化剂。CENUs的细胞毒性主要归因于DNA间链交联（ICL）的诱导，其特征为1-（3-脱氧胞苷），2-（1-脱氧鸟苷基）乙烷（dG-dC）。然而，DG-DC交联的形成可以被O防止6 -alkylguanine-DNA烷基（AGT），其去除将O 6选自O氯乙基组6 -chloroethylguanine（O 6 -ClEt卦），并最终增加其表达可能导致耐药性。AGT表达水平的不同可能导致dG-dC交联量的变化，从而影响细胞对CENU的敏感性。
• Comparative investigation of the DNA inter-strand crosslinks induced by ACNU, BCNU, CCNU and FTMS using high-performance liquid chromatography–electrospray ionization tandem mass spectrometry
  作者：Lijiao Zhao、Lili Li、Jie Xu、Rugang Zhong

  DOI：10.1016/j.ijms.2014.04.018

  日期：2014.7

  exert cytotoxicity by inducing DNA interstrand crosslinks (ICLs) between guanine and the complimentary cytosine, namely dG–dC crosslink. Many investigations have been performed on the DNA ICLs involved in the anticancer efficacy of CENUs, but no conclusive comparisons between these agents have been published. In this work, the levels of dG–dC crosslink in calf thymus DNA induced by four CENUs, including

  摘要 氯乙基亚硝基脲 (CENU) 是用于癌症临床治疗的重要烷化剂家族。它们通过诱导鸟嘌呤和互补胞嘧啶之间的 DNA 链间交联 (ICL)，即 dG-dC 交联来发挥细胞毒性。已经对参与 CENU 抗癌功效的 DNA ICL 进行了许多研究，但尚未发表这些药物之间的结论性比较。在这项工作中，使用 HPLC-ESI-MS 定量测定了由四种 CENU 诱导的小牛胸腺 DNA 中的 dG-dC 交联水平，包括尼莫司汀 (ACNU)、卡莫司汀 (BCNU)、洛莫司汀 (CCNU) 和福莫司汀 (FTMS) /小姐。获得的 dG-dC 交联水平的时间过程表明，在 BCNU 和 CCNU 处理的初始阶段存在一个交联活性非常低的诱导期。诱导期为假定的机制提供了令人信服的证据，即 dG-dC 交联的形成是由鸟嘌呤的单烷基化开始的，然后是互补胞嘧啶的第二次烷基化。ACNU 的交联活性在所有时间点均显着高于 BCNU、CCNU
• Quantification of meCCNU-induced dG-dC crosslinks in oligonucleotide duplexes by liquid chromatography/electrospray ionization tandem mass spectrometry
  作者：Baoqing Bai、Lijiao Zhao、Rugang Zhong

  DOI：10.1002/rcm.5064

  日期：2011.7.30

  widely used in the treatment of cancers. Decomposition of CENUs generates active electrophilic ions that damage DNA, including the formation of dG‐dC crosslinks which represents the most important cytotoxic mechanism of CENUs. In this work, a high‐performance liquid chromatography/electrospray ionization tandem mass spectrometry (HPLC/ESI‐MS/MS) method was employed to analyze the dG‐dC crosslinks induced

  氯甲状腺亚硝基脲（CENU）是重要的烷基化剂，广泛用于治疗癌症。CENU的分解会产生活性亲电子离子，从而破坏DNA，包括dG-dC交联的形成，这是CENU最重要的细胞毒性机制。在这项工作中，采用了高效液相色谱/电喷雾电离串联质谱（HPLC / ESI-MS / MS）方法来分析由1-（2-氯乙基）-3-（4-甲基环己基）-1-亚硝基脲（meCCNU，Semustine）。寡核苷酸双链体中dG-dC交联的直接定量是通过使用合成的15 N 3选择反应监测（SRM）模式实现的标有dG-dC作为内部标准。开发了酶消化和HPLC分离的方法来获得色谱图中dG-dC峰的分离和重现性。检测限（LOD）被确定为0.08 nM，定量限（LOQ）被确定为0.16 nM。在0.08至32 nM的范围内，校准曲线的线性度为0.9997。该方法的精密度和准确度分别为1.1％至6.6％和96％至109％。从寡核苷酸双链