6-deoxy-6-fluoro-α,α-D-trehalose | 67693-23-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 6-deoxy-6-fluoro-α,α-D-trehalose
• 英文别名: 6-deoxy-6-fluoro-α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside；6-Deoxy-6-fluoro-alpha,alpha-D-trehalose；(2R,3R,4S,5S,6R)-2-[(2R,3R,4S,5S,6S)-6-(fluoromethyl)-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]oxy-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
• CAS: 67693-23-6
• 化学式: C₁₂H₂₁FO₁₀
• 分子量: 344.291
• InChiKey: NFLGFYKQVSDQKR-LIZSDCNHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.7
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-deoxy-6-fluoro-α,α-D-trehalose 、 uridine-5'-diphosphoglucose 在 Thermoproteus uzoniensis trehalose transferase 、 magnesium chloride 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 6-氟-6-脱氧-d-吡喃葡萄糖
  参考文献：
  名称：

  海藻糖转移酶与稀有l-糖的端粒选择性。

  摘要：

  保留LeLoir糖基转移酶可催化核苷酸糖供体和碳水化合物受体之间糖苷键的形成。研究了对于d-和l- glycopyranose受体，来自uzoniensis的Thermoproteus uzoniensis的海藻糖转移酶的异头选择性。该酶偶联多种碳水化合物，产生海藻糖类似物，其转化率和对映选择性> 98％。从α异头选择性反转，α-（1→1） -糖苷键d -glycopyranose受体到α，β-（1→1） -糖苷键为升-glycopyranose受体，而（小号两种糖受体的选择性都保留下来。比较海藻糖转移酶与α，α-海藻糖和非天然α，β-海藻糖类似物的蛋白质晶体结构，突出了观察到的异头选择性逆转的机理。

  DOI：

  10.1021/acscatal.0c02117
• 作为产物：
  描述：

  海藻糖 在 咪唑 、 甲醇 、 4-二甲氨基吡啶 、 二乙胺基三氟化硫 、 sodium methylate 、 乙酰氯 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.66h， 生成 6-deoxy-6-fluoro-α,α-D-trehalose
  参考文献：
  名称：

  [EN] DETECTION OF MYCOBACTERIA
  [FR] DÉTECTION DE MYCOBACTÉRIES

  摘要：

  一种用于确定生物体或生物样本中结核分枝杆菌种类存在的方法，该方法包括向生物体或生物样本中添加一种探针分子，该探针分子包括底物和标记，该探针分子可以被结核分枝杆菌所吸收，通过对标记的存在做出反应的探测器确定结核分枝杆菌的存在，可选地，在施加刺激后进行；适用的探针分子包括包含标记和底物的化合物，该标记可以被对标记的存在做出反应的探测器检测到，可选地，在施加刺激后进行，其特征在于该化合物能够与抗原85B（Ag85B）的活性位点结合，从而能够与所选活性位点中的两个或更多氨基酸同时形成氢键，所选活性位点包括Arg 43、Trp 264、Ser126、His 262和Leu 42，或者抗原85A（Ag85A）或抗原85C（Ag85C）中对应的氨基酸，其中至少一个与Ser126形成氢键。

  公开号：

  WO2011030160A1

文献信息

• Chemoenzymatic Synthesis of Trehalose Analogues: Rapid Access to Chemical Probes for Investigating Mycobacteria
  作者：Bailey L. Urbanek、Douglas C. Wing、Krystal S. Haislop、Chelsey J. Hamel、Rainer Kalscheuer、Peter J. Woodruff、Benjamin M. Swarts

  DOI：10.1002/cbic.201402288

  日期：2014.9.22

  Trehalose tools for TB: A one‐step chemoenzymatic method for the rapid and efficient synthesis of trehalose analogues was developed. This method enabled facile preparation and administration of a trehalose‐based probe for detecting mycobacteria, which might enable the development of new diagnostic tools for tuberculosis (TB) research.

  用于结核病的海藻糖工具：开发了一种用于快速有效合成海藻糖类似物的一步化学酶法。这种方法使得可以方便地制备和使用基于海藻糖的探针来检测分枝杆菌，这可能有助于开发用于结核病（TB）研究的新诊断工具。
• The trehalose-specific transporter LpqY-SugABC is required for antimicrobial and anti-biofilm activity of trehalose analogues in Mycobacterium smegmatis
  作者：Jeffrey M. Wolber、Bailey L. Urbanek、Lisa M. Meints、Brent F. Piligian、Irene C. Lopez-Casillas、Kailey M. Zochowski、Peter J. Woodruff、Benjamin M. Swarts

  DOI：10.1016/j.carres.2017.08.003

  日期：2017.10

  synthesized using our previously reported one-step chemoenzymatic method and shown to inhibit growth and biofilm formation in the two-to three-digit micromolar range in Mycobacterium smegmatis. The trehalose-specific ABC transporter LpqY-SugABC was essential for antimicrobial and anti-biofilm activity, suggesting that inhibition by monosubstituted trehalose analogues requires cellular uptake and does not proceed

  分枝杆菌，包括引起人类结核的细菌病原体，具有合成和利用非哺乳动物二糖海藻糖的独特途径。海藻糖代谢对于分枝杆菌的生存能力是必不可少的，并且已与体外生物膜形成相关，而体外生物膜形成可能与体内药物耐受性有关。先前的研究表明，某些在6位带有修饰的海藻糖类似物会抑制各种分枝杆菌的生长。在这项工作中，使用我们先前报道的一步化学酶法合成了2位，5位和6位修饰的海藻糖类似物，并显示在耻垢分枝杆菌的2至3位数微摩尔范围内抑制生长和生物膜形成。 。海藻糖特异性ABC转运蛋白LpqY-SugABC对于抗菌和抗生物膜活性至关重要，这表明单取代海藻糖类似物的抑制作用需要细胞摄取，并且不会通过对细胞外靶标如抗原85酰基转移酶或海藻糖二甲酸酯水解酶的直接作用而继续进行。尽管上述化合物在体外生长和生物膜测定中的效力适中，但该研究报道了首批基于海藻糖的分枝杆菌生物膜抑制剂，并强化了利用独特糖吸收途径将抑制剂和其他化学物质输
• DETECTION OF MYCOBACTERIA
  申请人：Backus Keriann Marie

  公开号：US20120263649A1

  公开（公告）日：2012-10-18

  A method for determining the presence of mycobacteria species in an organism or biological sample, the method comprising adding to the organism or biological sample a probe molecule comprising a substrate and a label, which probe molecule can be incorporated into mycobacteria, the presence of mycobacteria being determined by a detector responsive to the presence of the label, optionally after applying a stimulus; suitable probe molecules include compounds comprising a label and a substrate, which label is can be detected by a detector responsive to the presence of the label, optionally after applying a stimulus, characterised by compound being able to engage with the active site of Antigen 85B (Ag85B) such that it can form simultaneous hydrogen bonds with two or more amino acids in the active site selected from Arg 43, Trp 264, Ser126, His 262 and Leu 42, or the corresponding amino acids in Antigen 85A (Ag85A) or Antigen 85C (Ag85C), at least one of which is with Ser126.

  一种用于确定生物体或生物样本中结核分枝杆菌物种存在的方法，该方法包括向生物体或生物样本中添加一种探针分子，该探针分子包括底物和标签，该探针分子可以被结核分枝杆菌所包含，通过对响应标签存在的探测器进行检测来确定结核分枝杆菌的存在，可选地，在施加刺激后进行检测；适当的探针分子包括包含标签和底物的化合物，该标签可以被响应标签存在的探测器检测到，可选地，在施加刺激后进行检测，其特征在于该化合物能够与抗原85B（Ag85B）的活性位点发生作用，使其能够与活性位点中的Arg 43、Trp 264、Ser126、His 262和Leu 42中选择的两个或更多氨基酸同时形成氢键，或与抗原85A（Ag85A）或抗原85C（Ag85C）中的相应氨基酸形成氢键，其中至少有一个与Ser126形成氢键。
• [EN] DETECTION OF MYCOBACTERIA<br/>[FR] DÉTECTION DE MYCOBACTÉRIES
  申请人：ISIS INNOVATION

  公开号：WO2011030160A1

  公开（公告）日：2011-03-17

  A method for determining the presence of mycobacteria species in an organism or biological sample, the method comprising adding to the organism or biological sample a probe molecule comprising a substrate and a label, which probe molecule can be incorporated into mycobacteria, the presence of mycobacteria being determined by a detector responsive to the presence of the label, optionally after applying a stimulus; suitable probe molecules include compounds comprising a label and a substrate, which label is can be detected by a detector responsive to the presence of the label, optionally after applying a stimulus, characterised by compound being able to engage with the active site of Antigen 85B (Ag85B) such that it can form simultaneous hydrogen bonds with two or more amino acids in the active site selected from Arg 43, Trp 264, Ser126, His 262 and Leu 42, or the corresponding amino acids in Antigen 85A (Ag85A) or Antigen 85C (Ag85C), at least one of which is with Ser126.

  一种用于确定生物体或生物样本中结核分枝杆菌种类存在的方法，该方法包括向生物体或生物样本中添加一种探针分子，该探针分子包括底物和标记，该探针分子可以被结核分枝杆菌所吸收，通过对标记的存在做出反应的探测器确定结核分枝杆菌的存在，可选地，在施加刺激后进行；适用的探针分子包括包含标记和底物的化合物，该标记可以被对标记的存在做出反应的探测器检测到，可选地，在施加刺激后进行，其特征在于该化合物能够与抗原85B（Ag85B）的活性位点结合，从而能够与所选活性位点中的两个或更多氨基酸同时形成氢键，所选活性位点包括Arg 43、Trp 264、Ser126、His 262和Leu 42，或者抗原85A（Ag85A）或抗原85C（Ag85C）中对应的氨基酸，其中至少一个与Ser126形成氢键。
• Anomeric Selectivity of Trehalose Transferase with Rare <scp>l</scp>-Sugars
  作者：Luuk Mestrom、Stefan R. Marsden、Hessel van der Eijk、Jesper U. Laustsen、Cy M. Jeffries、Dmitri I. Svergun、Peter-Leon Hagedoorn、Isabel Bento、Ulf Hanefeld

  DOI：10.1021/acscatal.0c02117

  日期：2020.8.7

  glycosyltransferases catalyze the formation of glycosidic bonds between nucleotide sugar donors and carbohydrate acceptors. The anomeric selectivity of trehalose transferase from Thermoproteus uzoniensis was investigated for both d- and l-glycopyranose acceptors. The enzyme couples a wide range of carbohydrates, yielding trehalose analogues with conversion and enantioselectivity of >98%. The anomeric selectivity inverts

  保留LeLoir糖基转移酶可催化核苷酸糖供体和碳水化合物受体之间糖苷键的形成。研究了对于d-和l- glycopyranose受体，来自uzoniensis的Thermoproteus uzoniensis的海藻糖转移酶的异头选择性。该酶偶联多种碳水化合物，产生海藻糖类似物，其转化率和对映选择性> 98％。从α异头选择性反转，α-（1→1） -糖苷键d -glycopyranose受体到α，β-（1→1） -糖苷键为升-glycopyranose受体，而（小号两种糖受体的选择性都保留下来。比较海藻糖转移酶与α，α-海藻糖和非天然α，β-海藻糖类似物的蛋白质晶体结构，突出了观察到的异头选择性逆转的机理。