5'-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]-2-[(dimethylamino)methylidene]guanosine | 160905-87-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 5'-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]-2-[(dimethylamino)methylidene]guanosine
• 英文别名: N'-[9-[(2R,3R,4S,5R)-5-[[tert-butyl(diphenyl)silyl]oxymethyl]-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]-6-oxo-1H-purin-2-yl]-N,N-dimethylmethanimidamide
• CAS: 160905-87-3
• 化学式: C₂₉H₃₆N₆O₅Si
• 分子量: 576.728
• InChiKey: ASWOOPFLPMSXIA-VBHAUSMQSA-N

物化性质

• 密度：
  1.30±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.54
• 重原子数：
  41
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]-2-[(dimethylamino)methylidene]guanosine 在 palladium on activated charcoal sodium hydroxide 、 氨 、 水 、 ammonium formate 、 sodium hydride 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 溶剂黄146 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 167.5h， 生成 3'-氨基-3'-脱氧鸟苷
  参考文献：
  名称：

  由鸟苷有效合成3'-氨基-3'-脱氧鸟苷

  摘要：

  由鸟苷经八步合成3'-氨基-3'-脱氧鸟苷，总产率为58％。使5'- O -[（叔丁基）二苯基甲硅烷基] -2- N -[（二甲基氨基）亚甲基]鸟苷的2'，3'-二醇与α-乙酰氧基异丁酰溴反应，并用0.5n NH 3的MeOH溶液处理得到9- {2' - O-乙酰基-3'-溴-5'- O -[（叔丁基）二苯基甲硅烷基] -3'-脱氧-β -D-呋喃呋喃糖基] -2- N -[（二甲基氨基）亚甲基]鸟嘌呤，将其与异氰酸苄酯，NaH，然后与3.0n NaOH反应，最后与Pd / C（10％）和HCO 2 NH 4反应 在EtOH / AcOH中溶解得到3′-氨基-3′-脱氧鸟苷。

  DOI：

  10.1002/hlca.200390069
• 作为产物：
  描述：

  鸟苷 以 乙腈 为溶剂， 生成 5'-O-[(tert-butyl)diphenylsilyl]-2-[(dimethylamino)methylidene]guanosine
  参考文献：
  名称：

  由腺苷和鸟苷有效合成受保护的3'-脱氧腺苷和3'-脱氧鸟苷

  摘要：

  描述了由腺苷和鸟苷高效合成保护的3'-脱氧腺苷和3'-脱氧鸟苷。2'，3'-二醇保护的腺苷和鸟苷，用α-乙酰氧基异丁酰溴反应，得到9-（2'- ø -乙酰基3'-溴-5'- ø -叔-butyldiphenylsilyl -3'-脱氧-β-d呋喃木糖基）-6- ñ -苯甲酰基腺嘌呤和9-（2'- ø -乙酰基3'-溴-5'- ø -叔-butyldiphenylsilyl -3'-脱氧-β-d呋喃木糖基） -2- ñ - （ñ '，ñ '-dimethylaminomethylene）鸟嘌呤，随后用三-加热ñ-丁基氢化锡在2,2'-偶氮二异丁腈的存在下，以全部收率提供66-73％的受保护的3'-脱氧腺苷和3'-脱氧鸟苷。

  DOI：

  10.1016/s0040-4039(00)02041-4

文献信息

• [EN] SYNTHETIC PGPG ANALOGS, METHODS OF PREPARATION AND METHODS OF USE<br/>[FR] ANALOGUES DE PGPG SYNTHÉTIQUES, LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET LEURS PROCÉDÉS D'UTILISATION
  申请人：UNIV TEMPLE

  公开号：WO2013192078A1

  公开（公告）日：2013-12-27

  The present invention relates to compounds according to Formula I: and salts thereof, wherein R1, R2, R3, R4, and L are as defined herein. Methods for preparing compounds of Formula I are also provided. The present invention further includes methods of treating and preventing bacterial infections, and methods of identifying pGpG-binding domains in bacteria, using the compounds of Formula I.

  本发明涉及按照以下式I的化合物及其盐，其中R1、R2、R3、R4和L如本文所定义。还提供了制备式I化合物的方法。本发明还包括使用式I化合物治疗和预防细菌感染的方法，以及识别细菌中pGpG结合结构域的方法。
• Stereoselective and Divergent Aza-Adenosine and Aza-Guanosine Syntheses from Xylofuranose, the Key Fragments of a STING Cyclic Dinucleotide Agonist
  作者：Changxia Yuan、Adrian Ortiz、Zhongmin Xu、Jason Zhu、Michael A. Schmidt、Amanda Rogers、Martin Eastgate

  DOI：10.1021/acs.joc.1c00984

  日期：2022.2.18

  The stereoselective and divergent synthesis of two aza-nucleosides is reported. Starting from xylofuranose 9, aza-adenosine 2 was prepared in 13 steps and 7% overall yield, and aza-guanosine 3 was prepared in 13 steps and 7.8% overall yield. Compared to the original syntheses, some advantages of these new routes are significant yield improvement, overall step-count reduction, an optimized protecting

  报道了两种氮杂核苷的立体选择性和发散合成。从木呋喃糖9开始，氮杂腺苷2的制备分 13 步，总产率为 7%，氮杂鸟苷3的制备分 13 步，总产率为 7.8%。与原始合成相比，这些新路线的一些优点是显着提高产量、减少整体步数、优化保护基策略、开发用于含氮碱基掺入的多功能平台以及消除有害试剂（例如苄基异氰酸酯，Et 3 N·HF)。
• Sproat, Brian S.; Beijer, Barbro; Groetli, Morten, Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1994, # 4, p. 419 - 432
  作者：Sproat, Brian S.、Beijer, Barbro、Groetli, Morten、Ryder, Ursula、Morand, Kenneth L.、Lamond, Angus I.

  DOI：——

  日期：——
• Preparation of fluorinated RNA nucleotide analogs potentially stable to enzymatic hydrolysis in RNA and DNA polymerase assays
  作者：Anton Shakhmin、John-Paul Jones、Inessa Bychinskaya、Mikhail Zibinsky、Keriann Oertell、Myron F. Goodman、G.K. Surya Prakash

  DOI：10.1016/j.jfluchem.2014.07.019

  日期：2014.11

  Analogs of ribonucleotides (RNA) stable to enzymatic hydrolysis were prepared and characterized. Computational investigations revealed that this class of compounds with a modified triphosphate exhibits the correct polarity and minimal steric effects compared to the natural molecule. Non-hydrolysable properties as well as the ability of the modified nucleotide to be recognized by enzymes were probed by performing single-turnover gap filling assays with T7 RNA polymerase and DNA polymerase beta. (C) 2014 Elsevier B.V. All rights reserved.
• Efficient synthesis of protected 3′-deoxyadenosine and 3′-deoxyguanosine from adenosine and guanosine
  作者：Zhiyong Cui、Lei Zhang、Biliang Zhang

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)02041-4

  日期：2001.1

  Highly efficient synthesis of protected 3′-deoxyadenosine and 3′-deoxyguanosine from adenosine and guanosine were described. The 2′,3′-diol of protected adenosine and guanosine were reacted with α-acetoxyisobutyryl bromide to yield 9-(2′-O-acetyl-3′-bromo-5′-O-tert-butyldiphenylsilyl-3′-deoxy-β-d-xylofuranosyl)-6-N-benzoyl adenine and 9-(2′-O-acetyl-3′-bromo-5′-O-tert-butyldiphenylsilyl-3′-deoxy-β

  描述了由腺苷和鸟苷高效合成保护的3'-脱氧腺苷和3'-脱氧鸟苷。2'，3'-二醇保护的腺苷和鸟苷，用α-乙酰氧基异丁酰溴反应，得到9-（2'- ø -乙酰基3'-溴-5'- ø -叔-butyldiphenylsilyl -3'-脱氧-β-d呋喃木糖基）-6- ñ -苯甲酰基腺嘌呤和9-（2'- ø -乙酰基3'-溴-5'- ø -叔-butyldiphenylsilyl -3'-脱氧-β-d呋喃木糖基） -2- ñ - （ñ '，ñ '-dimethylaminomethylene）鸟嘌呤，随后用三-加热ñ-丁基氢化锡在2,2'-偶氮二异丁腈的存在下，以全部收率提供66-73％的受保护的3'-脱氧腺苷和3'-脱氧鸟苷。