N6-butyladenosine | 23096-10-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N6-butyladenosine
• 英文别名: N⁶-(n-Butyl)adenosine；6-(n-butylamino)-9-(β-D-ribosyl)-purine；(2R,3R,4S,5R)-2-[6-(butylamino)purin-9-yl]-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol
• CAS: 23096-10-8
• 化学式: C₁₄H₂₁N₅O₄
• 分子量: 323.352
• InChiKey: YJRFEVRDDAASMO-IDTAVKCVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  126
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N6-butyladenosine 在 吡啶 、 三氯氧磷 作用下， 以 水 、 乙腈 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N6-butyl-[5']adenylic acid
  参考文献：
  名称：

  物种或同工酶特异性酶抑制剂。4.设计具有同工酶选择性的腺苷酸激酶的两位抑制剂。

  摘要：

  DOI：

  10.1021/jm00348a006
• 作为产物：
  描述：

  2’,3’,5’-三乙酰肌苷 在 氯化亚砜 、 sodium methylate 、 calcium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 N6-butyladenosine
  参考文献：
  名称：

  大肠杆菌的核苷转运蛋白NupC和NupG：配体结合所必需的特定结构基序。

  摘要：

  测试了一系列46种天然核苷和类似物（主要是基于腺苷的）作为从大肠杆菌中富集的，与H（+）连接的核苷转运蛋白NupC和NupG吸收[U-（14）C]尿苷的抑制剂。这两个在进化上不相关的转运蛋白显示出相似但不同的抑制模式，揭示了对不同核苷及其类似物的不同选择性。核苷与NupG的结合需要在核糖的C-3'和C-5'位置分别存在羟基，而与NupC的结合仅需要C-3'羟基取代基。核糖部分对于结合NupG的重要性更高，与该蛋白质和寡糖之间的进化关系一致：运输者的主要促进者超家族（MFS）的H（+）同向转运蛋白（OHS）亚家族。对于两种蛋白质，C-3'处的天然α-构型和C-1'处的天然β-构型对于配体结合都是必需的。发现腺苷的咪唑环中的N-7和C-6的氨基对于结合并不重要，并且两个转运蛋白都显示出C-6 / N取代的灵活性。N-1和N-3中的一个或两个对腺苷类似物与NupC的结合很重要，但对NupG的结合

  DOI：

  10.1039/b414739a

文献信息

• Synthesis and Structure–Activity Relationship Investigation of Adenosine-Containing Inhibitors of Histone Methyltransferase DOT1L
  作者：Justin L. Anglin、Lisheng Deng、Yuan Yao、Guobin Cai、Zhen Liu、Hong Jiang、Gang Cheng、Pinhong Chen、Shuo Dong、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/jm300917h

  日期：2012.9.27

  Histone3-lysine79 (H3K79) methyltransferase DOT1L has been found to be a drug target for acute leukemia with MLL (mixed lineage leukemia) gene translocations. A total of 55 adenosine-containing compounds were designed and synthesized, among which several potent DOT1L inhibitors were identified with Ki values as low as 0.5 nM. These compounds also show high selectivity (>4500-fold) over three other histone methyltransferases

  组蛋白 3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 已被发现是具有 MLL（混合谱系白血病）基因易位的急性白血病的药物靶点。总共设计和合成了 55 种含腺苷的化合物，其中鉴定了几种有效的 DOT1L 抑制剂，K i值低至 0.5 nM。与其他三种组蛋白甲基转移酶相比，这些化合物还显示出高选择性（> 4500 倍）。讨论了这些化合物对 DOT1L 的抑制活性的构效关系 (SAR)。强效 DOT1L 抑制剂对 MLL 易位白血病细胞系 MV4;11 和 THP1 的增殖具有选择性活性，EC 504–11 μM 的值。等温滴定量热研究表明，两种代表性抑制剂以高亲和力与 DOT1L:核小体复合物结合，仅与酶辅因子 SAM（S-腺苷-1-甲硫氨酸）竞争，而不与底物核小体竞争。
• Design of Allele-Specific Protein Methyltransferase Inhibitors
  作者：Qing Lin、Fanyi Jiang、Peter G. Schultz、Nathanael S. Gray

  DOI：10.1021/ja011423j

  日期：2001.11.1

  methylation of Npl3p, a known in vivo Rmt1 substrate, could be moderately reduced by N(6)-naphthylmethyl-SAH in the resulting allele. In addition, an N(6)-benzyl-SAM analogue was found to serve as an orthogonal SAM cofactor. This analogue is preferentially utilized by the mutant methyltransferase relative to the wild-type enzyme with a selectivity greater than 67. This specific enzyme/inhibitor and enzyme/substrate

  蛋白质精氨酸甲基转移酶催化甲基从 S-腺苷甲硫氨酸 (SAM) 转移到靶蛋白中的精氨酸侧链，调节转录、RNA 加工和受体介导的信号传导。为了专门解决该家族各个成员的功能作用，我们采用了“凹凸洞”的方法，并设计了一系列针对酵母蛋白的 N(6)-取代的 S-腺苷高半胱氨酸 (SAH) 类似物甲基转移酶 RMT1。在 Rmt1 中发现了一个点突变 (E117G)，这使得该酶容易受到 SAH 类似物的选择性抑制。基于质谱的酶分析表明，N(6)-苄基-和 N(6)-萘甲基-SAH 两种化合物可以抑制突变酶，选择性大于 20。当 E117G 突变被引入酿酒酵母染色体时，Npl3p（一种已知的体内 Rmt1 底物）的甲基化可以通过 N(6)-萘基甲基-SAH 在所得等位基因中适度降低。此外，发现 N(6)-苄基-SAM 类似物可作为正交 SAM 辅因子。相对于选择性大于 67 的野生型酶，这种类似物优先
• N6-Alkyladenosines: Synthesis and evaluation of in vitro anticancer activity
  作者：Roberta Ottria、Silvana Casati、Erika Baldoli、Jeanette A.M. Maier、Pierangela Ciuffreda

  DOI：10.1016/j.bmc.2010.09.030

  日期：2010.12

  between structure and biological activity of iPA. The structures of the compounds were confirmed by standard studies of 1H NMR, MS and elemental analysis. These molecules were then evaluated for their anti-proliferative activity on bladder cancer cells. We found that some of these compounds possess anti-proliferative activity but have no effect on cell invasion and metalloprotease activity.

  合成了一系列在N 6位上不同取代的腺苷类似物，以继续我们对iPA的结构与生物学活性之间关系的研究。化合物的结构通过1 H NMR，MS和元素分析的标准研究确认。然后评估这些分子对膀胱癌细胞的抗增殖活性。我们发现其中一些化合物具有抗增殖活性，但对细胞侵袭和金属蛋白酶活性没有影响。
• N6-isopentenyladenosine a new potential anti-angiogenic compound that targets human microvascular endothelial cells <i>in vitro</i>
  作者：Sara Castiglioni、Valentina Romeo、Silvana Casati、Roberta Ottria、Cristiana Perrotta、Pierangela Ciuffreda、Jeanette A. M. Maier

  DOI：10.1080/15257770.2018.1503673

  日期：2018.10.3

  significant reduction of cell viability, upregulated p21 and promoted caspase-3 cleavage in a dose dependent manner leading to apoptotic cell death as detected by FACS analysis. To understand structure-function relationship of N6-isopentenyladenosine, we investigated the effect of some N6-isopentenyladenosine analogs. Our results suggest that N6-isopentenyladenosine and some of its derivatives are potentially

  摘要 N6-异戊烯基腺苷是一种对正常细胞和肿瘤细胞具有抗增殖和促凋亡作用的非典型核苷。考虑到血管生成在各种疾病中的作用，我们研究了 N6-异戊烯基腺苷对人微血管内皮细胞（血管生成的主角）的细胞毒作用。我们的结果表明，N6-异戊烯基腺苷以剂量依赖性方式诱导细胞活力的显着降低，上调 p21 并促进 caspase-3 切割，导致 FACS 分析检测到的细胞凋亡。为了了解 N6-异戊烯基腺苷的结构-功能关系，我们研究了一些 N6-异戊烯基腺苷类似物的作用。
• Flow-Synthesis of Nucleosides Catalyzed by an Immobilized Purine Nucleoside Phosphorylase from<i>Aeromonas hydrophila</i>: Integrated Systems of Reaction Control and Product Purification
  作者：Enrica Calleri、Giulia Cattaneo、Marco Rabuffetti、Immacolata Serra、Teodora Bavaro、Gabriella Massolini、Giovanna Speranza、Daniela Ubiali

  DOI：10.1002/adsc.201500133

  日期：2015.8.10

  A purine nucleoside phosphorylase from Aeromonas hydrophyla (AhPNP) was covalently immobilized in a pre‐packed stainless steel column containing aminopropylsilica particles via Schiff base chemistry upon glutaraldehyde activation. The resulting AhPNP‐IMER (Immobilized Enzyme Reactor, immobilization yield ≈50%) was coupled on‐line through a 6‐way switching valve to an HPLC apparatus containing an analytical

  戊二醛活化后，通过席夫碱化学将水合气单胞菌（Ah PNP）的嘌呤核苷磷酸化酶共价固定在预先包装的含有氨基丙基二氧化硅颗粒的不锈钢柱中。所得的Ah PNP-IMER（固定化酶反应器，固定化率≈50％）通过六通切换阀在线连接至包含分析或半制备色谱柱的HPLC设备。通过将反应混合物连续泵送通过Ah进行5种6-修饰的嘌呤核糖核苷的合成PNP-IMER，直到达到最高转化率，然后将反应混合物进行色谱分离。通过分数阶乘实验设计优化了Ah PNP催化转糖基化的条件（糖供体：碱基受体的比例为2：1 ; 10 mM磷酸盐缓冲液; pH 7.5;温度37°C，流速0.5 mL min -1）。在这种集成平台上将生物转化步骤与产品纯化相结合，可实现快速有效的合成过程（收率= 52–89％； <10 mg），从而最大限度地减少了样品处理。迄今为止，Ah PNP-IMER在10个月内进行了50次反应后完全保留了其活性。