methyl cis-3-hydroxy-4,5-epoxycyclohex-1-enecarboxylate | 76985-84-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: methyl cis-3-hydroxy-4,5-epoxycyclohex-1-enecarboxylate
• 英文别名: methyl (3R,4R,5S)-4,5-epoxy-3-hydroxy-1-cyclohexene-1-carboxylate；methyl shikimate epoxide；(-)-methyl (1β,2α,6β)-2-hydroxy-7-oxabicyclo<4,1,0>hept-3-ene-4-carboxylate；(3S,4R,5R)-methyl 4,5-epoxy-3-hydroxycyclohex-1-enecarboxylate；(1S,5R,6R)-methyl 5-hydroxy-7-oxa-bicyclo[4.1.0]hept-3-ene-3-carboxylate；methyl (1S,5R,6R)-5-hydroxy-7-oxabicyclo[4.1.0]hept-3-ene-3-carboxylate
• CAS: 76985-84-7
• 化学式: C₈H₁₀O₄
• 分子量: 170.165
• InChiKey: UKLBIZOAVHVYIC-DSYKOEDSSA-N

物化性质

• 沸点：
  303.9±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.393±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  12
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  59.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl cis-3-hydroxy-4,5-epoxycyclohex-1-enecarboxylate 在 水 、 溶剂黄146 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 1.0h， 以55%的产率得到methyl shikimate
  参考文献：
  名称：

  通过钯介导的消除反应，生成（-）-ki草酸的对映体收敛路线。

  摘要：

  [反应-参见文本]（-）-Shi草酸是植物和微生物the草酸途径中的关键中间体，它是通过使用钯介导的消除反应作为关键步骤，从两种对映体原料中以对映体聚合的方式合成的。

  DOI：

  10.1021/ol005805q
• 作为产物：
  描述：

  Methyl (3R,4S,5R)-5-Hydroxy-3,4-<(methoxymethylene)dioxy>cyclohex-1-ene-1-carboxylate 在 盐酸 、 水 、 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 8.25h， 生成 methyl cis-3-hydroxy-4,5-epoxycyclohex-1-enecarboxylate
  参考文献：
  名称：

  Targeting the Motion of Shikimate Kinase: Development of Competitive Inhibitors that Stabilize an Inactive Open Conformation of the Enzyme

  摘要：

  The large conformational changes observed by Molecular Dynamics simulation studies on the product release in the LID and shikimic acid binding (SB) domains of the shikimate kinase (SK) enzyme have been exploited in the development of reversible competitive inhibitors against SK from Mycobacterium tuberculosis and Helicobacter pylori. This enzyme is a recognized target for antibiotic drug discovery. The reported C5-substituted shikimic acid analogues interact with the dynamic apolar pocket that surrounds the C4 and C5 hydroxyl groups of the natural substrate, cause the opening of the LID and SB domains, and capture the essential arginine far from the ATP binding site as required for catalysis. The 3-nitrobenzyl 3e and 5-benzothiophenyl derivatives 3i proved to be the most potent inhibitors. An ester prodrug of 3i was the most efficient derivative in achieving good in vitro activity against H. pylori, having a MIC value of 4 mu g/mL.

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b00483

文献信息

• Influenza Neuraminidase Inhibitors Possessing a Novel Hydrophobic Interaction in the Enzyme Active Site:  Design, Synthesis, and Structural Analysis of Carbocyclic Sialic Acid Analogues with Potent Anti-Influenza Activity
  作者：Choung U. Kim、Willard Lew、Matthew A. Williams、Hongtao Liu、Lijun Zhang、S. Swaminathan、Norbert Bischofberger、Ming S. Chen、Dirk B. Mendel、Chun Y. Tai、W. Graeme Laver、Raymond C. Stevens

  DOI：10.1021/ja963036t

  日期：1997.1.1

  the presence of a large hydrophobic pocket in the region corresponding to the glycerol subsite of sialic acid. The high antiviral potency observed for 6h appears to be attributed to a highly favorable hydrophobic interaction in this pocket. The practical synthesis of 6 starting from (-)-quinic acid is also described.

  描述了作为流感神经氨酸酶 (NA) 过渡态抑制剂的新型碳环的设计、合成和体外评估。8 (IC50 = 6.3 microM) 与 9 (IC50 > 200 microM) 的抗病毒活性表明，碳环类似物中的双键位置在 NA 抑制中起着重要作用。一系列碳环类似物 6a-i 的结构-活性研究确定 3-戊氧基部分是 C3 位置的明显最佳基团，对 NA 抑制的 IC50 值为 1 nM。与 NA 结合的 6h 的 X 射线晶体结构显示，在与唾液酸的甘油亚位点相对应的区域中存在大的疏水口袋。在 6 小时内观察到的高抗病毒效力似乎归因于该口袋中非常有利的疏水相互作用。
• 新颖化合物，其合成方法及治疗用途
  申请人：吉里德科学公司

  公开号：CN103772231B

  公开（公告）日：2016-02-03

  公开了新颖化合物。这些化合物一般包含有酸性基团，碱性基团，取代的氨基或N-酰基和具有选择性羟基化的烷基部分的基团。还公开了包含本发明的抑制剂的医药组合物。还公开了在可能含有神经氨酸苷酶的试样中抑制神经氨酸苷酶的方法。还公开了带标记的本发明化合物的抗原材料、聚合物、抗体、共轭物及检测神经氨酸苷酶活性的测定方法。
• Synthesis and Preliminary Evaluation of a Library of Polycyclic Small Molecules for Use in Chemical Genetic Assays
  作者：Derek S. Tan、Michael A. Foley、Brent R. Stockwell、Matthew D. Shair、Stuart L. Schreiber

  DOI：10.1021/ja992144n

  日期：1999.10.1

  (−)-Shikimic acid, 3, was converted into both enantiomers of epoxycyclohexenol carboxylic acid, 7, which were attached to a solid support via a photocleavable linker. Tandem acylation−1,3-dipolar cycloaddition with nitrones 11a−g yielded tetracyclic templates 12a−g. After development of several efficient coupling reactions of iodobenzyl tetracycles 12b−d and completion of extensive validation protocols

  (-)-莽草酸 3 被转化为环氧环己烯醇羧酸 7 的两种对映异构体，它们通过光可裂解接头连接到固体支持物上。与硝酮 11a-g 的串联酰化-1,3-偶极环加成产生四环模板 12a-g。在开发了碘苄基四环 12b-d 的几种有效偶联反应并完成了广泛的验证方案之后，拆分池合成产生了一个二进制编码库，计算得出包含 218 万个多环化合物。这些化合物与旨在探索生物途径的小型化基于细胞的“正向”化学遗传测定和旨在探索蛋白质功能的“反向”化学遗传测定兼容。作为这些化合物潜力的简单说明，
• Novel and Efficient Syntheses of Four Useful Shikimate-derived Epoxy Chiral Building Blocks via Cyclic Sulfite Intermediates
  作者：Na Quan、Liangdeng Nie、Xiaoxin Shi、Ruiheng Zhu、Xia Lü

  DOI：10.1002/cjoc.201201000

  日期：2012.12

  All of the four stereoisomers of methyl 4,5‐epoxy‐3‐hydroxy‐cyclohex‐1‐ene‐carboxylate (1a–1d) are useful chiral building blocks. Novel and efficient syntheses of these four epoxy chiral building blocks from naturally abundant (−)‐shikimic acid (2) via cyclic sulfite intermediates are described in this article. The targeted compound (3R,4R,5S)‐1a was synthesized via four steps from (−)‐shikimic acid

  4,5-环氧-3-羟基-环己基-1-烯-羧酸甲酯（1a - 1d）的所有四个立体异构体都是有用的手性结构单元。本文介绍了通过环状亚硫酸盐中间体从自然丰富的（-）-草酸（2）合成这四种环氧手性结构单元的新颖有效的方法。目标化合物（3 R，4 R，5 S）-1a是由（-）-ki草酸分四步合成的，总收率为79％。其他三种目标化合物（3 S，4 R，5 S）-1b，（3 S，4 S，5 R） - 1C和（3 - [R，4小号，5 - [R ）- 1D） - -莽草酸，56％分别为64％和65％总产率，分别通过从（七个步骤合成。
• Synthesis and evaluation of two new inhibitors of EPSP synthase
  作者：Paul D. Pansegrau、Karen S. Anderson、Theodore Widlanski、Joel E. Ream、R.Douglas Sammons、James A. Sikorski、Jeremy R. Knowles

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)78792-2

  日期：1991.6

  The enzyme EPSP synthase, EPSPS, (EC 2.5.1.19) catalyzes an unusual transfer reaction of the enolpyruvoyl moiety from phosphoenol pyruvate (, PEP) regiospecifically to the 5-OH of shikimate 3-phosphate (, S3P) to form 5-enol-pyruvoylshikimate 3-phosphate (, EPSP). Two new inhibitors, (, and ) were prepared to probe the S3P binding site.

  EPSP合酶EPSPS（EC 2.5.1.19）催化烯醇丙酮酸部分从磷酸烯醇丙酮酸（，PEP）区域特异性地转移到sh草酸酯3-磷酸​​酯（，S3P）的5-OH形成5-烯醇-磷酸丙酮酰草酸酯3-磷酸酯（，EPSP）。制备了两种新的抑制剂（和）来探测S3P结合位点。