(1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(2-N-isobutyrylguanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane | 293751-10-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(2-N-isobutyrylguanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
• 英文别名: [(1R,3R,4R,7S)-3-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]-7-phenylmethoxy-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptan-1-yl]methyl methanesulfonate
• CAS: 293751-10-7
• 化学式: C₂₃H₂₇N₅O₈S
• 分子量: 533.562
• InChiKey: BKMBHNLXRPRZOD-BPVRBSMNSA-N

物化性质

• 密度：
  1.60±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.2
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.48
• 拓扑面积：
  168
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(2-N-isobutyrylguanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane 在 sodium hydroxide 、 水 作用下， 反应 12.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(guanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  IMPROVED SYNTHESIS OF ¬2.2.1|BICYCLO NUCLEOSIDES

  摘要：

  公开号：

  EP1163250B1
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-6-氯嘌呤 在 N,O-双三甲硅基乙酰胺 、 sodium hydride 、 3-羟基丙腈 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 7.0h， 生成 (1R,3R,4R,7S)-7-benzyloxy-1-methanesulfonyloxymethyl-3-(2-N-isobutyrylguanin-9-yl)-2,5-dioxabicyclo[2.2.1]heptane
  参考文献：
  名称：

  LNA鸟嘌呤和2，6-二氨基嘌呤。含有LNA 2，6-二氨基嘌呤的寡核苷酸的合成，表征和杂交特性。

  摘要：

  LNA鸟嘌呤和2,6-二氨基嘌呤（D）亚磷酰胺已合成为反义寡核苷酸（ON）的构件。研究了将LNA D掺入ON的效果。不出所料，含有ON的LNA D对互补DNA（ΔTm +1.6至+3.0摄氏度）和RNA（ΔTm +2.6至+4.6摄氏度）ON表现出更高的亲和力。为了评估含有ON的LNA D与含有ON的互补LNA A相比是否具有增强的错配敏感性，进行了针对单个错配DNA和RNA ON的热变性实验。在完全LNA修饰的ON中，用LNA D取代一个LNA A残基，导致对DNA ON的错配敏感性更高（Delta Delta Tm -4至> -17摄氏度）。观察到朝向单个错配的RNA ON的相同趋势（Delta Delta Tm Da = -8.7摄氏度，Dg = -4。

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2004.02.008

文献信息

• A Simplified and Efficient Route to 2‘-<i>O</i>, 4‘-<i>C</i>-Methylene-Linked Bicyclic Ribonucleosides (Locked Nucleic Acid)
  作者：Alexei A. Koshkin、Jef Fensholdt、Henrik M. Pfundheller、Christian Lomholt

  DOI：10.1021/jo010732p

  日期：2001.12.1

  can be prepared from D-glucose in multigram scale. Four different nucleobases were stereoselectively coupled to 8 using a modified Vorbrüggen procedure to give the corresponding 4'-C-branched nucleoside derivatives. Subsequent ring closing furnished the protected LNA nucleosides. The 5'-O-mesyl groups were efficiently displaced by nucleophilic substitution using sodium benzoate. Saponification of the

  描述了一种合成锁核酸（LNA）单体的新型有效方法。通过聚合合成制备了含有胸腺嘧啶，4-N-乙酰基和4-N-苯甲酰基胞嘧啶，6-N-苯甲酰腺嘌呤和2-N-异丁酰鸟嘌呤作为核碱基的LNA 5'，3'-二醇。该方法基于使用常见的糖中间体1,2-二-O-乙酰基-3-O-苄基-4-C-甲磺酰氧基甲基-5-O-甲磺酰-D-赤型戊呋喃糖（8）可以从D-葡萄糖以克数制得。使用改良的Vorbrüggen程序将四个不同的核碱基立体选择性地偶联到8个核碱基上，得到相应的4'-C-支链核苷衍生物。随后的闭环提供了受保护的LNA核苷。使用苯甲酸钠通过亲核取代有效地置换了5'-O-甲磺酰基。将5'-苯甲酸酯皂化，然后催化除去3'-O-苄基，得到游离的LNA二醇。腺苷和胞苷的环外氨基被选择性地酰化，得到4-N-乙酰基或4-N-苯甲酰基-LNA-C和6-N-苯甲酰基-LNA-A。在制备2-N-异丁酰基-LNA-G期间，鸟
• IMPROVED SYNTHESIS OF ¬2.2.1|BICYCLO NUCLEOSIDES
  申请人：Exiqon A/S

  公开号：EP1163250B1

  公开（公告）日：2006-07-12
• LNA guanine and 2,6-diaminopurine. Synthesis, characterization and hybridization properties of LNA 2,6-diaminopurine containing oligonucleotides
  作者：Christoph Rosenbohm、Daniel Sejer Pedersen、Miriam Frieden、Flemming R. Jensen、Susan Arent、Sine Larsen、Troels Koch

  DOI：10.1016/j.bmc.2004.02.008

  日期：2004.5

  LNA guanine and 2,6-diaminopurine (D) phosphoramidites have been synthesized as building blocks for antisense oligonucleotides (ON). The effects of incorporating LNA D into ON were investigated. As expected, LNA D containing ON showed increased affinity towards complementary DNA (Delta Tm +1.6 to +3.0 degrees C) and RNA (Delta Tm +2.6 to +4.6 degrees C) ON. To evaluate if LNA D containing ON have an

  LNA鸟嘌呤和2,6-二氨基嘌呤（D）亚磷酰胺已合成为反义寡核苷酸（ON）的构件。研究了将LNA D掺入ON的效果。不出所料，含有ON的LNA D对互补DNA（ΔTm +1.6至+3.0摄氏度）和RNA（ΔTm +2.6至+4.6摄氏度）ON表现出更高的亲和力。为了评估含有ON的LNA D与含有ON的互补LNA A相比是否具有增强的错配敏感性，进行了针对单个错配DNA和RNA ON的热变性实验。在完全LNA修饰的ON中，用LNA D取代一个LNA A残基，导致对DNA ON的错配敏感性更高（Delta Delta Tm -4至> -17摄氏度）。观察到朝向单个错配的RNA ON的相同趋势（Delta Delta Tm Da = -8.7摄氏度，Dg = -4。