3,17,18-trideoxyaphidicolin | 101143-85-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 异戊烯醇脂质
• 英文名称: 3,17,18-trideoxyaphidicolin
• 英文别名: aphidicolan-16β-ol；aphidicolan-3β-ol；(1S,2S,7S,10S,12R,13R)-2,6,6,13-tetramethyltetracyclo[10.3.1.01,10.02,7]hexadecan-13-ol
• CAS: 101143-85-5
• 化学式: C₂₀H₃₄O
• 分子量: 290.489
• InChiKey: ODCPNBCPLWJVQI-AEVHBADWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.8
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  1.0
• 拓扑面积：
  20.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  1

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3,17,18-trideoxyaphidicolin 在 三氟化硼乙醚 、 间氯过氧苯甲酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.67h， 生成 13β,14β-epoxybetaerane
  参考文献：
  名称：

  由二萜环化酶 Aphidicolan-16β-ol 合酶催化的反应的拟议机制：仿生环化的实验结果和通过 ab Initio 计算检查环化途径

  摘要：

  为了研究由 aphidicolan-16beta-ol 合酶 (ACS) 催化的环化反应的机制，ACS 是双萜 aphidicolin 生物合成的关键酶，是 DNA 聚合酶 α 的特异性抑制剂，2a 的骨架重排和 4b 的仿生环化是受雇。反应产物的结构反映了倒数第二个阳离子中间体，使我们能够为路易斯酸催化的环化和重排提出详细的反应途径。在产生 aphidicolin 的真菌中分离这些产物使我们推测 ACS 催化的环化反应的机制与非酶促反应的机制相同。酸催化反应中间体和过渡态的从头算计算表明，ACS 催化的整个反应是放热过程，尽管反应是通过能量不利的二级阳离子类过渡态进行的。结合酸催化反应中的溶剂效应，这表明 ACS 的实际作用是提供一个模板，该模板强制中间阳离子的构象导致生产性环化，尽管人们认为活性位点中的阳离子中间体和芳香族氨基酸残基对于酶催化很重要。这项研究提供了关于各种阳离子种类的作用的重要信息，尤其是二级阳离子类结构，

  DOI：

  10.1021/ja025830m
• 作为产物：
  描述：

  艾菲地可宁 在 镍 氢气 、 sodium hydride 作用下， 生成 3,17,18-trideoxyaphidicolin
  参考文献：
  名称：

  The later stage of the biosynthesis of aphidicolin: Accumulation of intermediates with cytochrome P-450 inhibitors.

  摘要：

  DOI：

  10.1271/bbb1961.53.299

文献信息

• Cloning of a Gene Cluster Responsible for the Biosynthesis of Diterpene Aphidicolin, a Specific Inhibitor of DNA Polymerase α
  作者：Tomonobu TOYOMASU、Kentaro NAKAMINAMI、Hiroaki TOSHIMA、Takashi MIE、Kenji WATANABE、Hiroyuki ITO、Hirokazu MATSUI、Wataru MITSUHASHI、Takeshi SASSA、Hideaki OIKAWA

  DOI：10.1271/bbb.68.146

  日期：2004.1

  The fungal diterpene, aphidicolin, is a well-known specific inhibitor of DNA polymerase alpha. Terpenoids are an important class of natural products. However, identification of the biosynthetic gene cluster in terpenoids is relatively rare compared with another important class of natural products, polyketides. To explore a reliable identification method for the biosynthetic gene cluster in fungal diterpenoids

  真菌二萜，蚜虫二酚，是DNA聚合酶α的众所周知的特异性抑制剂。萜类化合物是一类重要的天然产物。但是，与另一类重要的天然产物聚酮化合物相比，萜类化合物中生物合成基因簇的鉴定相对较少。为了探索一种可靠的真菌双萜类生物合成基因簇的鉴定方法，采用了蚜虫素生物合成基因簇的克隆方法。一个简单的PCR方法的应用基于基于编码蚜虫16beta-ol合酶（ACS）的cDNA序列的基因组遍历，使我们能够分析Phoma betae基因组DNA的15.6kb区域。在该区域发现了六个ORF，PbGGS，ACS，PbP450-1，PbP450-2，PbTP和PbTF，分别预期可编码香叶基香叶基二磷酸合酶，二萜合酶，两个细胞色素P-450，转运蛋白和转录因子。通过相应的cDNA分析推导了它们的氨基酸序列和内含子。这项研究表明，在不构建基因组DNA文库的情况下，基于PCR的简单基因组遍历可用于鉴定小基因簇。我们提出了使用真
• Biosynthesis of diterpenoid aphidicolin: Isolation of intermediates from P-450 inhibitor treated mycelia of Phoma betae
  作者：Hideaki Oikawa、Satoshi Ohashi、Akitami Ichihara、Sadao Sakamura

  DOI：10.1016/s0040-4020(99)00392-0

  日期：1999.6

  Treatment of Phoma betae with P-450 inhibitors caused accumulation of biosynthetic precursors 2, 3 and 4 of aphidicolin (1), Their structures were elucidated by spectroscopic analysis and they were confirmed by chemical transformations from 1, Isotopically labeled precursors were synthesized by either reductive deoxygenation of aphidicolin derivatives or microbial conversion of [1-C-14]acetate in the presence of the P-450 inhibitor, Feeding experiments of the labeled precursors confirmed late biosynthetic pathway of 1. (C) 1999 Elsevier Science Ltd. All rights reserved.
• Ackland, Mark J.; Hanson, James R.; Yeoh, Boon Leng, Journal of the Chemical Society. Perkin transactions I, 1985, p. 2705 - 2708
  作者：Ackland, Mark J.、Hanson, James R.、Yeoh, Boon Leng、Ratcliffe, Arnold H.

  DOI：——

  日期：——
• Cloning and Functional Expression of cDNA Encoding Aphidicolan-16β-ol Synthase:  A Key Enzyme Responsible for Formation of an Unusual Diterpene Skeleton in Biosynthesis of Aphidicolin
  作者：Hideaki Oikawa、Tomonobu Toyomasu、Hiroaki Toshima、Satoshi Ohashi、Hiroshi Kawaide、Yuji Kamiya、Minoru Ohtsuka、Shoko Shinoda、Wataru Mitsuhashi、Takeshi Sassa

  DOI：10.1021/ja015747j

  日期：2001.5.1