Alkyne derivatives of isocoumarins as clickable activity-based probes for serine proteases
作者:Ute Haedke、Markus Götz、Philipp Baer、Steven H.L. Verhelst
DOI:10.1016/j.bmc.2011.03.014
日期:2012.1
detect their target proteases in a proteome background in a sensitive manner (down to 0.007% of total protein). Furthermore, we show activity-dependent and selective labeling of endogenous proteases in a tissue proteome. These ICs therefore represent a valuable extension to already existing ABPs for serine proteases and may be instrumental in future elucidation of serine protease functions.
基于活动的探针(ABP)已发现在功能蛋白质组学研究中的使用越来越多。近来,可与点击化学结合使用的ABP由于其在体内和体外的灵活应用而受到了特别的关注。此外,持续需要针对小部分酶的新ABP。我们在此报告基于4-氯-异香豆素(IC)亲电子体的新型可点击ABP,这是一种基于机理的抑制剂骨架,与丝氨酸蛋白酶共价结合。我们描述了一个IC ABPs小库的合成,该库包含炔烃功能和一组不同的选择性元素。IC结构上的不同取代基决定结合哪些蛋白酶,与优选的底物偏好表现出良好的相关性。IC ABP可以以敏感的方式(低至总蛋白的0.007%)在蛋白质组背景中检测其目标蛋白酶。此外,我们显示了组织蛋白质组中内源蛋白酶的活性依赖性和选择性标记。因此,这些IC代表了对丝氨酸蛋白酶已经存在的ABP的宝贵扩展,并且可能在将来阐明丝氨酸蛋白酶功能方面发挥了作用。