tert-butyl ((2S,3R)-1,3-dihydroxypent-4-en-2-yl)carbamate | 117603-66-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: tert-butyl ((2S,3R)-1,3-dihydroxypent-4-en-2-yl)carbamate
• 英文别名: (2S)-(N-tert-butyloxycarbonyl)amino-4-pentene-1(3R)-diol；tert-butyl N-[(2S,3R)-1,3-dihydroxypent-4-en-2-yl]carbamate
• CAS: 117603-66-4
• 化学式: C₁₀H₁₉NO₄
• 分子量: 217.265
• InChiKey: DZUUXUNYNBTANP-JGVFFNPUSA-N

物化性质

• 沸点：
  377.1±42.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.103±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.3
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.7
• 拓扑面积：
  78.8
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl ((2S,3R)-1,3-dihydroxypent-4-en-2-yl)carbamate 在 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 盐酸 、 六甲基磷酰三胺 、 copper(l) iodide 、 palladium 10% on activated carbon 、 camphor-10-sulfonic acid 、 氢气 、 碘 、 potassium carbonate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 乙酸乙酯 、 乙腈 为溶剂， -30.0~45.0 ℃ 、344.75 kPa 条件下， 反应 19.5h， 生成 jaspine B
  参考文献：
  名称：

  Jaspine B的立体选择性合成并从加纳醛其差向异构体C2 †

  摘要：

  两种不同的立体选择性合成路线 茉莉花B从易于获得的Garner醛开始，这里介绍了它的C2差向异构体及其C2差向异构体。关键的合成步骤包括碘化，有机铜的加成，HWE烯化，区域选择性α-甲苯磺酸化和交叉复分解反应。这是第一份综合报告茉莉花B 涉及碘环化。

  DOI：

  10.1039/c3ra41778f
• 作为产物：
  描述：

  N-甲氧基-N-甲基-N2-{[(2-甲基-2-丙基)氧基]羰基}-L-丝氨酰胺 在 咪唑 、 盐酸 、 lithium tri-t-butoxyaluminum hydride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.84h， 生成 tert-butyl ((2S,3R)-1,3-dihydroxypent-4-en-2-yl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  通过烯烃交叉复分解的多功能合成方法，用于鞘脂和功能化鞘氨醇衍生物。

  摘要：

  通过烯烃交叉复分解反应的两种组合，建立了一种高效且通用的合成各种鞘脂的方法，如鞘磷脂，神经酰胺，鞘氨醇，1-磷酸鞘氨醇和功能化鞘氨醇衍生物。一个反应是在相同的烯烃部分与合适的氨基醇之间，它们从N-Boc-L-丝氨酸开始制备，另一个反应在合适的烯烃与相同的氨基醇之间。[反应：请参见文字]。

  DOI：

  10.1021/ol062258l

文献信息

• Exploring Leishmania major Inositol Phosphorylceramide Synthase (LmjIPCS): Insights into the ceramide binding domain
  作者：John G. Mina、Jackie A. Mosely、Hayder Z. Ali、Paul W. Denny、Patrick G. Steel

  DOI：10.1039/c0ob00871k

  日期：——

  The synthesis of set of ceramide analogues exploring hydrophobicity in the acyl chains and the degree and nature of hydroxylation is described. These have been assayed against the parasitic protozoan enzymeLmjIPCS. These studies showed that whilst the C-3 hydroxyl group was not essential for turnover it provided enhanced affinity. Reflecting the membrane bound nature of the enzyme a long (C13) hydrocarbon ceramide tail was necessary for both high affinity and turnover. Whilst the N-acyl chain also contributed to affinity, analogues lacking the amide linkage functioned as competitive inhibitors in both enzyme and cell-based assays. A model that accounts for this observation is proposed.

  本文描述了一组神经酰胺类似物的合成，这些类似物探讨了酰基链的疏水性、羟基化的程度和性质。它们已被用于检测寄生原生动物酶LmjIPCS。这些研究表明，尽管C-3羟基团对酶的代谢转化不是必需的，但它提供了增强的亲和力。鉴于该酶的膜结合性质，需要一个长（C13）碳氢神经酰胺尾部以实现高亲和力和代谢转化。虽然N-酰基链也对亲和力有所贡献，但缺乏酰胺键连接的类似物在酶和细胞基础测试中作为竞争性抑制剂发挥了作用。针对这一观察结果，我们提出了一个理论模型。
• Synthesis ofD-Erythro- andD-Threo-Sphingosine Derivatives FromL-Serine
  作者：Peter Herold

  DOI：10.1002/hlca.19880710208

  日期：1988.3.16

  The protected serine aldehyde 10 was converted to the crystalline N-Boc-protected sphingosines 6–9 by a three-step reaction sequence. Compound 10 was transformed with high diastereoselectivity (95%) either to the erythro- or threo-alkynols, 17 and 18, respectively. The erythro-isomer 17 is formed by the addition to 10 of lithium pentadecyne 16 in THF/HMPT at −78°, whereas the corresponding threo-isomer

  受保护的丝氨酸醛10转化为结晶Ñ -Boc保护的鞘氨醇6 - 9通过3步反应序列。将化合物10以高非对映选择性（95％）转化为分别为赤型或苏型炔烃17和18。的赤式异构体17通过加入形成为10锂pentadecyne的16在THF / HMPT在-78℃，而相应的苏式异构体18在ZnBr的存在下制备2在Et 2 O中。缩醛部分的脱保护得到1，3-二醇19和20。通过在Lindlar催化剂上进行部分加氢，将这些二醇用Red-Al选择性还原为（E）-鞘氨醇6和8或（Z） -异构体7和9。N- Boc基团的裂解和进一步转化为神经酰胺很容易实现，这是通过将6转化为N-十八烷酰基-D-赤型-鞘氨醇5来实现的。
• Liposomal FRET Assay Identifies Potent Drug‐Like Inhibitors of the Ceramide Transport Protein (CERT)
  作者：Doaa Samaha、Housam H. Hamdo、Xiaojing Cong、Fabian Schumacher、Sebastian Banhart、Öznur Aglar、Heiko M. Möller、Dagmar Heuer、Burkhard Kleuser、Essa M. Saied、Christoph Arenz

  DOI：10.1002/chem.202003283

  日期：2020.12.15

  Ceramide transfer protein (CERT) mediates non‐vesicular transfer of ceramide from endoplasmic reticulum to Golgi apparatus and thus catalyzes the rate‐limiting step of sphingomyelin biosynthesis. Usually, CERT ligands are evaluated in tedious binding assays or non‐homogenous transfer assays using radiolabeled ceramides. Herein, a facile and sensitive assay for CERT, based on Förster resonance energy

  神经酰胺转移蛋白（CERT）介导神经酰胺从内质网到高尔基体的非囊泡转移，从而催化鞘磷脂生物合成的限速步骤。通常，CERT 配体在繁琐的结合测定或使用放射性标记神经酰胺的非均相转移测定中进行评估。本文提出了一种基于福斯特共振能量转移 (FRET) 的简单且灵敏的 CERT 检测方法。为此，我们混合了供体和受体囊泡，每个囊泡含有不同的荧光神经酰胺种类。通过 CERT 介导的荧光神经酰胺转移，建立了 FRET 系统，尽管组件具有高疏水性，但仍可以在 96 孔板格式中进行读数。对 2000 种化合物库的筛选产生了两种新的有效 CERT 抑制剂。一种被批准用于人类，另一种被批准用于动物。通过定量质谱和共聚焦显微镜对细胞活性的评估表明，神经酰胺运输和鞘磷脂生物合成受到抑制。
• A Diversity-Oriented Strategy for Chemoenzymatic Synthesis of Glycosphingolipids and Related Derivatives
  作者：Qingjiang Li、Mohit Jaiswal、Rajendra S. Rohokale、Zhongwu Guo

  DOI：10.1021/acs.orglett.0c02847

  日期：2020.11.6

  glycan assembly and on-site lipid remodeling via chemoselective cross-metathesis and N-acylation was developed for glycosphingolipid (GSL) synthesis starting from a common, simple glycoside. The strategy was verified with a series of natural GSLs and GSL derivatives and showed several advantages. Most notably, it enabled two-way diversification of the glycan and lipid, including introduction of designed

  开发了一种以多样性为导向的策略，将酶促聚糖组装和通过化学选择性交叉复分解和N-酰化的现场脂质重塑相结合，用于从常见的简单糖苷开始的鞘糖脂 (GSL) 合成。该策略通过一系列天然 GSL 和 GSL 衍生物进行了验证，并显示出几个优点。最值得注意的是，它实现了聚糖和脂质的双向多样化，包括引入设计的分子标签，以提供对生物学研究和应用有用的功能化 GSL。
• A biologically relevant ceramide fluorescent probe to assess the binding of potential ligands to the CERT transfer protein
  作者：Stéphanie Combemale、Cécile Santos、Frédéric Rodriguez、Virginie Garcia、Chantal Galaup、Céline Frongia、Valérie Lobjois、Thierry Levade、Cécile Baudoin-Dehoux、Stéphanie Ballereau、Yves Génisson

  DOI：10.1039/c3ra42395f

  日期：——

  The conversion of ceramide into sphingomyelin (SM) was only recently considered in relation to cancer. Overexpression of the CERT protein, responsible for a highly specific inter-organelle ceramide transfer step along the de novo SM synthesis pathway, has been associated with multi-drug resistance of cancer cells. Identification of new CERT antagonists may therefore lead to potential resensitizing agents. This work describes the first attempt to design a ceramide-based fluorescent probe optimised to evaluate the binding of potential CERT ligands. A prototypical structure with an ω-labelled sphingosine backbone was selected. Its possible recognition mode by CERT was first evaluated by means of a precursory molecular modelling study. Three derivatives with various amide chain lengths were prepared and tested. The binding efficiency was shown to be proportional to the lipophilicity of the acyl moiety. The best compound bearing a C16 amide fragment was used to implement a practical binding experiment. Facile assessment of the recognition by the CERT START domain of various structures was thus ensured. Metabolism and imaging experiments were also used to illustrate the capacity of the proposed fluorescent ceramide analogue to mimic the natural ceramide cellular behaviour. This work led to the synthesis and evaluation as an efficient CERT START domain ligand of a ω-biotinylated ceramide, a potential probe to develop the screening of new CERT antagonists.

  神经酰胺向鞘磷脂（SM）的转化直到最近才被认为与癌症有关。CERT 蛋白负责从头合成 SM 途径中一个高度特异的细胞器间神经酰胺转移步骤，它的过表达与癌细胞的多重耐药性有关。因此，鉴定新的 CERT 拮抗剂可能会带来潜在的抗敏药物。这项研究首次尝试设计一种基于陶瓷酰胺的荧光探针，并对其进行了优化，以评估潜在 CERT 配体的结合情况。我们选择了一种具有ω标记鞘磷脂骨架的原型结构。首先通过先导分子建模研究评估了 CERT 可能的识别模式。制备并测试了三种具有不同酰胺链长度的衍生物。结合效率与酰基的亲脂性成正比。含有 C16 氨基酸片段的最佳化合物被用于实际结合实验。这样就确保了对 CERT START 结构域识别各种结构的便捷评估。新陈代谢和成像实验也用来说明拟议的荧光神经酰胺类似物模仿天然神经酰胺细胞行为的能力。通过这项工作，我们合成并评估了一种ω-生物素化神经酰胺的高效 CERT START 结构域配体，它是筛选新型 CERT 拮抗剂的潜在探针。