2-methyl-[β-D-mannopyranosyl-(1->4)-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano]-[2,1-d]-oxazoline | 374780-39-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 2-methyl-[β-D-mannopyranosyl-(1->4)-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano]-[2,1-d]-oxazoline
• 英文别名: O-(β-D-mannopyranosyl)-(1->4)-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano)-[2,1-d]-2-methyloxazoline；2-methyl-[β-D-mannopyranosyl-(1→4)-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano]-[2,1-d]-oxazoline；(2S,3S,4S,5S,6R)-2-[[(3aR,5R,6S,7R,7aR)-7-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-2-methyl-5,6,7,7a-tetrahydro-3aH-pyrano[3,2-d][1,3]oxazol-6-yl]oxy]-6-(hydroxymethyl)oxane-3,4,5-triol
• CAS: 374780-39-9
• 化学式: C₁₄H₂₃NO₁₀
• 分子量: 365.337
• InChiKey: HHZZJXOUIQVBPC-MSKDZHJNSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.8
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.93
• 拓扑面积：
  171
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-methyl-[β-D-mannopyranosyl-(1->4)-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano]-[2,1-d]-oxazoline 、 甲基2-乙酰氨基-2-脱氧-BETA-D-吡喃葡萄糖苷 在 Tris-HCl buffer 作用下， 反应 1.0h， 生成 β-D-mannopyranosyl-(1->4)-N-acetyl-β-D-glucosaminyl-(1->4)-N-acetyl-β-D-glucosaminyl-O-methyl
  参考文献：
  名称：

  A Bacterial Chitinase Acts as Catalyst for Synthesis of theN‐Linked Oligosaccharide Core Trisaccharide by Employing a Sugar Oxazoline Substrate

  摘要：

  A chitinolytic enzyme, chitinase A1 from Bacillus circulans WL-12, was found to catalyze a glycosyl-transferring reaction to form the N-linked oligosaccharide core structure, Man(beta 1-4)-GlcNAc(beta 1-4)-GlcNAc, by employing Man(beta 1-4)-GlcNAc-oxazoline as glycosyl donor. When the reaction was carried out in the presence of 20 v/v% acetone, the trisaccharide was obtained in 32% yield. It has been shown for the first time that a chitinase behaves like an endo-beta-N-acetylglucosaminidase in spite of low structural similarity between them.

  DOI：

  10.1080/07328300600966448
• 作为产物：
  描述：

  2',3',4',6'-tetra-O-acetyl-β-D-glucopyranosyl-(1→4)-3,6-di-O-acetyl-2-azido-2-deoxy-1-O-nitro-β-D-glucopyranose 在 吡啶 、 N-碘代丁二酰亚胺 、 三氟甲磺酸酐 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 camphor-10-sulfonic acid 、 三乙基硅基三氟甲磺酸酯 、 sodium methylate 、 sodium acetate 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 1,2-二氯乙烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 48.5h， 生成 2-methyl-[β-D-mannopyranosyl-(1->4)-1,2-dideoxy-α-D-glucopyrano]-[2,1-d]-oxazoline
  参考文献：
  名称：

  GLYCOPROTEIN SYNTHESIS AND REMODELING BY ENZYMATIC TRANSGLYCOSYLATION

  摘要：

  公开号：

  EP2001358B1

文献信息

• Efficient synthesis and enzymatic extension of an <i>N</i>-GlcNAz asparagine building block
  作者：Mikkel Haarslev Schröder Marqvorsen、Sivasinthujah Paramasivam、Ward Doelman、Antony John Fairbanks、Sander Izaäk van Kasteren

  DOI：10.1039/c9cc02051a

  日期：——

  practical synthesis of FmocAsn(N-Ac3GlcNAz)OH, a building block for solid phase peptide synthesis (SPPS). Protecting group manipulations are minimised by taking advantage of the inherent chemoselectivity of phosphine-mediated azide reduction, and the resulting glycosyl amine is employed directly in the opening of Fmoc protected aspartic anhydride. We show potential application of the building block by establishing

  N-叠氮基乙酰基-d-葡糖胺（GlcNAz）在化学生物学中是一种特别有用的工具，因为叠氮化物是生物系统中代谢稳定但易于使用的手柄。在此，我们报告了FmocAsn（N-Ac3GlcNAz）OH的实用合成，这是固相肽合成（SPPS）的基础。通过利用膦介导的叠氮化物还原反应固有的化学选择性将保护基团的操作减至最少，并将所得的糖基胺直接用于Fmoc保护的天冬氨酸酐的开环中。我们通过将其建立为酶促聚糖延伸的底物，使用具有不同大小和生物学意义的糖恶唑啉与几种内-β-N-乙酰氨基葡萄糖苷酶（ENGases），来显示该结构单元的潜在应用。
• Synthesis of N-glycan oxazolines: donors for endohexosaminidase catalysed glycosylation
  作者：Thomas W.D.F. Rising、Timothy D.W. Claridge、Nicola Davies、David P. Gamblin、James W.B. Moir、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1016/j.carres.2006.03.007

  日期：2006.7

  Oxazoline mono-, di-, tri- and hexasaccharides, corresponding to the core components of N-linked glycoprotein high mannose glycans, are synthesised as potential glycosyl donors for endohexosaminidase catalysed glycosylation of glycopeptides and glycoprotein remodelling. The crucial beta-D-Manp-(1-->4)-D-GlcpNAc linkage is synthesised via epimerisation of gluco disaccharide substrates by sequential

  恶唑啉单，二，三和六糖，对应于N-连接的糖蛋白高甘露糖聚糖的核心成分，被合成为潜在的糖基供体，用于内己糖胺酶催化糖肽的糖基化和糖蛋白重塑。关键的β-D-Manp-（1-> 4）-D-GlcpNAc连接是通过顺序三氟甲磺酸酯化和亲核取代作用通过葡萄糖二糖底物的差向异构化合成的。恶唑啉直接由端基OPMP保护的N-乙酰基氨基葡萄糖衍生物形成。用三糖恶唑啉供体证明了合成的β-D-GlcpNAcAsn糖基氨基酸的高效内己糖胺酶催化糖基化。
• Glycopeptide Synthesis throughendo-Glycosidase-Catalyzed Oligosaccharide Transfer of Sugar Oxazolines: Probing Substrate Structural Requirement
  作者：Ying Zeng、Jingsong Wang、Bing Li、Steven Hauser、Hengguang Li、Lai-Xi Wang

  DOI：10.1002/chem.200501196

  日期：2006.4.12

  An array of sugar oxazolines was synthesized and tested as donor substrates for the Arthrobacter endo-beta-N-acetylglucosaminidase (Endo-A)-catalyzed glycopeptide synthesis. The experiments revealed that the minimum structure of the donor substrate required for Endo-A catalyzed transglycosylation is a Man beta1-->4-GlcNAc oxazoline moiety. Replacement of the beta-D-Man moiety with beta-D-Glc, beta-D-Gal

  合成了一系列糖恶唑啉，并测试了它们作为节杆菌内-β-N-乙酰氨基葡糖苷酶（Endo-A）催化的糖肽合成的供体底物。实验表明，Endo-A催化转糖基化所需的供体底物的最小结构是Man beta1-> 4-GlcNAc恶唑啉部分。用β-D-Glc，β-D-Gal和β-D-GlcNAc单糖替代β-D-Man部分会导致二糖恶唑啉的底物活性降低。尽管如此，该酶仍可耐受修饰，例如在β-D-Man部分的3和/或6位上附加糖残基或官能团的连接，从而使选择性修饰的寡糖成功转移到肽上受体。另一方面，该酶在受体部分具有很大的柔韧性，可以同时使用大大小小的GlcNAc肽作为受体。研究表明，内切糖苷酶催化的转糖基化在构建天然和选择性修饰糖肽方面都具有巨大潜力。
• Rapid synthesis of N-glycan oxazolines from locust bean gum via the Lafont rearrangement
  作者：Sivasinthujah Paramasivam、Antony J. Fairbanks

  DOI：10.1016/j.carres.2019.03.010

  日期：2019.5

  Enzymatic degradation of locust bean gum provides a Manβ(1 → 4)Man disaccharide, which may be converted into the core Manβ(1 → 4)GlcNAc disaccharide unit of all N-glycans via conversion to a 2-iodo-glycosyl azide, and Lafont rearrangement. The Manβ(1 → 4)GlcNAc disaccharide may be used as a key intermediate for elaboration into more complex N-glycan structures providing a route to N-glycan oxazolines

  刺槐豆胶的酶促降解提供了Manβ（1→4）Man二糖，可通过转化为2-碘-糖基叠氮化物将其转化为所有N-聚糖的核心Manβ（1→4）GlcNAc二糖单元。 Lafont重排。Manβ（1→4）GlcNAc二糖可用作关键中间体，可用于修饰成更复杂的N-聚糖结构，从而提供了一条途径，将N-聚糖恶唑啉作为ENGase酶的供体底物，比以前报道的要短得多。
• Sugar-Assisted Glycopeptide Ligation with Complex Oligosaccharides: Scope and Limitations
  作者：Clay S. Bennett、Stephen M. Dean、Richard J. Payne、Simon Ficht、Ashraf Brik、Chi-Huey Wong

  DOI：10.1021/ja8010513

  日期：2008.9.10

  glycosylation at C-4 the ligation efficiency is affected by the identity of the N-terminal AA, while the nature of the C-terminal residue of the peptide thioester does not appear to affect ligation efficiency. These studies provide useful guidelines in deciding when it is appropriate to use SAL in the synthesis of complex glycopeptides and glycoproteins and how to choose ligation junctions for optimal

  我们之前已经证明糖辅助连接 (SAL) 是一种用于糖肽聚合构建的有用方法。然而，迄今为止，SAL 仅在硫醇助剂连接到单糖的系统上进行。为了使 SAL 真正适用于构建完全精细的糖肽和糖蛋白，必须能够在硫醇辅助剂连接到更精细的糖上时进行反应，因为这些是在自然界中经常观察到的。在这里，我们检查了 C-2 辅助性聚糖的 C-3、C-4 和 C-6 处糖基化的影响。模拟糖肽，其中化学酶促合成并与我们之前工作中使用的肽硫酯反应。这些研究表明，SAL 对含助剂的糖的延长糖基化敏感。虽然可以在 C-4 和 C-6 处进行延长糖基化的 SAL，但 C-3 处糖基化的存在阻止了连接的发生。此外，在 C-4 处进行糖基化时，连接效率受 N 端 AA 的影响，而肽硫酯的 C 端残基的性质似乎不会影响连接效率。这些研究为决定何时适合在复杂糖肽和糖蛋白的合成中使用 SAL 以及如何选择连接接头以获得最佳产量提供了有用的指导。而肽硫酯的