高特异性和强效(7 nM蜂窝IC 50直接从1260万成员DNA编码的小分子文库中鉴定了p38α激酶
抑制剂。这是通过使用高保真yoctoReactor技术(yR)来制备DNA编码的文库,以及均相筛选技术–结合剂捕获富集技术(BTE)来实现的。尽管在结构上不典型于其他激酶阻滞剂,但该
抑制剂已通过X射线晶体学发现与
ATP结合位点相互作用并提供了P环的强烈扭曲。值得注意的是,由于它缺乏已知激酶
抑制剂的关键功能(例如典型的铰链结合基序),因此采用了一种替代结合模式。有趣的是,通过与骨架形成铰链氢键,
抑制剂结合假定为典型的II型('DFG-out')结合模式,表现出出色的形状互补性,并形成了许多特定的极性相互作用。此外,晶体结构显示,尽管该化合物埋在p38α活性位点中,但其原始DNA连接点可通过扭曲的P环构象形成的通道进入。这项研究证明了DNA编码文库技术在鉴定具有替代结合模式的新
化学物质方面的可用性,从而为药物开发提供了良好的起点。