N-三氟乙酰基炔丙基胺 | 14719-21-2

• 物质功能分类: 生物 - 细胞培养 - 添加剂
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: N-三氟乙酰基炔丙基胺
• 英文名称: trifluoroacetyl-propargyl amine
• 英文别名: N-propargyltrifluoroacetamide；2,2,2-trifluoro-N-(prop-2-yn-1-yl)acetamide；2,2,2-trifluoro-N-prop-2-ynylacetamide
• CAS: 14719-21-2
• 化学式: C₅H₄F₃NO
• 分子量: 151.088
• InChiKey: GAUSMJHDHCSZOX-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  172.6±40.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.289±0.06 g/cm3(Predicted)
• 溶解度：
  可溶于氯仿、甲醇（少许）

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  10
• 可旋转键数：
  1
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  29.1
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

安全信息

• 危险等级：
  3
• 储存条件：
  存放于惰性气体中，避免与空气接触。

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-三氟乙酰基炔丙基胺 在 四(三苯基膦)钯 copper(l) iodide 、 铁粉 、 溶剂黄146 、 三乙胺 作用下， 以 甲苯 为溶剂， 反应 12.0h， 生成 tert-butyl N-[3-[5-amino-2-methoxy-3-[3-[(2,2,2-trifluoroacetyl)amino]prop-1-ynyl]phenyl]prop-2-ynyl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  A Linker Scaffold to Present Dimers of Pharmacophores Prepared by Solid-Phase Syntheses

  摘要：

  DOI：

  10.1002/1521-3773(20001201)39:23<4299::aid-anie4299>3.0.co;2-n
• 作为产物：
  描述：

  炔丙胺 在 盐酸 、 三氟乙酸酐 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 生成 N-三氟乙酰基炔丙基胺
  参考文献：
  名称：

  Substituted oxotremorine derivatives

  摘要：

  这份披露描述了具有氮、氧或硫基团的新型替代氧托莫林衍生物（化学式I），以及这些衍生物的前药形式。这些化合物具有胆碱能活性。还披露了利用这些化合物治疗哺乳动物中枢神经系统疾病的方法，含有这些化合物的药物制剂，以及这些化合物的生产过程。

  公开号：

  US05550257A1

文献信息

• A 7-Deazaadenosylaziridine Cofactor for Sequence-Specific Labeling of DNA by the DNA Cytosine-C5 Methyltransferase M.HhaI
  作者：Falk Kunkel、Rudi Lurz、Elmar Weinhold

  DOI：10.3390/molecules201119723

  日期：——

  transfer of the activated methyl group of the cofactor S-adenosyl-l-methionine (AdoMet or SAM) to the exocyclic amino groups of adenine or cytosine or the C5 ring atom of cytosine within specific DNA sequences. The DNA adenine-N6 MTase from Thermus aquaticus (M.TaqI) is also capable of coupling synthetic N-adenosylaziridine cofactor analogues to its target adenine within the double-stranded 5′-TCGA-3′

  DNA 甲基转移酶 (MTases) 催化辅助因子 S-腺苷-1-甲硫氨酸（AdoMet 或 SAM）的活化甲基转移到特定 DNA 序列中腺嘌呤或胞嘧啶的环外氨基或胞嘧啶的 C5 环原子。来自水生栖热菌 (M.TaqI) 的 DNA 腺嘌呤-N6 MTase 还能够将合成的 N-腺苷氮丙啶辅因子类似物与其双链 5'-TCGA-3' 序列内的靶腺嘌呤偶联。利用这种 M.TaqI 介导的偶联反应，使用在腺嘌呤环的 8 位带有报告基团的 N-腺苷氮丙啶衍生物，将荧光团和生物素序列特异性地传递到 DNA 中。然而，这些 8 修饰的氮丙啶辅因子是来自溶血性嗜血杆菌 (M.HhaI) 的 DNA 胞嘧啶-C5 MTase 的不良底物。基于 M 的晶体结构。HhaI 与双链寡脱氧核苷酸和辅因子产物复合，我们合成了稳定的 7-脱氮腺苷氮丙啶衍生物，生物素基团通过灵活的接头连接到 7 位。这种 7 修饰的氮丙啶辅因子可以被
• 7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法
  申请人：上海交通大学

  公开号：CN103819523B

  公开（公告）日：2016-02-10

  本发明公开了一种7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷的合成方法；所述方法包括如下步骤：式(III)化合物在碱性条件下去保护基得式(IV1)或(IV2)化合物；进一步去甲基得式(I)化合物，即所述7-去氮-7-卤素鸟嘌呤核苷；其中，R1为H或OH，R2为I、Br或Cl，R3为H或本发明合成的7-去氮-7-卤素-鸟嘌呤核苷是在DNA测序、标记、延伸等生物学领域广泛使用的基本原料，目前其销售价格很高，且合成方法复杂，难以控制；而本发明的合成方法所需原料简单易得，合成过程均为常规化学反应，可用于大规模推广使用。
• 3′-OH unblocked nucleotides and nucleosides base modified with non-cleavable, terminating groups and methods for their use in DNA sequencing
  申请人：LaserGen, Inc.

  公开号：US07893227B2

  公开（公告）日：2011-02-22

  Provided are novel nucleotides, nucleoside, and their derivatives described herein, that can be used in DNA sequencing technology and other types of DNA analysis. In one embodiment, the nucleotide or nucleoside with an unprotected 3′-OH group is derivatized at the nucleobase to include a fluorescent dye attached via a linker to a non-cleavable terminating group. The non-cleavable-fluorescent group is designed to terminate DNA synthesis so that DNA oligomers can be sequenced efficiently in a parallel format. These reagents and methods will lead to more accurate identification of polymorphisms and other valuable genetic information.

  提供的是本文描述的新型核苷酸、核苷和它们的衍生物，可用于DNA测序技术和其他类型的DNA分析。在一个实施例中，未保护的3'-OH基团的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生，包括通过连接剂连接到不可切断终止基团的荧光染料。不可切断的荧光基团被设计为终止DNA合成，以便DNA寡聚体可以以并行格式高效测序。这些试剂和方法将导致对多态性和其他有价值的遗传信息更准确的识别。
• Application of a Highly Robust and Efficient Fluorescence-Resonance-Energy-Transfer (FRET) System in DNA
  作者：Lilia Clima、Caroline Hirtz-Haag、Andrea Kienzler、Willi Bannwarth

  DOI：10.1002/hlca.200790107

  日期：2007.6

  feasibility study for the application of our newly developed highly efficient and robust fluorescence-resonance-energy-transfer (FRET) system to DNA. A 2′-oligodeoxynucleotide, 12, equipped with a quinolinone derivative as donor and a (bathophenanthroline)ruthenium(II) complex as acceptor and having a single uridine as potential cleavage site under basic conditions revealed an intensive FRET, which almost vanished

  我们报告了将我们最新开发的高效，鲁棒的荧光共振能量转移（FRET）系统应用于DNA的可行性研究。甲2'-脱氧寡核苷酸，12，配备有作为供体和一个（红菲绕啉）钌（II）配合物作为受体和具有单个尿苷作为在碱性条件下的潜在切割位点的喹啉酮衍生物显示一个密集的FRET，裂解后几乎消失在碱性条件下的寡核苷酸（图7）。此外，在分子信标（MB）DNA的排列中（参见13），在与靶序列杂交后，观察到FRET显着降低（图9）。）。由于Ru络合物的荧光衰减时间长，该系统允许进行高灵敏度的时间门控测量。
• 基于分子胶的荧光标记核苷酸及其在DNA测 序中的用途
  申请人：上海交通大学

  公开号：CN104693258B

  公开（公告）日：2017-12-08

  本发明公开了一种基于分子胶的荧光标记核苷酸及其在DNA测序中的用途；所述荧光标记核苷酸的结构式如式(Ⅰ)所示：，其中，R1为或R2为荧光素或dNTP为含四个不同的碱基的核苷三磷酸；荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、alexa、squarene染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种。本发明的荧光标记核苷酸可用于DNA测序；同时，本发明荧光标记核苷酸的合成所需原料简单易得，可用于大规模推广使用，并且生物学评价结果表明该类可逆终端能完全满足高通量测序的生化反应所有要求，具备很好的实用前景。