methyl (2,3-difluorobenzyl 5-acetamido-4,7,8-tri-O-acetyl-9-(4-chlorobenzamido)-3,5,9-trideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate | 1209012-78-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: methyl (2,3-difluorobenzyl 5-acetamido-4,7,8-tri-O-acetyl-9-(4-chlorobenzamido)-3,5,9-trideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate
• CAS: 1209012-78-1
• 化学式: C₃₂H₃₅ClF₂N₂O₁₂
• 分子量: 713.086
• InChiKey: XEWVPULFXJPOGZ-FHOLAVHPSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.52
• 重原子数：
  49.0
• 可旋转键数：
  13.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  181.86
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl (2,3-difluorobenzyl 5-acetamido-4,7,8-tri-O-acetyl-9-(4-chlorobenzamido)-3,5,9-trideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate 在 sodium methylate 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 2.0h， 以61%的产率得到methyl [(2,3-difluorobenzyl) 5-acetamido-9-(4-chlorobenzamido)-3,5,9-trideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid]onate
  参考文献：
  名称：

  MAG拮抗剂的动力学和热力学性质。

  摘要：

  截瘫是由中枢神经系统（CNS）受伤引起的，尤其是年轻人遭受这些严重后果的困扰，例如，运动功能丧失。受损神经链修复的缺乏源于中枢神经系统中轴突再生的抑制环境。特定的抑制蛋白可阻止神经根的再生。这些神经突生长抑制剂之一是髓磷脂相关糖蛋白（MAG），它是Siglec家族的成员（唾液酸结合免疫球蛋白样凝集素）。在以前的研究中，我们确定了有效的小分子MAG拮抗剂。在此通报中，我们报告了在4位和5位修饰的新神经氨酸衍生物，以及各种结构修饰对其动力学和热力学结合性质的影响。

  DOI：

  10.1016/j.carres.2010.03.010
• 作为产物：
  描述：

  methyl (2,3-difluorobenzyl 5-acetamido-4,7,8-tri-O-acetyl-9-azido-3,5,9-trideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)-onate 、 4-氯苯甲酰氯 在 三苯基膦 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 24.0h， 以55%的产率得到methyl (2,3-difluorobenzyl 5-acetamido-4,7,8-tri-O-acetyl-9-(4-chlorobenzamido)-3,5,9-trideoxy-D-glycero-α-D-galacto-2-nonulopyranosid)onate
  参考文献：
  名称：

  Low Molecular Weight Antagonists of the Myelin-Associated Glycoprotein: Synthesis, Docking, and Biological Evaluation

  摘要：

  The Injured adult mammalian central nervous system Is all inhibitory environment for axon regeneration due to specific inhibitors,among them the myelin-associated glycoprotein (MAG), a member of the Siglec family (sialic-acid binding immunoglobulin-like lectin). In earlier Studies, we identified the lead structure5, which shows a 250-fold improved in vitro affinity for MAG compared to the tetrasaccharide binding epitope of GQ1b alpha (1), the best physiological MAG ligand described so far. By modifying the 2- and 5-position, the affinity of 5 could be further improved to the nanomolar range (-> 19a). Docking Studies to a homology model of MAG allowed the rationalization of the experimental binding properties. Finally, pharmacokinetic parameters (stability in the cerebrospinal fluid, logD and Permeation through the BBB) indicate the drug-like properties of the high-affinity antagonist 19a.

  DOI：

  10.1021/jm901517k