N-[6-Dimethylamino-9-((2R,3aS,9aR)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-9H-purin-2-yl]-2-phenoxy-acetamide | 375345-69-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N-[6-Dimethylamino-9-((2R,3aS,9aR)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-9H-purin-2-yl]-2-phenoxy-acetamide
• CAS: 375345-69-0
• 化学式: C₃₂H₅₀N₆O₆Si₂
• 分子量: 670.957
• InChiKey: FHNWAABDZQPLID-ZRRKCSAHSA-N

物化性质

• 密度：
  1.23±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.15
• 重原子数：
  46.0
• 可旋转键数：
  10.0
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  122.09
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  11.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-[6-Dimethylamino-9-((2R,3aS,9aR)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-9H-purin-2-yl]-2-phenoxy-acetamide 在 吡啶 、 四丁基氟化铵 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 3.25h， 生成 Diisopropyl-phosphoramidous acid (2R,3S,5R)-2-[bis-(4-methoxy-phenyl)-phenyl-methoxymethyl]-5-[6-dimethylamino-2-(2-phenoxy-acetylamino)-purin-9-yl]-tetrahydro-furan-3-yl ester 2-cyano-ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of DNA Templates Containing the Fifth Base, 2-Amino-6-(dimethylamino)purine, for Specific Transcription Involving Unnatural Base Pairs

  摘要：

  一种非天然核碱基吡啶-2-酮（以 y 表示）可通过 T7 RNA 聚合酶特异性地与 DNA 模板中的 2-氨基-6-(二甲基氨基)嘌呤（以 x 表示）相对结合到 RNA 中。为了便于制备含有 x 的 DNA 模板，研究人员对 x 的 2-氨基保护基团进行了研究。虽然一般的 N2 保护基（如异丁酰基和乙酰基）在 55 ℃ 下用浓氨水处理 6 小时后不能去除，但 N2-苯氧基乙酰基却能成功地从受保护的低聚物中去除。这种 DNA 合成方法是一种有用的 DNA 模板制备方法，可用于在所需位置将非天然核苷通过酶结合到 RNA 中。

  DOI：

  10.1246/cl.2001.914
• 作为产物：
  描述：

  N-[9-((2R,3R,4S,5R)-3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-6-dimethylamino-9H-purin-2-yl]-2-phenoxy-acetamide 在 吡啶 、 偶氮二异丁腈 、 三正丁基氢锡 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 15.0h， 生成 N-[6-Dimethylamino-9-((2R,3aS,9aR)-5,5,7,7-tetraisopropyl-tetrahydro-1,4,6,8-tetraoxa-5,7-disila-cyclopentacycloocten-2-yl)-9H-purin-2-yl]-2-phenoxy-acetamide
  参考文献：
  名称：

  Synthesis of DNA Templates Containing the Fifth Base, 2-Amino-6-(dimethylamino)purine, for Specific Transcription Involving Unnatural Base Pairs

  摘要：

  一种非天然核碱基吡啶-2-酮（以 y 表示）可通过 T7 RNA 聚合酶特异性地与 DNA 模板中的 2-氨基-6-(二甲基氨基)嘌呤（以 x 表示）相对结合到 RNA 中。为了便于制备含有 x 的 DNA 模板，研究人员对 x 的 2-氨基保护基团进行了研究。虽然一般的 N2 保护基（如异丁酰基和乙酰基）在 55 ℃ 下用浓氨水处理 6 小时后不能去除，但 N2-苯氧基乙酰基却能成功地从受保护的低聚物中去除。这种 DNA 合成方法是一种有用的 DNA 模板制备方法，可用于在所需位置将非天然核苷通过酶结合到 RNA 中。

  DOI：

  10.1246/cl.2001.914