benzyl 2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-fucopyranosyl-(1→6)-3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside | 1071226-06-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: benzyl 2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-fucopyranosyl-(1→6)-3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside
• 英文别名: benzyl 2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-fucopyranosyl-(1->6)-3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside；2-[(2R,3R,4R,5S,6R)-5-hydroxy-6-[[(2R,3S,4R,5R,6S)-6-methyl-3,4,5-tris(phenylmethoxy)oxan-2-yl]oxymethyl]-2,4-bis(phenylmethoxy)oxan-3-yl]isoindole-1,3-dione
• CAS: 1071226-06-6
• 化学式: C₅₅H₅₅NO₁₁
• 分子量: 906.042
• InChiKey: IBOJZXRETDAIJF-ULXJMRRLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.3
• 重原子数：
  67
• 可旋转键数：
  19
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  131
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-phenyltrifluoracetimidate [2-O-acetyl-4,6-O-benzylidene-3-O-(2-methylnaphthyl)-β-Dmannopyranosyl]-(1→4)-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside 、 benzyl 2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-fucopyranosyl-(1→6)-3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside 在 三氟甲磺酸三甲基硅酯 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.75h， 以91%的产率得到benzyl [2-O-acetyl-4,6-O-benzylidene-3-O-(2-methylnaphthyl)-β-D-mannopyranosyl]-(1→4)-3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranosyl-(1→4)-2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-fucopyranosyl-(1→6)-3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  曼氏疟原虫复合 N-聚糖的化学酶法合成研究表位呈现对 DC-SIGN 识别的重要性

  摘要：

  多价对N-聚糖-蛋白质相互作用的重要性主要是通过将最小表位连接到人工多价支架上而不是在多触角聚糖的背景下进行研究。N-聚糖可以通过将 GlcNAc、核心木糖苷和岩藻糖苷以及扩展的N-乙酰乳糖胺部分一分为二来修饰。这种修饰对聚糖识别的影响也不是很清楚。我们在这里描述了一种化学酶学方法，可以提供由寄生蠕虫S. mansoni表达的N-聚糖在每个天线上具有独特的表位并含有核心木糖苷。核磁共振、计算和电子显微镜被用来研究人类凝集素 DC-SIGN 对聚糖的识别。结果表明，核心木糖苷不影响末端表位识别。与单价对应物相比，多触角聚糖对 DC-SIGN 的亲和力更高，这归因于邻近诱导的有效浓度。多触角聚糖将 DC-SIGN 交联成一个密集的网络，这可能与抗原摄取和细胞内路由有关。

  DOI：

  10.1002/anie.202105647
• 作为产物：
  描述：

  benzyl 3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside 、 p-methylphenyl 2,3,4-tri-O-benzyl-1-thio-β-L-fucopyranoside 在 四丁基溴化铵 、 copper(ll) bromide 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 17.0h， 以75%的产率得到benzyl 2,3,4-tri-O-benzyl-α-L-fucopyranosyl-(1→6)-3-O-benzyl-2-deoxy-2-phthalimido-β-D-glucopyranoside
  参考文献：
  名称：

  基于预激活的α-(2,3)-唾液酸化核心-岩藻糖基化复合型双触角N-聚糖十二糖的一锅法合成。

  摘要：

  N-聚糖的合成由于其重要的生物学特性而引起了当前的高度关注。开发了一种基于预激活方法的高效收敛策略，用于组装复合型核心岩藻糖基化双触角N-聚糖十二糖。通过逆合成，这个极具挑战性的目标被分解为三个模块：唾液酸二糖、葡萄糖胺结构单元和六糖二醇受体。在硫代半乳糖苷受体存在下，通过选择性激活新的 5-N-三氯乙酰基保护的唾液酸供体，可以轻松获得唾液酸二糖。六糖二醇模块是通过岩藻糖基化四糖受体的双甘露糖基化产生的，而岩藻糖基化四糖受体又是通过α-岩藻糖基化二糖与含有β-甘露糖的二糖供体的糖基化产生的。三个模块的结合在一锅中进行，以高产率得到完全保护的十二糖。该合成的特点是对寡糖中间体进行最少的保护基团和苷元调整，从而大大提高了整体合成效率。该策略的模块化特征表明该方法可以很容易地适应多种 N-聚糖结构的合成。

  DOI：

  10.1002/chem.200800757

文献信息

• <i>β</i> -Mannosylation through <i>O</i> -Alkylation of Anomeric Cesium Alkoxides: Mechanistic Studies and Synthesis of the Hexasaccharide Core of Complex Fucosylated N-Linked Glycans
  作者：Shuai Meng、Bishwa Raj Bhetuwal、Hai Nguyen、Xiaotian Qi、Cheng Fang、Kevin Saybolt、Xiaohua Li、Peng Liu、Jianglong Zhu

  DOI：10.1002/ejoc.202000313

  日期：2020.4.23

  analysis suggested that monomeric cesium alkoxides be the key reactive species for alkylation with electrophiles. DFT calculations supported that oxygen atoms at C2, C3, and C6 of mannose promote the deprotonation of the anomeric hydroxyl group by Cs2CO3 and chelating interactions between Cs and these oxygen atoms favour the formation of equatorial anomeric alkoxides, leading to the highly β-selective anomeric

  许多结构不同的 D-甘露糖衍生的内醇，包括各种脱氧-D-甘露糖和构象受限的双环 D-甘露糖，已被合成并在通过 Cs2CO3 介导的异头 O-烷基化的 β-甘露糖基化机理研究中进行了研究。发现脱氧甘露糖或构象受限的双环 D-甘露糖不如它们相应的母体甘露糖具有反应性。当 C2-OH 处于游离状态时，这种类型的 β-甘露糖基化会有效地进行，保护它会导致较差的结果。D-甘露糖衍生的异头铯醇盐的 NMR 研究表明去质子化后赤道 β-异头物占优势。反应进程动力学分析表明单体铯醇盐是与亲电试剂烷基化的关键反应物种。DFT 计算支持甘露糖 C2、C3 和 C6 处的氧原子促进 Cs2CO3 对异头羟基的去质子化，并且 Cs 和这些氧原子之间的螯合相互作用有利于形成赤道异头醇盐，导致高度 β 选择性异头O-烷基化。基于实验数据和计算结果，提出了这种β-甘露糖基化的修正机制。复杂岩藻糖基化 N-连接聚糖的六糖核心的有效合成证明了这种
• Pre-Activation-Based One-Pot Synthesis of an α-(2,3)-Sialylated Core-Fucosylated Complex Type Bi-Antennary N-Glycan Dodecasaccharide
  作者：Bin Sun、Balasubramanian Srinivasan、Xuefei Huang

  DOI：10.1002/chem.200800757

  日期：2008.8.8

  Synthesis of N-glycans is of high current interests due to their important biological properties. A highly efficient convergent strategy based on the pre-activation method for assembly of the complex type core fucosylated bi-antennary N-glycan dodecasaccharide has been developed. Retrosynthetically, this extremely challenging target is broken down to three modules: a sialyl disaccharide, a glucosamine

  N-聚糖的合成由于其重要的生物学特性而引起了当前的高度关注。开发了一种基于预激活方法的高效收敛策略，用于组装复合型核心岩藻糖基化双触角N-聚糖十二糖。通过逆合成，这个极具挑战性的目标被分解为三个模块：唾液酸二糖、葡萄糖胺结构单元和六糖二醇受体。在硫代半乳糖苷受体存在下，通过选择性激活新的 5-N-三氯乙酰基保护的唾液酸供体，可以轻松获得唾液酸二糖。六糖二醇模块是通过岩藻糖基化四糖受体的双甘露糖基化产生的，而岩藻糖基化四糖受体又是通过α-岩藻糖基化二糖与含有β-甘露糖的二糖供体的糖基化产生的。三个模块的结合在一锅中进行，以高产率得到完全保护的十二糖。该合成的特点是对寡糖中间体进行最少的保护基团和苷元调整，从而大大提高了整体合成效率。该策略的模块化特征表明该方法可以很容易地适应多种 N-聚糖结构的合成。
• Chemoenzymatic Synthesis of Complex <i>N</i> ‐Glycans of the Parasite <i>S. mansoni</i> to Examine the Importance of Epitope Presentation on DC‐SIGN recognition
  作者：Apoorva D. Srivastava、Luca Unione、Mehman Bunyatov、Ivan A. Gagarinov、Sandra Delgado、Nicola G. A. Abrescia、Ana Ardá、Geert‐Jan Boons

  DOI：10.1002/anie.202105647

  日期：2021.8.23

  multivalent scaffold and not in the context of multi-antennary glycans. N-glycans can be modified by bisecting GlcNAc, core xylosides and fucosides, and extended N-acetyl lactosamine moieties. The impact of such modifications on glycan recognition are also not well understood. We describe here a chemoenzymatic methodology that can provide N-glycans expressed by the parasitic worm S. mansoni having unique epitopes

  多价对N-聚糖-蛋白质相互作用的重要性主要是通过将最小表位连接到人工多价支架上而不是在多触角聚糖的背景下进行研究。N-聚糖可以通过将 GlcNAc、核心木糖苷和岩藻糖苷以及扩展的N-乙酰乳糖胺部分一分为二来修饰。这种修饰对聚糖识别的影响也不是很清楚。我们在这里描述了一种化学酶学方法，可以提供由寄生蠕虫S. mansoni表达的N-聚糖在每个天线上具有独特的表位并含有核心木糖苷。核磁共振、计算和电子显微镜被用来研究人类凝集素 DC-SIGN 对聚糖的识别。结果表明，核心木糖苷不影响末端表位识别。与单价对应物相比，多触角聚糖对 DC-SIGN 的亲和力更高，这归因于邻近诱导的有效浓度。多触角聚糖将 DC-SIGN 交联成一个密集的网络，这可能与抗原摄取和细胞内路由有关。