13-oxoverruculogen | 1054470-71-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 13-oxoverruculogen
• 英文别名: (9R,14S,17S,23R)-23-hydroxy-5-methoxy-12,12-dimethyl-9-(2-methylprop-1-enyl)-10,11-dioxa-8,15,21-triazahexacyclo[12.10.1.02,7.08,25.015,23.017,21]pentacosa-1(25),2(7),3,5-tetraene-16,22,24-trione
• CAS: 1054470-71-1
• 化学式: C₂₇H₃₁N₃O₇
• 分子量: 509.559
• InChiKey: UZFGSEBLPZQQGI-WUBMGLGTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  37
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.52
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  13-oxoverruculogen 在 ferrous(II) sulfate heptahydrate 、 抗坏血酸 作用下， 以 二甲基亚砜 为溶剂， 以14 %的产率得到Tr-2 真菌毒素
  参考文献：
  名称：

  使用底物类似物剖析非血红素铁内过氧化物酶 FtmOx1 的机制

  摘要：

  FtmOx1 是一种非血红素铁 (NHFe) 内过氧化物酶，在体外条件下催化三种不同的反应：内过氧化、乙醇脱氢和脱烷基化；多样性使其机理研究复杂化。在这项研究中，我们使用两种底物类似物将 FtmOx1 催化的反应简化为脱烷基化或醇脱氢反应，以进行结构-功能关系分析，以解决两个关键的 FtmOx1 机制问题：(1) Y224 在拟议的类 COX 中翻转模型与 CarC 类机械模型中提出的 α-酮戊二酸 (αKG) 旋转和 (2) Y224 自由基（COX 类模型）或 Y68 自由基（CarC 类模型）参与 FtmOx1 催化。当 13-oxo-fumitremorgin B ( 7) 用作底物，FtmOx1-催化从内过氧化反应转变为羟基化反应并导致脱烷基化。此外，与类 COX 模型预测中的脱烷基化副反应一致，FtmOx1•Co II •αKG• 7三元复合物的 X 射线结构显示 Y224 翻转为相对于

  DOI：

  10.1021/jacsau.2c00248
• 作为产物：
  描述：

  烟曲酶毒素B 在 氧气 、 2-氧代-戊二酸离子(2-) 、 铁粉 、 nonheme iron endoperoxidase FtmOx₁ Y₂₂₄F mutant 作用下， 以 aq. buffer 为溶剂， 反应 1.0h， 生成 13-oxoverruculogen
  参考文献：
  名称：

  使用底物类似物剖析非血红素铁内过氧化物酶 FtmOx1 的机制

  摘要：

  FtmOx1 是一种非血红素铁 (NHFe) 内过氧化物酶，在体外条件下催化三种不同的反应：内过氧化、乙醇脱氢和脱烷基化；多样性使其机理研究复杂化。在这项研究中，我们使用两种底物类似物将 FtmOx1 催化的反应简化为脱烷基化或醇脱氢反应，以进行结构-功能关系分析，以解决两个关键的 FtmOx1 机制问题：(1) Y224 在拟议的类 COX 中翻转模型与 CarC 类机械模型中提出的 α-酮戊二酸 (αKG) 旋转和 (2) Y224 自由基（COX 类模型）或 Y68 自由基（CarC 类模型）参与 FtmOx1 催化。当 13-oxo-fumitremorgin B ( 7) 用作底物，FtmOx1-催化从内过氧化反应转变为羟基化反应并导致脱烷基化。此外，与类 COX 模型预测中的脱烷基化副反应一致，FtmOx1•Co II •αKG• 7三元复合物的 X 射线结构显示 Y224 翻转为相对于

  DOI：

  10.1021/jacsau.2c00248

文献信息

• Gene Disruption and Biochemical Characterization of Verruculogen Synthase of Aspergillus fumigatus
  作者：Naoki Kato、Hirokazu Suzuki、Hiroshi Takagi、Masakazu Uramoto、Shunji Takahashi、Hiroyuki Osada

  DOI：10.1002/cbic.201000562

  日期：2011.3.21

  Three in one: Verruculogen synthase FtmF is a key enzyme to diversify the fumitremorgin biosynthetic pathway in Aspergillus fumigatus: FtmF catalyzes not only endoperoxide bond formation of verruculogen but also the deprenylation and oxidation of fumitremorgin B to yield 12α,13α‐dihydroxyfumitremorgin C and 13‐oxoverruculogen, respectively.

  三合一： Verruculogen合酶FtmF是使烟曲霉中Fumitremorgin生物合成途径多样化的关键酶：FtmF不仅催化Verruculogen的内过氧化物键形成，而且催化Fumitremorgin B的去异戊二烯化和氧化，从而生成12α，13α-dihydroxyfumitrerere氧过金红霉素分别。
• Chemoenzymatic Synthesis of 13-Oxoverruculogen
  作者：Jun Yang、Brandon Singh、Gabriel Cohen、Chi P. Ting

  DOI：10.1021/jacs.3c07078

  日期：2023.9.6

  endoperoxidation by verruculogen synthase, FtmOx1. The resulting product, 13-epi-verruculogen, is the first unnatural endoperoxide generated by FtmOx1 and is used in the first synthesis of 13-oxoverruculogen. This strategy enables a 10-step synthesis of this natural product from commercially available starting materials and illustrates a hybrid approach utilizing biocatalytic and transition-metal-catalyzed reactions

  Verruculogens 是一种罕见的 Fumitremorgin 生物碱，含有一种非常不寻常的八元内过氧化物。在本文中，我们报告了一种简明的化学酶法合成 13-oxoverruculogen，使用酶促 C-H 过氧化和铑催化的 C-C 键活化反应，分别安装八元内过氧化物和天然产物的五环核心。我们的策略涉及使用 13- epi -fumitremorgin B 作为底物类似物，通过疣菌原合酶 FtmOx1 进行内过氧化。所得产物 13- epi -verruculogen 是 FtmOx1 产生的第一个非天然内过氧化物，用于首次合成 13-oxoverruculogen。该策略能够从市售起始材料中分 10 步合成这种天然产物，并说明了利用生物催化和过渡金属催化反应来获得具有挑战性的生物碱结构的混合方法。此外，这项工作证明了使用天然酶混杂作为天然产物化学酶合成的可行策略。
• Dissecting the Mechanism of the Nonheme Iron Endoperoxidase FtmOx1 Using Substrate Analogues
  作者：Guoliang Zhu、Wupeng Yan、Xinye Wang、Ronghai Cheng、Nathchar Naowarojna、Kun Wang、Jun Wang、Heng Song、Yuyang Wang、Hairong Liu、Xuekui Xia、Catherine E. Costello、Xueting Liu、Lixin Zhang、Pinghua Liu

  DOI：10.1021/jacsau.2c00248

  日期：2022.7.25

  FtmOx1-catalysis changes from the endoperoxidation to a hydroxylation reaction and leads to dealkylation. In addition, consistent with the dealkylation side-reaction in the COX-like model prediction, the X-ray structure of the FtmOx1•CoII•αKG•7 ternary complex reveals a flip of Y224 to an alternative conformation relative to the FtmOx1•FeII•αKG binary complex. Verruculogen (2) was used as a second substrate analogue

  FtmOx1 是一种非血红素铁 (NHFe) 内过氧化物酶，在体外条件下催化三种不同的反应：内过氧化、乙醇脱氢和脱烷基化；多样性使其机理研究复杂化。在这项研究中，我们使用两种底物类似物将 FtmOx1 催化的反应简化为脱烷基化或醇脱氢反应，以进行结构-功能关系分析，以解决两个关键的 FtmOx1 机制问题：(1) Y224 在拟议的类 COX 中翻转模型与 CarC 类机械模型中提出的 α-酮戊二酸 (αKG) 旋转和 (2) Y224 自由基（COX 类模型）或 Y68 自由基（CarC 类模型）参与 FtmOx1 催化。当 13-oxo-fumitremorgin B ( 7) 用作底物，FtmOx1-催化从内过氧化反应转变为羟基化反应并导致脱烷基化。此外，与类 COX 模型预测中的脱烷基化副反应一致，FtmOx1•Co II •αKG• 7三元复合物的 X 射线结构显示 Y224 翻转为相对于