N-isobutyryl-3',5'-di-O-levulinyl-2'-deoxyguanosine | 440327-43-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N-isobutyryl-3',5'-di-O-levulinyl-2'-deoxyguanosine
• 英文别名: [(2R,3S,5R)-5-[2-(2-methylpropanoylamino)-6-oxo-1H-purin-9-yl]-3-(4-oxopentanoyloxy)oxolan-2-yl]methyl 4-oxopentanoate
• CAS: 440327-43-5
• 化学式: C₂₄H₃₁N₅O₉
• 分子量: 533.538
• InChiKey: VNUHPDDOJNVITO-GVDBMIGSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.8
• 重原子数：
  38
• 可旋转键数：
  14
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  184
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-isobutyryl-3',5'-di-O-levulinyl-2'-deoxyguanosine 在 phosphate buffer 、 Pseudomonas cepacia lipase 作用下， 以 1,4-二氧六环 为溶剂， 反应 28.0h， 以93%的产率得到N²-isobutyryl-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  寡核苷酸溶液相合成的基本组成部分：使用酶促方法对3'，5'-Di-O-乙酰丙氨酰核苷进行区域选择性水解。

  摘要：

  通过区域选择性酶水解反应，由相应的3'，5'-二-O-乙酰丙酰衍生物开发了一种简便的3'-和5'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷合成方法，避免了一些繁琐的化学保护/脱保护步骤。因此，发现南极假丝酵母脂肪酶B（CAL-B）选择性地水解5'-乙酰丙酸酯，以> 80％的分离产率提供3'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷3。另一方面，固定化的假单胞菌洋葱脂肪酶（PSL-C）和南极假丝酵母脂肪酶A（CAL-A）在3'-位置对水解表现出相反的选择性，从而在> 70的情况下提供5'-O-乙酰丙酰衍生物4 ％产率。相似的水解过程已成功扩展到3'-和5'-O-乙酰丙氨酰保护的2'的合成 -O-烷基核糖核苷7和8。这项工作首次证明了商业CAL-B和PSL-C在乙酰丙酸酯的区域选择性水解方面具有优异的选择性和产率。值得注意的是，受保护的胞苷和腺苷碱衍生物不足以用作用CAL-B进行酶促水解的底物，而PSL-C能够在选择

  DOI：

  10.1021/jo020080k
• 作为产物：
  描述：

  乙酰丙酸 、 alkaline earth salt of/the/ methylsulfuric acid 在 Pseudomonas cepacia lipase 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 为溶剂， 反应 14.5h， 生成 N-isobutyryl-3',5'-di-O-levulinyl-2'-deoxyguanosine
  参考文献：
  名称：

  Novel enzymatic synthesis of levulinyl protected nucleosides useful for solution phase synthesis of oligonucleotides

  摘要：

  An efficient synthesis of 3' and 5'-O-levulinyl-2'-deoxy- and 2'-O-alkylribonucleosides has been developed front appropriate nucleosides by enzyme-catalyzed regioselective acylation in organic solvents. Several lipases were screened in combination with acetonoxime levulinate as an acylating agent. Immobilized Pseudomonas cepacia lipase (PSL-C) was selected for acylation of the 3'-hydroxyl group in nucleosides, furnishing 3'-O-levulinylated products 1 and 3 in excellent yields. Similarly, Candida antarctica lipase B (CAL-B) provided 5'-O-levulinyl nucleosides 2 and 4 in high yields. Base-protected cytidine and adenosine analogs were found to be good substrates for lipase-mediated acylations. To demonstrate the industrial utility of this method, 3'-O-levulinyl thymidine and N-2-Ibu-5'-O-levulinyl-2'deoxygunaosine were synthesized on a 25 g scale. Additionally, PSL-C was reused to make the processes further economical. (C) 2003 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tetasy.2003.07.009

文献信息

• Building Blocks for the Solution Phase Synthesis of Oligonucleotides:  Regioselective Hydrolysis of 3‘,5‘-Di-<i>O</i>-levulinylnucleosides Using an Enzymatic Approach
  作者：Javier García、Susana Fernández、Miguel Ferrero、Yogesh S. Sanghvi、Vicente Gotor

  DOI：10.1021/jo020080k

  日期：2002.6.1

  opposite selectivity toward the hydrolysis at the 3'-position, affording 5'-O-levulinyl derivatives 4 in >70% yields. A similar hydrolysis procedure was successfully extended to the synthesis of 3'- and 5'-O-levulinyl-protected 2'-O-alkylribonucleosides 7 and 8. This work demonstrates for the first time application of commercial CAL-B and PSL-C toward regioselective hydrolysis of levulinyl esters with excellent

  通过区域选择性酶水解反应，由相应的3'，5'-二-O-乙酰丙酰衍生物开发了一种简便的3'-和5'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷合成方法，避免了一些繁琐的化学保护/脱保护步骤。因此，发现南极假丝酵母脂肪酶B（CAL-B）选择性地水解5'-乙酰丙酸酯，以> 80％的分离产率提供3'-O-乙酰丙酰-2'-脱氧核苷3。另一方面，固定化的假单胞菌洋葱脂肪酶（PSL-C）和南极假丝酵母脂肪酶A（CAL-A）在3'-位置对水解表现出相反的选择性，从而在> 70的情况下提供5'-O-乙酰丙酰衍生物4 ％产率。相似的水解过程已成功扩展到3'-和5'-O-乙酰丙氨酰保护的2'的合成 -O-烷基核糖核苷7和8。这项工作首次证明了商业CAL-B和PSL-C在乙酰丙酸酯的区域选择性水解方面具有优异的选择性和产率。值得注意的是，受保护的胞苷和腺苷碱衍生物不足以用作用CAL-B进行酶促水解的底物，而PSL-C能够在选择
• Building blocks for the solution phase synthesis of oligonucleotides
  申请人：——

  公开号：US20020142307A1

  公开（公告）日：2002-10-03

  The present invention is directed to methods for the preparation of 3′—O and 5′—O—levulinyl nucleosides from common precursors using an enzymatic approach.

  本发明涉及用酶法从普通前体制备 3′-O 和 5′-O-levulinyl 核苷的方法。
• EP1379536A4
  申请人：——

  公开号：EP1379536A4

  公开（公告）日：2007-07-25
• BUILDING BLOCKS FOR THE SOLUTION PHASE SYNTHESIS OF OLIGONUCLEOTIDES
  申请人：ISIS Pharmaceuticals, Inc.

  公开号：EP1379536A1

  公开（公告）日：2004-01-14
• US6677120B2
  申请人：——

  公开号：US6677120B2

  公开（公告）日：2004-01-13