N-α-(fluorenylmethoxy)carbonyl-(S-triphenylmethyl)-D-cysteinyl-(O-t-butyldimethylsilyl)-L-threonine methyl ester | 620567-49-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-α-(fluorenylmethoxy)carbonyl-(S-triphenylmethyl)-D-cysteinyl-(O-t-butyldimethylsilyl)-L-threonine methyl ester
• 英文别名: Fmoc-D-Cys(Tr)-L-Thr(TBS)-OMe；Fmoc-D-Cys(Trt)-Thr(TBDMS)-OMe；methyl (2S,3R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-2-[[(2S)-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-3-tritylsulfanylpropanoyl]amino]butanoate
• CAS: 620567-49-9
• 化学式: C₄₈H₅₄N₂O₆SSi
• 分子量: 815.118
• InChiKey: HFUHYVMXQDSVDX-JTYXNMJTSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.69
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.31
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-α-(fluorenylmethoxy)carbonyl-(S-triphenylmethyl)-D-cysteinyl-(O-t-butyldimethylsilyl)-L-threonine methyl ester 在 lithium hydroxide 、 (benzotriazo-1-yloxy)tris(dimethylamino)phosphonium hexafluorophosphate 、 1-羟基苯并三唑 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 二乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 54.0h， 生成 (7R,11R,14R,17S,20S,E)-20-[(R)-1-(tert-butyldimethylsiloxy)ethyl]-7-hydroxy-11,14-diisopropyl-9,12,15,18-tetraoxo-1,1,1-triphenyl-17-tritylthiomethyl-2-thia-10,13,16,19-tetraazahenicos-5-en-21-oic acid
  参考文献：
  名称：

  十肽FR-901375的全合成。

  摘要：

  已经实现了FR-901375的首次全合成，这是一种从绿假单胞菌第2522号发酵液中分离出的新型双环二肽。合成方法涉及13个反应步骤，总产率为12％。成功的合成策略中的关键点是关键结构单元（3R，4E）-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸的简明不对称合成，温和的Mitsunobu宏观内酯化步骤以及I（2）-介导的脱保护作用，同时形成二硫键。

  DOI：

  10.1021/jo034765b
• 作为产物：
  描述：

  L-苏氨酸甲酯 在 27 咪唑 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.0h， 生成 N-α-(fluorenylmethoxy)carbonyl-(S-triphenylmethyl)-D-cysteinyl-(O-t-butyldimethylsilyl)-L-threonine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  十肽FR-901375的全合成。

  摘要：

  已经实现了FR-901375的首次全合成，这是一种从绿假单胞菌第2522号发酵液中分离出的新型双环二肽。合成方法涉及13个反应步骤，总产率为12％。成功的合成策略中的关键点是关键结构单元（3R，4E）-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸的简明不对称合成，温和的Mitsunobu宏观内酯化步骤以及I（2）-介导的脱保护作用，同时形成二硫键。

  DOI：

  10.1021/jo034765b

文献信息

• Total Synthesis of the Depsipeptide FR901375 and Preliminary Evaluation of Its Biological Activity
  作者：Koichi Narita、Yuya Katoh、Ken-ichi Ojima、Singo Dan、Takao Yamori、Akihiro Ito、Minoru Yoshida、Tadashi Katoh

  DOI：10.1002/ejoc.201601023

  日期：2016.12

  The bicyclic depsipeptide FR901375 was efficiently synthesized in a highly convergent manner. The synthesis involved the condensation of a d-valine–d-valine–d-cysteine-containing segment with a (3S,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-4-heptenoic acid–l-threonine-containing segment to directly assemble the corresponding seco-amino acid, followed by cyclization to construct the desired 16-membered macrocyclic ring

  双环缩肽 FR901375 以高度收敛的方式有效合成。该合成涉及将含有 d-缬氨酸-d-缬氨酸-d-半胱氨酸的片段与含有 (3S,4E)-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸-l-苏氨酸的片段直接缩合为组装相​​应的 seco-氨基酸，然后环化以构建所需的 16 元大环。合成的 FR901375 的效力在组蛋白脱乙酰酶 (HDAC) 抑制和细胞生长抑制试验中确定，并将结果与​​临床批准的缩酚肽 FK228（罗米地辛）的结果进行比较。发现 FR901375 对 I 类 HDAC 1 (GI50 = 1.7 nm) 比 II 类 HDAC 6 (GI50 = 1627 nm) 显示出极高的选择性（957 倍），并显示低纳摩尔区域的细胞生长抑制 GI50 值。此外，揭示了双环缩酚肽 HDAC 抑制剂的构效关系的新方面。
• Total Synthesis of the Depsipeptide FR-901375
  作者：Yanping Chen、Celine Gambs、Yoshito Abe、Paul Wentworth,、Kim D. Janda

  DOI：10.1021/jo034765b

  日期：2003.11.1

  The first total synthesis of FR-901375, a novel bicyclic depsipeptide isolated from the fermentation broth of Pseudomonas chloroaphis No. 2522, has been achieved. The synthetic approach involves 13 reaction steps and is achieved in 12% overall yield. The key points in the successful synthetic strategy are a concise asymmetric synthesis of the key building block (3R,4E)-3-hydroxy-7-mercapto-4-heptenoic

  已经实现了FR-901375的首次全合成，这是一种从绿假单胞菌第2522号发酵液中分离出的新型双环二肽。合成方法涉及13个反应步骤，总产率为12％。成功的合成策略中的关键点是关键结构单元（3R，4E）-3-羟基-7-巯基-4-庚烯酸的简明不对称合成，温和的Mitsunobu宏观内酯化步骤以及I（2）-介导的脱保护作用，同时形成二硫键。