[(2R,3R,4R,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-3,4-dibenzoyloxy(513C)oxolan-2-yl]methyl benzoate | 144963-49-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-3,4-dibenzoyloxy(513C)oxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 144963-49-5
• 化学式: C₃₈H₂₉N₅O₈
• 分子量: 684.666
• InChiKey: KMEKEYIHPVLOJK-BZDIVKFASA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6
• 重原子数：
  51
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.13
• 拓扑面积：
  161
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-3,4-dibenzoyloxy(513C)oxolan-2-yl]methyl benzoate 在 sodium hydroxide 、 氟化氢吡啶 、 silver nitrate 作用下， 以 吡啶 、 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 生成 N-(9-((2R,3R,4R,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl-2-13C)-9H-purin-6-yl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  D- [1'-13C]-核糖核苷的高效合成方法，可并入寡聚RNA。

  摘要：

  提出了用于从D- [1-13C]核糖固相合成特定的1'-13C标记的寡核糖核苷酸的单体结构单元的合成。该方法已用于选择性形成2'-O-甲硅烷基化的核糖核苷。在5'-O-二甲氧基三苯甲基化之后，已经实现了D- [1'-13C]核糖核苷亚磷酰胺的合成。

  DOI：

  10.1081/ncn-100002463
• 作为产物：
  描述：

  1-O-methyl-β-D-[1-13C]ribofuranoside 在 吡啶 、 三氟甲磺酸三甲基硅酯 、 硫酸 、 溶剂黄146 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 氯仿 为溶剂， 反应 21.0h， 生成 [(2R,3R,4R,5R)-5-(6-benzamidopurin-9-yl)-3,4-dibenzoyloxy(513C)oxolan-2-yl]methyl benzoate
  参考文献：
  名称：

  13C-Enriched ribonucleosides：合成和应用 13C-1H 和 13C-13C 自旋耦合常数来评估呋喃糖和 N-糖苷键构象

  摘要：

  腺苷 (1)、胞苷 (2)、鸟苷 (3) 和尿苷 (4) 已通过化学方法制备，在核糖环的 C1{prime} 和 C2{prime} 处 {sup 13}C 富集（99 原子%） . 已开发出可靠的合成方案，以允许获得稳定同位素标记寡核苷酸的结构研究和体内代谢研究所需的毫摩尔数量的标记核糖核苷。获得了富集核糖核苷的高分辨率{sup 1}H和{sup 13}C NMR谱，{sup 13}C-{sup 13}C和{sup 13}C-{sup 1}H自旋-已经测量了{β}-D-呋喃核糖环内和穿过N-糖苷键的途径的偶联常数。在甲基 {α}- 和 {β}-D-核硼苷 (5,6) 以及两种构象受限的核苷 2 中确定了相关偶联，2{prime}-anhydro-(1-{beta}-D-arabinofuranosyl)uracil (7) 和 2{prime},3{prime}-O-isopropylidene-2

  DOI：

  10.1021/ja00176a043

文献信息

• PhenylsulfenylD-ribofuranosides as efficient ribosyl donors: Application to the synthesis of [1′,-13C]-(deoxy)nucleosides
  作者：Luc Chanteloup、Jean-Marie Beau

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)79089-7

  日期：1992.9

  Readily available phenylsulfenyl 2,3,5-tri-O-benzoyl-beta-D-ribofuranoside glycosylates silylated nucleobases in a fast, high-yielding and stereoselective reaction promoted by trimethylsilyl trifluoromethanesulfonate. The method has been applied to the synthesis of [1'-C-13] labelled nucleosides further transformed to building blocks ready for oligodeoxynucleotide construction.
• 13C-Enriched ribonucleosides: synthesis and application of 13C-1H and 13C-13C spin-coupling constants to assess furanose and N-glycoside bond conformations
  作者：Paul C. Kline、Anthony S. Serianni

  DOI：10.1021/ja00176a043

  日期：1990.9

  3prime}-O-isopropylidene-2,5prime}-O-cyclouridine (8). The latter data were used to construct a crude Karplus curve for the sup 13}C-C-N-sup 13}C coupling pathway across the N-glycoside bond in 1-4. sup 1}H-sup 1}H, sup 13}C-sup 1}H, and sup 13}C-sup 13}C coupling data are used to evaluate current models describing the conformational dynamics of 1-4 in aqueous solution.

  腺苷 (1)、胞苷 (2)、鸟苷 (3) 和尿苷 (4) 已通过化学方法制备，在核糖环的 C1prime} 和 C2prime} 处 sup 13}C 富集（99 原子%） . 已开发出可靠的合成方案，以允许获得稳定同位素标记寡核苷酸的结构研究和体内代谢研究所需的毫摩尔数量的标记核糖核苷。获得了富集核糖核苷的高分辨率sup 1}H和sup 13}C NMR谱，sup 13}C-sup 13}C和sup 13}C-sup 1}H自旋-已经测量了β}-D-呋喃核糖环内和穿过N-糖苷键的途径的偶联常数。在甲基 α}- 和 β}-D-核硼苷 (5,6) 以及两种构象受限的核苷 2 中确定了相关偶联，2prime}-anhydro-(1-beta}-D-arabinofuranosyl)uracil (7) 和 2prime},3prime}-O-isopropylidene-2
• EFFICIENT SYNTHESIS OF<scp>D</scp>-[1′-¹³C]-RIBONUCLEOSIDES FOR INCORPORATION INTO OLIGO-RNA
  作者：Y. Saito、A. Nyilas、L. A. Agrofoglio

  DOI：10.1081/ncn-100002463

  日期：2001.3.31

  Syntheses of the monomer building blocks used for the solid-phase synthesis of specifically 1'-13C-labeled oligoribonucleotides from the D-[1-13C]ribose is presented. Procedure has been used for the selective formation of 2'-O-silylated ribonucleosides. After 5'-O-dimethoxytritylation, the synthesis of D-[1'-13C] ribonucleoside phosphoramidites has been achieved.

  提出了用于从D- [1-13C]核糖固相合成特定的1'-13C标记的寡核糖核苷酸的单体结构单元的合成。该方法已用于选择性形成2'-O-甲硅烷基化的核糖核苷。在5'-O-二甲氧基三苯甲基化之后，已经实现了D- [1'-13C]核糖核苷亚磷酰胺的合成。