DNA荧光探针前驱体,DNA小沟配体 | 464892-44-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 唑类
• 中文名称: DNA荧光探针前驱体,DNA小沟配体
• 英文名称: 4-(1-methylimidazole-2-carboxamido)-1-methylimidazole-2-carboxylic acid
• 英文别名: 1-methyl-4-{[(1-methyl-1H-imidazol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-imidazole-2-carboxylic acid；1-methyl-4-[(1-methyl-1H-imidazole-2-carbonyl)-amino]-1H-imidazole-2-carboxylic acid；1H-Imidazole-2-carboxylicacid,1-methyl-4-[[(1-methyl-1H-imidazol-2-；1-methyl-4-[(1-methylimidazole-2-carbonyl)amino]imidazole-2-carboxylic acid
• CAS: 464892-44-2
• 化学式: C₁₀H₁₁N₅O₃
• 分子量: 249.229
• InChiKey: TVPRWUJDZPPUGE-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.53±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.5
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  DNA荧光探针前驱体,DNA小沟配体 在 sodium hydroxide 、 五氟苯基二苯基磷酸酯 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 89.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  DNA序列选择性发夹式聚酰胺铂络合物的合成。

  摘要：

  已通过不同方法合成了两种含有吡咯和咪唑杂环的DNA序列选择性发夹式聚酰胺铂（II）复合物。通过固相合成制备了对（A / T）GGG（A / T）DNA序列具有选择性的六环复合物，而对（A / T）CCTG（A / T）具有选择性的八环复合物DNA序列是通过使用标准的湿化学法制得的。固相合成比湿法合成具有更高的收率，更少的纯化且更有效。因此，这是进行进一步工作的首选方法。金属配合物通过（1）H和（195）Pt NMR光谱法和ESI质谱法表征。这两种化合物为合成包含多个发夹和/或铂基的更复杂分子提供了基础。

  DOI：

  10.1002/chem.200601486
• 作为产物：
  描述：

  1-甲基-2-(三氯乙酰基)咪唑 在 lithium hydroxide 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 DNA荧光探针前驱体,DNA小沟配体
  参考文献：
  名称：

  DNA序列选择性发夹式聚酰胺铂络合物的合成。

  摘要：

  已通过不同方法合成了两种含有吡咯和咪唑杂环的DNA序列选择性发夹式聚酰胺铂（II）复合物。通过固相合成制备了对（A / T）GGG（A / T）DNA序列具有选择性的六环复合物，而对（A / T）CCTG（A / T）具有选择性的八环复合物DNA序列是通过使用标准的湿化学法制得的。固相合成比湿法合成具有更高的收率，更少的纯化且更有效。因此，这是进行进一步工作的首选方法。金属配合物通过（1）H和（195）Pt NMR光谱法和ESI质谱法表征。这两种化合物为合成包含多个发夹和/或铂基的更复杂分子提供了基础。

  DOI：

  10.1002/chem.200601486

文献信息

• Alpha- haloenamine reagents
  申请人：Pharmacia Corporation

  公开号：US20030080320A1

  公开（公告）日：2003-05-01

  The present invention describes immobilized haloenamine reagents, immobilized tertiary amides, methods for their preparation, and methods of use.

  本发明描述了固定化的卤胺试剂、固定化的三级酰胺、其制备方法以及使用方法。
• Aromatic and heteroaromatic acid halides for synthesizing polyamides
  申请人：Pharmacia Corporation

  公开号：US20030105279A1

  公开（公告）日：2003-06-05

  The present invention is directed to protected amino acid halide monomers and oligomers, and to their use in the efficient sythesis of polyamides. The present invention is further directed to the use of &agr;-haloenamine reagents, which may optionally be immobilized, for the preparation of the amino acid halides.

  本发明涉及受保护的氨基酸卤代单体和寡聚体，以及它们在高效合成聚酰胺中的应用。本发明进一步涉及使用α-卤代胺试剂（可选择性固定）来制备氨基酸卤化物。
• Alternative Heterocycles for DNA Recognition: The Benzimidazole/Imidazole Pair
  作者：Christoph A. Briehn、Philipp Weyermann、Peter B. Dervan

  DOI：10.1002/chem.200204689

  日期：2003.5.9

  acids were synthesized and incorporated into DNA binding polyamides, comprised of N-methyl pyrrole and N-methyl imidazole amino acids, by means of solid-phase synthesis on an oxime resin. These hairpin polyamides were designed to determine the DNA recognition profile of a side-by-side benzimidazole/imidazole pair for the designated six base pair recognition sequence. Equilibrium association constants

  通过在肟上进行固相合成，合成了Boc保护的苯并咪唑-吡咯，苯并咪唑-咪唑和苯并咪唑-甲氧基吡咯氨基酸，并将其掺入由N-甲基吡咯和N-甲基咪唑氨基酸组成的DNA结合聚酰胺中。树脂。这些发夹聚酰胺被设计用于确定指定的六个碱基对识别序列的并排苯并咪唑/咪唑对的DNA识别谱。通过对DNA片段进行定量DNase I足迹滴定，在识别序列的六个碱基对位置中的两个碱基对位置确定聚酰胺-DNA复合物的平衡缔合常数，每个片段均包含匹配的碱基对和单个碱基对错配的结合位点。结果表明，苯并咪唑-杂环砌块可以取代吡咯-吡咯，吡咯-咪唑和吡咯-羟基吡咯构建体，同时保留相对位点特异性和亚纳摩尔匹配位点亲和力。含苯并咪唑的发夹状聚酰胺代表一类新型的DNA结合配体，其特征在于可调节的靶标识别序列，并结合了苯并咪唑型DNA小沟结合剂的良好特性。
• Facile Dimer Synthesis for DNA-Binding Polyamide Ligands
  作者：Modi Wetzler、David E. Wemmer

  DOI：10.1021/ol1013262

  日期：2010.8.6

  Pyrrole-imidazole polyamide ligands are highly sequence specific synthetic DNA-binding ligands that bind with high affinity. To counter the synthetic difficulties associated with coupling the electron-rich heterocyclic acids to the electron-deficient nucleophilic imidazole amine, a novel approach is described for synthesis of Fmoc-protected dimers for solid-phase peptide synthesis (SPPS). This method produces

  吡咯-咪唑聚酰胺配体是具有高亲和力的高度序列特异性合成DNA结合配体。为了解决与将富电子杂环酸偶联至缺电子亲核咪唑胺相关的合成难题，描述了一种用于固相肽合成（SPPS）的Fmoc保护的二聚体合成新方法。该方法以高收率生产二聚体，广泛适用于其他含杂环的聚酰胺，并提高了配体收率和合成时间。
• Alpha-haloenamine reagents
  申请人：Pharmacia Corporation

  公开号：US20040092770A1

  公开（公告）日：2004-05-13

  The present invention describes immobilized haloenamine reagents, immobilized tertiary amides, methods for their preparation, and methods of use.

  本发明描述了固定化卤代烯胺试剂、固定化三级酰胺、它们的制备方法和使用方法。