2',3',5'-O-tris(tert-butyldimethylsilyl)-2-N,2-N-dimethylguanosine | 178422-10-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: 2',3',5'-O-tris(tert-butyldimethylsilyl)-2-N,2-N-dimethylguanosine
• 英文别名: 9-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-2-(dimethylamino)-1H-purin-6-one
• CAS: 178422-10-1
• 化学式: C₃₀H₅₉N₅O₅Si₃
• 分子量: 654.085
• InChiKey: JOGNZTXMTHPQKC-HUBRGWSESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.89
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  99.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2',3',5'-O-tris(tert-butyldimethylsilyl)-2-N,2-N-dimethylguanosine 在 吡啶 、 水 、 溶剂黄146 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 32.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  化学稳定化Phenylboranylidene组具有二甲氧基三苯甲基作为比色检测的保护基设计用于顺式在m的固相合成-1,2-二醇核糖核苷的功能2 2,2 ģ 5 ' PPT

  摘要：

  为了改善作为固有核糖核苷2'，3'-顺式二醇官能团保护基的苯基硼亚烷基基团固有的不良稳定性，而且还将比色法可检测的官能团引入其母体结构中，各种2-[（（二烷基氨基）甲基]合成具有[（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基的]苯基硼酸衍生物。尿苷与这些取代的苯基硼酸衍生物的反应得到相应的2'，3'- O-苯基亚硼烷基亚尿苷衍生物。检查了这些苯基亚硼烷基的稳定性。结果表明，氨基周围的位阻极大地影响了2-取代的苯基亚硼烷基的稳定性。2-氨基甲基-5-[[（（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基]苯基硼亚烷基是最稳定的。其2-二甲基氨基对应物，即2-[（（二甲基氨基）甲基] -5-[[（（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基]苯基硼亚烷基，是第二稳定的。当将最大和第二个稳定的保护基团用于合成m 2 2,2 G 5 '时ppT在可控孔玻璃上，第二个稳定的保护基表现出最好的效果。使用这种含DMTr

  DOI：

  10.1021/jo051202m
• 作为产物：
  描述：

  2',3',5'-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)guanosine 、 聚合甲醛 在 sodium cyanoborohydride 、 溶剂黄146 作用下， 以50%的产率得到2',3',5'-O-tris(tert-butyldimethylsilyl)-2-N,2-N-dimethylguanosine
  参考文献：
  名称：

  化学稳定化Phenylboranylidene组具有二甲氧基三苯甲基作为比色检测的保护基设计用于顺式在m的固相合成-1,2-二醇核糖核苷的功能2 2,2 ģ 5 ' PPT

  摘要：

  为了改善作为固有核糖核苷2'，3'-顺式二醇官能团保护基的苯基硼亚烷基基团固有的不良稳定性，而且还将比色法可检测的官能团引入其母体结构中，各种2-[（（二烷基氨基）甲基]合成具有[（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基的]苯基硼酸衍生物。尿苷与这些取代的苯基硼酸衍生物的反应得到相应的2'，3'- O-苯基亚硼烷基亚尿苷衍生物。检查了这些苯基亚硼烷基的稳定性。结果表明，氨基周围的位阻极大地影响了2-取代的苯基亚硼烷基的稳定性。2-氨基甲基-5-[[（（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基]苯基硼亚烷基是最稳定的。其2-二甲基氨基对应物，即2-[（（二甲基氨基）甲基] -5-[[（（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基]苯基硼亚烷基，是第二稳定的。当将最大和第二个稳定的保护基团用于合成m 2 2,2 G 5 '时ppT在可控孔玻璃上，第二个稳定的保护基表现出最好的效果。使用这种含DMTr

  DOI：

  10.1021/jo051202m

文献信息

• Chemical Synthesis of a 5‘-Terminal TMG-Capped Triribonucleotide m₃^2,2,7G⁵^‘pppAmpUmpA of U1 RNA
  作者：Mitsuo Sekine、Michinori Kadokura、Takahiko Satoh、Kohji Seio、Takeshi Wada、Utz Fischer、Vicki Sumpter、Reinhard Lührmann

  DOI：10.1021/jo952263v

  日期：1996.1.1

  The 5'-terminal TMG-capped triribonucleotide, m(3)(2,2,7)G(5')pppAmpUmpA, has been synthesized by condensation of an appropriately protected triribonucleotide derivative of ppAmpUmpA with a new TMG-capping reagent. During this total synthesis, it was found that the regioselective 2'-O-methylation of 3',5'-O-(1,1,3,3-tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-N-(4-monomethoxytrityl)adenosine was achieved by use of MeI/Ag2O without affecting the base moiety. A new route to 2-N,2-N-dimethylguanosine from guanosine via a three-step reaction has also been developed by reductive methylation using paraformaldehyde and sodium cyanoborohydride. These key intermediates were used as starting materials for the construction of a fully protected derivative of pAmpUmpA and a TMG-capping reagent of Im-pm(3)(2,2,7)G. The target TMG-capped tetramer, m(3)(2,2,7)G(5')pppAmpUmpA, was synthesized by condensation of a partially protected triribonucleotide 5'-terminal diphosphate species, pp(AMMTr)mpUmpA, with Im-pm(3)(2,2,7)G followed by treatment with 80% acetic acid. The structure of m(3)(2,2,7)G(5')pppAmpUmpA was characterized by H-1 and P-31 NMR spectroscopy as well as enzymatic assay using snake venom phosphodiesterase, calf intestinal phosphatase, and nuclease P1.
• Chemically Stabilized Phenylboranylidene Groups Having a Dimethoxytrityl Group as a Colorimetrically Detectable Protecting Group Designed for <i>cis</i>-1,2-Diol Functions of Ribonucleosides in the Solid-Phase Synthesis of m₂^2,2G⁵^‘ppT
  作者：Mitsuo Sekine、Morihiro Aoyagi、Masatoshi Ushioda、Akihiro Ohkubo、Kohji Seio

  DOI：10.1021/jo051202m

  日期：2005.10.1

  2-[(dimethylamino)methyl]-5-[[(4,4‘-dimethoxytrityl)oxy]methyl]phenylboranylidene group, was the second most stable. When the most and second stable protecting groups were applied to the synthesis of m22,2G5‘ppT on controlled pore glass, the second stable protecting group showed the best result. The use of this DMTr-containing protecting group enabled us to estimate colorimetrically the amount of the m22,2G residue

  为了改善作为固有核糖核苷2'，3'-顺式二醇官能团保护基的苯基硼亚烷基基团固有的不良稳定性，而且还将比色法可检测的官能团引入其母体结构中，各种2-[（（二烷基氨基）甲基]合成具有[（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基的]苯基硼酸衍生物。尿苷与这些取代的苯基硼酸衍生物的反应得到相应的2'，3'- O-苯基亚硼烷基亚尿苷衍生物。检查了这些苯基亚硼烷基的稳定性。结果表明，氨基周围的位阻极大地影响了2-取代的苯基亚硼烷基的稳定性。2-氨基甲基-5-[[（（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基]苯基硼亚烷基是最稳定的。其2-二甲基氨基对应物，即2-[（（二甲基氨基）甲基] -5-[[（（4,4'-二甲氧基三苯甲基）氧基]甲基]苯基硼亚烷基，是第二稳定的。当将最大和第二个稳定的保护基团用于合成m 2 2,2 G 5 '时ppT在可控孔玻璃上，第二个稳定的保护基表现出最好的效果。使用这种含DMTr