cyclo[Ala-Pro-D-PheΨ{(C=S)NH}-Ser-Thr(rprenyl)-Ser(rprenyl)-Ile] | 267877-07-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: cyclo[Ala-Pro-D-PheΨ{(C=S)NH}-Ser-Thr(rprenyl)-Ser(rprenyl)-Ile]
• 英文别名: cyclo[D-Phe(S)-Ser-Thr(rPr)-Ser(rPr)-Ile-Ala-Pro]；(3S,6S,9S,12S,15S,18R,21S)-18-benzyl-6-[(2S)-butan-2-yl]-15-(hydroxymethyl)-3-methyl-12-[(1R)-1-(2-methylbut-3-en-2-yloxy)ethyl]-9-(2-methylbut-3-en-2-yloxymethyl)-17-sulfanylidene-1,4,7,10,13,16,19-heptazabicyclo[19.3.0]tetracosane-2,5,8,11,14,20-hexone
• CAS: 267877-07-6
• 化学式: C₄₃H₆₅N₇O₉S
• 分子量: 856.097
• InChiKey: NXGFSPALIBGHGG-RZZCCKHXSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  60
• 可旋转键数：
  13
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  249
• 氢给体数：
  7
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  cyclo[Ala-Pro-D-PheΨ{(C=S)NH}-Ser-Thr(rprenyl)-Ser(rprenyl)-Ile] 在 4,4'-二氨基二苯乙烯-2,2'-二磺酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以85%的产率得到cyclo[Ala-Pro-D-Phe-Ser(thiaz)-Thr(rprenyl)-Ser(rprenyl)-Ile]
  参考文献：
  名称：

  海洋代谢物树干酰胺A的全合成和立体化学修订。

  摘要：

  细胞毒Lissoclinum sp。的分离。1996年报道了代谢产物树干酰胺A。在1999年完成全部合成后，很明显必须对该海洋天然产物的结构进行修改。现在，我们报告在完全合成中首次制备实际的树干酰胺A的过程，可以明确地证明其结构和立体化学性质。我们合成策略的重点是路易斯酸辅助的氮丙啶开环，该开环用于制备新型的反向预炔化的丝氨酸和苏氨酸侧链，以及在大环骨架上有效的恶唑啉-噻唑啉互变。此外，通过互补合成方案制备的几种立体异构体可用于说明我们方法的一般范围并确认构型分配。

  DOI：

  10.1021/jo9914566
• 作为产物：
  描述：

  L-脯氨酸苄酯盐酸盐 在 palladium on activated charcoal 氟化铵 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 三(2-氨基乙基)胺 、 氰基磷酸二乙酯 、 硫化氢 、 四丁基氟化铵 、 四丁基氢氧化铵 、 benzotriazol-1-yloxyl-tris-(pyrrolidino)-phosphonium hexafluorophosphate 、 氢气 、 O-(benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium tetrafluoroborate 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 4,4'-二氨基二苯乙烯-2,2'-二磺酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 乙腈 为溶剂， 反应 82.0h， 生成 cyclo[Ala-Pro-D-PheΨ{(C=S)NH}-Ser-Thr(rprenyl)-Ser(rprenyl)-Ile]
  参考文献：
  名称：

  海洋代谢物树干酰胺A的全合成和立体化学修订。

  摘要：

  细胞毒Lissoclinum sp。的分离。1996年报道了代谢产物树干酰胺A。在1999年完成全部合成后，很明显必须对该海洋天然产物的结构进行修改。现在，我们报告在完全合成中首次制备实际的树干酰胺A的过程，可以明确地证明其结构和立体化学性质。我们合成策略的重点是路易斯酸辅助的氮丙啶开环，该开环用于制备新型的反向预炔化的丝氨酸和苏氨酸侧链，以及在大环骨架上有效的恶唑啉-噻唑啉互变。此外，通过互补合成方案制备的几种立体异构体可用于说明我们方法的一般范围并确认构型分配。

  DOI：

  10.1021/jo9914566

文献信息

• Total Synthesis and Revision of Stereochemistry of the Marine Metabolite Trunkamide A
  作者：Peter Wipf、Yoshikazu Uto

  DOI：10.1021/jo9914566

  日期：2000.2.1

  The isolation of the cytotoxic Lissoclinum sp. metabolite trunkamide A was reported in 1996. After completion of a total synthesis in 1999, it became clear that the structure of this marine natural product had to be revised. We now report the first preparation of actual trunkamide A in a total synthesis that serves as an unambiguous structural and stereochemical proof. Highlights of our synthetic strategy

  细胞毒Lissoclinum sp。的分离。1996年报道了代谢产物树干酰胺A。在1999年完成全部合成后，很明显必须对该海洋天然产物的结构进行修改。现在，我们报告在完全合成中首次制备实际的树干酰胺A的过程，可以明确地证明其结构和立体化学性质。我们合成策略的重点是路易斯酸辅助的氮丙啶开环，该开环用于制备新型的反向预炔化的丝氨酸和苏氨酸侧链，以及在大环骨架上有效的恶唑啉-噻唑啉互变。此外，通过互补合成方案制备的几种立体异构体可用于说明我们方法的一般范围并确认构型分配。
• Solid-Phase Total Synthesis of Trunkamide A¹
  作者：Josep M. Caba、Ignacio M. Rodriguez、Ignacio Manzanares、Ernest Giralt、Fernando Albericio

  DOI：10.1021/jo015703t

  日期：2001.11.1

  rich source of novel, biologically active compounds. Herein, the solid-phase total synthesis of trunkamide A, currently in preclinical trials, is presented. Trunkamide A contains a thiazoline heterocycle and two residues of Ser and Thr with the hydroxy function modified as reverse prenyl (rPr). Cornerstones of the synthesis are as follows: (i) solid-phase peptide chain elongation using a quasi-orthogonal

  海洋生物是新型生物活性化合物的丰富来源。在此，提出了目前在临床前试验中的trunkamide A的固相全合成。Trunkamide A包含噻唑啉杂环和两个Ser和Thr残基，其羟基官能团被修饰为反向异戊烯基（rPr）。合成的基础如下：（i）在氯三苯甲基树脂上使用具有叔丁基和芴基的准正交保护方案进行固相肽链延伸；（ii）基于HOAt的偶联剂的混合物；（iii）溶液中的环化。此外，讨论了以下合成步骤：（i）Ser和Thr的反向异戊二烯基衍生物的制备；（ii）引入噻唑啉前体作为受保护的氨基硫代酸衍生物；（iii）用DAST形成噻唑啉环。所有这些特征使该策略特别适合于躯干酰胺A和其他包含相同基序的肽的大规模合成。