Identification of specific carbonic anhydrase inhibitors <i>via in situ</i> click chemistry, phage-display and synthetic peptide libraries: comparison of the methods and structural study
作者:Michael Kugler、Martin Hadzima、Rastislav Dzijak、Robert Rampmaier、Pavel Srb、Lukáš Vrzal、Zdeněk Voburka、Pavel Majer、Pavlína Řezáčová、Milan Vrabel
DOI:10.1039/d2md00330a
日期:——
Herein, we compare three such selection strategies with the aim of identifying potent and selective inhibitors of human carbonic anhydrase II. All three approaches, in situ click chemistry, phage-display libraries and synthetic peptide libraries, led to the identification of more potent inhibitors when compared to the parent compounds. In addition, one of the inhibitor–peptide conjugates identified
开发高活性和选择性的酶抑制剂是药物化学的重点之一。通常,使用各种高通量筛选方法从大量合成化合物中寻找先导化合物,并对这些化合物进行进一步的精心设计和结构精炼以实现所需的特性。为了简化这一复杂而费力的过程,最近出现了基于不同原则的新选择策略作为替代方案。在此,我们比较了三种这样的选择策略,目的是鉴定人碳酸酐酶 II 的有效和选择性抑制剂。原位点击化学、噬菌体展示文库和合成肽文库这三种方法都导致鉴定出比母体化合物更有效的抑制剂。此外,从噬菌体文库中鉴定出的一种抑制剂-肽缀合物对用于化合物选择的酶亚型具有超过 100 倍的选择性。为了使缀合物的结合特性合理化,我们进行了详细的晶体学和核磁共振结构分析,揭示了化合物对酶亲和力的结构基础,并鉴定了一种新型外位点,可用于开发异构体特异性抑制剂。