tert-butyl (S)-5-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-oxohexyl-carbamate | 146803-44-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: tert-butyl (S)-5-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-oxohexyl-carbamate
• 英文别名: N-α-Fmoc-N-ε-Boc-lysinal；(S)-allyl 2-((2-((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)-6-((tertbutoxycarbonyl)amino)hexyl)amino)acetate；(S)-(9H-fluoren-9-yl)methyl tert-butyl (6-oxohexane-1,5-diyl)dicarbamate；Nα-Fmoc-Nω-Boc-L-lysinal；Fmoc-L-Lys(ε-Boc)aldehyde；N-9-fluorenylmethoxycarbonyl-N-ε-tert-butoxycarbonyl-lysinal；Fmoc-Lys(Boc)；tert-Butyl N-[(5S)-5-{[(9H-fluoren-9-ylmethoxy)-carbonyl]amino}-6-oxohexyl]carbamate；tert-butyl N-[(5S)-5-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)-6-oxohexyl]carbamate
• CAS: 146803-44-3
• 化学式: C₂₆H₃₂N₂O₅
• 分子量: 452.55
• InChiKey: APPXMECEIFEZAO-SFHVURJKSA-N

物化性质

• 沸点：
  638.3±55.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.160±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.4
• 重原子数：
  33
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  93.7
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  tert-butyl (S)-5-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-oxohexyl-carbamate 在 5%-palladium/activated carbon 、 氢气 、 sodium cyanoborohydride 、 3-羟基-1,2,3-苯并三嗪-4(3H)-酮 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 甲醇 、 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 4.0h， 生成 N-[(2S)-6-amino-1-[4-aminobutanoyl-(2-amino-2-oxoethyl)amino]hexan-2-yl]dodecanamide
  参考文献：
  名称：

  脂-γ-AA肽作为一类新型的强效和广谱抗菌剂

  摘要：

  对开发抗菌肽（AMPs）作为下一代抗生素的需求日益增长，因为它们具有规避新兴的对常规抗生素治疗的耐药性的潜力。非天然抗菌肽模拟物是一个理想的例子，因为它们具有显着的效力和体内稳定性。在这里，我们首次报道了脂化的γ-AA肽作为抗菌剂的设计。这些脂质-γ-AA肽对真菌和一系列革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌（包括对大多数抗生素具有抗药性的临床相关病原体）显示出有效的广谱活性。我们使用膜去极化和荧光显微镜分析了它们的结构-功能关系和抗菌机制。引入不饱和脂质链显着降低了溶血活性，从而提高了选择性。此外，代表性的lipo-γ-AA肽不会在小鼠体内诱导耐药性金黄色葡萄球菌，即使经过17轮传代。这些结果表明，脂质-γ-AA肽具有类似于AMP的杀菌机制，并且具有作为新型新型抗生素治疗剂的强大潜力。

  DOI：

  10.1021/jm300274p
• 作为产物：
  描述：

  N-alpha-芴甲氧羰基-N-epsilon-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 在 lithium aluminium tetrahydride 、 1-羟基苯并三唑 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 13.17h， 生成 tert-butyl (S)-5-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-oxohexyl-carbamate
  参考文献：
  名称：

  与三个顺序连接的N-乙酰半乳糖胺部分相连的肽核酸向肝细胞的受体特异性传递。

  摘要：

  肽核酸（PNA）是DNA类似物，它们以序列特异性方式与DNA和RNA高亲和力结合，但细胞通透性差，限制了其作为治疗剂的用途。此处描述的工作是受最近报道的，即通过与三触角N-乙酰半乳糖胺（GalNAc）（脱唾液酸糖蛋白受体（ASGPR）识别的配体）缀合的小干扰RNA在肝细胞中有效进行基因沉默所激发。的PNA缀合到在N末端或者三触角的GalNAc（支化结构），或位于C锚定的单体的GalNAc部分γ的三个连续的PNA单体的ñ - （2-氨基乙基）甘氨酸（AEG在固相上合成支架（顺序结构）。如紫外和圆二色光谱法所示，它们与互补的DNA和RNA形成双链体。GalNAc偶联的PNA的荧光标记类似物被表达ASGPR的HepG2细胞内在化，但缺少该受体的HEK-293细胞却不吸收。如共聚焦显微镜所证实的，相继缀合物比分支缀合物更有效地内化到HepG2细胞中，大约13倍。此处提出的结果突出了GalNAc偶联

  DOI：

  10.1021/acs.joc.0c00601
• 作为试剂：
  描述：

  tert-butyl (S)-5-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-oxohexyl-carbamate 在 1H-咪唑-1-磺酰叠氮盐酸盐 、 copper(ll) sulfate pentahydrate 、 sodium hydride 、 sodium ascorbate 、 二乙胺 、 tert-butyl (S)-5-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-oxohexyl-carbamate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 丙酮 、 乙腈 、 mineral oil 为溶剂， 反应 161.5h， 生成 (S,E)-tert-butyl [5-(4-phenyl-1H-1,2,3-triazol-1-yl)-7-(phenylsulfonyl)hept-6-en-1-yl]carbamate
  参考文献：
  名称：

  含有 1,2,3-三唑的乙烯基和烯丙基砜作为抗锥虫药的合成和评价

  摘要：

  描述了一种通过使用点击化学从常见的叠氮化物中间体开始获得 1,2,3-三唑衍生的肽基乙烯基砜作为布氏锥虫抑制剂的方法。在三唑类似物中，生物素化抑制剂 11 和 12 提供了作为阐明此类化合物目标蛋白酶的探针的可能性。还介绍了 1,2,3-三唑基乙烯基砜 5 的两种合成方法。该化合物是通过赖氨酸衍生的叠氮化物（本身通过重氮转移获得）和苯丙氨酸衍生的炔烃的点击反应获得的，该炔烃通过基于 Ohira-Bestmann 和 Corey-Fuchs 的炔基化方案合成。该化合物家族的几个成员显示出有希望的抗锥虫活性。出乎意料的是，最活跃的化合物之一是烯丙基砜 24，它源于乙烯基砜 5 的异构化，可能是一种可逆抑制剂。对寄生半胱氨酸蛋白酶罗得沙因的活性位点中的类似物进行了对接研究，以便深入了解它们与这些酶的可能相互作用。

  DOI：

  10.1002/ejoc.201601221

文献信息

• Synthesis Using a Fmoc-Based Strategy and Biological Activities of Some Reduced Peptide Bond Pseudopeptide Analogs of Dynorphin A
  作者：Jean-Philippe Meyer、Peg Davis、Katharine B. Lee、Frank Porreca、Henry I. Yamamura、Victor J. Hruby

  DOI：10.1021/jm00018a006

  日期：1995.9

  modifications of the peptide bond in the address site (analogues 4-9) do not affect the binding at the kappa receptor and, with a few exceptions, at the mu and delta receptors. On the other hand, analogues 2 and 3, modified in the message segment of Dyn A(1-11)-NH2, show a decrease in binding affinity at all three receptors. In the GPI, the results are more varied as the influence of the peptide bond modification

  合成了Dyn A（1-11）-NH2的8个类似物，并结合了酶促稳定的psi（CH2-NH）等位肽键替代物，并测试了豚鼠脑（GPB）中中央阿片样物质mu，δ和kappa受体的结合亲和力）匀浆，并在豚鼠回肠（GPI）中的外周Kappa（和mu）受体上起作用。肽类似物是通过固相技术使用Fmoc /叔丁基策略合成的，而psi（ -NH）键或还原键是通过对生长中的肽的N端氨基进行还原烷基化而引入的。 Fmoc-Nα-保护的氨基醛。还描述了Fmoc-Nα-保护的氨基醛的合成。先前已经合成了掺入该修饰的几种其他肽，并显示出例如增加的酶稳定性和拮抗剂性质。在GPB中获得的结果表明，地址位点上肽键的修饰（类似物4-9）不影响在kappa受体上的结合，并且在少数情况下不影响mu和delta受体上的结合。另一方面，在Dyn A（1-11）-NH2的信息片段中进行修饰的类似物2和3显示所有三个受体的结合亲和力
• Helical Oligomers of Thiazole-Based γ-Amino Acids: Synthesis and Structural Studies
  作者：Loïc Mathieu、Baptiste Legrand、Cheng Deng、Lubomir Vezenkov、Emmanuel Wenger、Claude Didierjean、Muriel Amblard、Marie-Christine Averlant-Petit、Nicolas Masurier、Vincent Lisowski、Jean Martinez、Ludovic T. Maillard

  DOI：10.1002/anie.201302106

  日期：2013.6.3

  9‐Helix: 4‐Amino(methyl)‐1,3‐thiazole‐5‐carboxylic acids (ATCs) were synthesized as new γ‐amino acid building blocks. The structures of various ATC oligomers were analyzed in solution by CD and NMR spectroscopy and in the solid state by X‐ray crystallography. The ATC sequences adopted a well‐defined 9‐helix structure in the solid state and in aprotic and protic organic solvents as well as in aqueous

  9-螺旋：合成了4-氨基（甲基）-1,3-噻唑-5-羧酸（ATC）作为新的γ-氨基酸构件。各种ATC低聚物的结构在溶液中通过CD和NMR光谱分析，在固态下通过X射线晶体学分析。ATC序列在固态，非质子和质子有机溶剂以及水溶液中均采用明确定义的9螺旋结构。
• α-Helix-Mimicking Sulfono-γ-AApeptide Inhibitors for p53–MDM2/MDMX Protein–Protein Interactions
  作者：Peng Sang、Yan Shi、Junhao Lu、Lihong Chen、Leixiang Yang、Wade Borcherds、Sami Abdulkadir、Qi Li、Gary Daughdrill、Jiandong Chen、Jianfeng Cai

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.9b00993

  日期：2020.2.13

  for the inhibition of protein-protein interactions (PPIs). Herein, we demonstrate that sulfono-γ-AApeptides can be rationally designed to mimic the p53 α-helix and inhibit p53-MDM2 PPIs. The best inhibitor, with Kd and IC50 values of 26 nM and 0.891 μM toward MDM2, respectively, is among the most potent unnatural peptidomimetic inhibitors disrupting the p53-MDM2/MDMX interaction. Using fluorescence polarization

  拟肽支架的使用是抑制蛋白相互作用的一种有前途的策略。在本文中，我们证明了可以合理设计磺基-γ-AA肽以模仿p53α-螺旋并抑制p53-MDM2 PPI。最好的抑制剂对MDM2的Kd和IC50值分别为26 nM和0.891μM，是破坏p53-MDM2 / MDMX相互作用的最有效的非天然拟肽抑制剂之一。使用荧光偏振分析，圆二色性，核磁共振波谱和计算模拟，我们证明了磺基-γ-AA肽采用类似于p53的螺旋结构，并通过结合到MDM2的疏水缝隙竞争性抑制p53-MDM2相互作用。有趣的是 通过增强p53转录活性并诱导MDM2和p21的表达，吻合的磺酰基-γ-AA肽显示出有希望的细胞活性。此外，磺基-γ-AA肽对蛋白水解表现出显着的抗性，从而增强了它们的生物学潜力。我们的结果表明，磺基-γ-AA肽是一类新型的破坏PPI的非天然螺旋折叠剂。
• Solid-Phase Synthesis of Peptide Vinyl Sulfones as Potential Inhibitors and Activity-Based Probes of Cysteine Proteases
  作者：Gang Wang、Uttamchandani Mahesh、Grace Y. J. Chen、Shao Q. Yao

  DOI：10.1021/ol0275567

  日期：2003.3.1

  Peptide vinyl sulfones were prepared from 2-chlorotrityl resin-bound phenolic amino vinyl sulfones in high yield and purity. This method enables the convenient synthesis of peptide vinyl sulfones having different amino acids at the P(1) position. It also allows efficient synthesis of vinyl sulfone-containing, activity-based probes of cysteine proteases used in a proteomic experiment.

  由2-氯三苯甲基树脂结合的酚氨基乙烯基乙烯基砜以高收率和纯度制备了肽乙烯基砜。该方法能够方便地合成在P（1）位置具有不同氨基酸的肽乙烯基砜。它还可以有效合成蛋白质组学实验中使用的含乙烯基砜，基于活性的半胱氨酸蛋白酶探针。
• New Synthetic Technology for Efficient Construction of α-Hydroxy-β-amino Amides via the Passerini Reaction¹
  作者：J. Edward Semple、Timothy D. Owens、Khanh Nguyen、Odile E. Levy

  DOI：10.1021/ol0061485

  日期：2000.9.1

  [reaction: see text] The Passerini reaction of N-protected amino aldehydes, isonitriles, and TFA using pyridine-type bases proceeds under mild conditions and directly affords alpha-hydroxy-beta-amino amide derivatives in moderate to high yields. These adducts are readily hydrolyzed to alpha-hydroxy-beta-amino carboxylic acids. Application of these key intermediates to concise syntheses of P(1)-alpha-ketoamide

  [反应：见正文]使用吡啶型碱的N-保护的氨基醛，异腈和TFA的Passerini反应在温和的条件下进行，并以中等至高收率直接提供α-羟基-β-氨基酰胺衍生物。这些加合物容易水解成α-羟基-β-氨基羧酸。说明了这些关键中间体在简明P（1）-α-酮酰胺蛋白酶抑制剂合成中的应用。