The Development of Benzimidazole-Based Clickable Probes for the Efficient Labeling of Cellular Protein Arginine Deiminases (PADs)
作者:Venkatesh V. Nemmara、Venkataraman Subramanian、Aaron Muth、Santanu Mondal、Ari J. Salinger、Aaron J. Maurais、Ronak Tilvawala、Eranthie Weerapana、Paul R. Thompson
DOI:10.1021/acschembio.7b00957
日期:2018.3.16
next generation cell permeable and “clickable” probes (BB-Cl-Yne and BB-F-Yne) for covalent labeling of the PADs both in vitro and in cell-based systems. Using advanced chemoproteomic technologies, we also report the off targets of both BB-Cl-Yne and BB-F-Yne. The probes are highly specific for the PADs, with relatively few off targets, especially BB-F-Yne, suggesting the preferential use of the fluoroacetamidine
瓜氨酸化是肽基-精氨酸的翻译后水解以形成肽基-瓜氨酸,该反应被蛋白质精氨酸脱亚氨酶(PADs)催化,该蛋白是钙调节的酶家族。蛋白质瓜氨酸化异常增加与多种自身免疫性疾病(例如类风湿性关节炎(RA),多发性硬化症,狼疮和溃疡性结肠炎)和某些癌症有关。鉴于增加的PAD活性与人类疾病之间存在明确的联系,PAD是治疗相关的靶标。在本文中,我们报道下一代电池的发展可渗透的和两个垫的共价标记“可点击”探针(BB-CL-炔和BB-F-炔)体外以及基于单元的系统中。使用先进的化学计量学技术,我们还报告了BB-Cl-Yne和BB-F-Yne的偏离目标。该探针对PAD具有高度特异性,相对靶点相对较少,尤其是BB-F-Yne,这表明在下一代不可逆PAD抑制剂中优先使用氟乙am战斗部。值得注意的是,这些化合物可以多种方式使用,包括鉴定母体化合物的脱靶标,以及在靶标结合试验中用作基于活性的蛋白谱探针,以证明PAD抑制剂的功效。