allyl 2-((2R,5S)-5-(azidomethyl)-4-benzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetate | 1389331-96-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: allyl 2-((2R,5S)-5-(azidomethyl)-4-benzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetate
• CAS: 1389331-96-7
• 化学式: C₁₇H₁₉N₅O₄
• 分子量: 357.369
• InChiKey: PUOJQZIBOFATNH-KGLIPLIRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.31
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  124.47
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  allyl 2-((2R,5S)-5-(azidomethyl)-4-benzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetate 在 四氢吡咯 、 四(三苯基膦)钯 、 N-羟基-7-氮杂苯并三氮唑 、 palladium 10% on activated carbon 、 氢气 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 、 Methanaminium,N-[(dimethylamino)(3H-1,2,3-triazolo[4,5-b]pyridin-3-yloxy)methylene]-N-methyl-, hexafluorophosphate(1-) 、 三甲基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， -20.0~20.0 ℃ 、100.0 kPa 条件下， 反应 9.0h， 生成 N2-(2-((2R,5S)-5-(((S)-2-amino-4-(tert-butoxy)-4-oxobutanamido)methyl)-4-benzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetyl)-Nw-((4-methoxy-2,3,6-trimethylphenyl)sulfonyl)-L-arginylglycine
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457
• 作为产物：
  描述：

  L-N-苄基丝氨酸甲酯 在 4-二甲氨基吡啶 、 迭氮酸 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 N,N-二异丙基乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 二氯甲烷 、 异丙醇 、 甲苯 为溶剂， 反应 29.5h， 生成 allyl 2-((2R,5S)-5-(azidomethyl)-4-benzyl-3,6-dioxopiperazin-2-yl)acetate
  参考文献：
  名称：

  包含新型双功能整合素配体的双功能二酮哌嗪支架的环状RGD拟肽。

  摘要：

  描述了八个双功能二酮哌嗪（DKP）支架的合成。它们正式衍生自2,3-二氨基丙酸和天冬氨酸（DKP - 1 – DKP - 7）或谷氨酸（DKP - 8），具有胺和羧酸官能团。支架在两个立体中心的构型和在二酮哌嗪氮原子上的取代不同。将双功能二酮哌嗪引入了八个具有Arg-Gly-Asp（RGD）序列的环状拟肽中。将所得的肽模拟RGD筛选的能力抑制生物素化的玻连蛋白结合到纯化的整α v β3和α v β 5，其参与肿瘤血管生成。从反式DKP支架（DKP ‐ 2 – DKP ‐ 8）衍生的RGD拟肽获得了纳摩尔IC 50值。通过水溶液中的1 H NMR光谱实验（VT-NMR和NOESY光谱）和Monte Carlo /随机动力学（MC / SD）模拟对环状RGD拟肽进行构象研究，结果表明，亲和力最高的配体具有分子内明确定义的优选构象氢键转弯基序和RGD序列的扩展排列[Cβ（Arg）Cβ（Asp）平均距离≥8

  DOI：

  10.1002/chem.201200457

文献信息

• Cyclic<i>iso</i>DGR and RGD Peptidomimetics Containing Bifunctional Diketopiperazine Scaffolds are Integrin Antagonists
  作者：Silvia Panzeri、Simone Zanella、Daniela Arosio、Leila Vahdati、Alberto Dal Corso、Luca Pignataro、Mayra Paolillo、Sergio Schinelli、Laura Belvisi、Cesare Gennari、Umberto Piarulli

  DOI：10.1002/chem.201406567

  日期：2015.4.13

  cyclo[DKP‐isoDGR] peptidomimetics 2–5, containing bifunctional diketopiperazine (DKP) scaffolds that differ in the configuration of the two DKP stereocenters and in the substitution at the DKP nitrogen atoms, were prepared and examined in vitro in competitive binding assays with purified αvβ3 and αvβ5 integrin receptors. IC50 values ranged from low nanomolar (ligand 3) to submicromolar with αvβ3 integrin. The biological

  制备了环[DKP- iso DGR]拟肽2 – 5，其中包含在两个DKP立体中心的构型以及DKP氮原子的取代方面不同的双功能二酮哌嗪（DKP）支架，并在体外通过竞争性结合测定进行了检查用纯化的α v β 3和α v β 5整联蛋白受体。IC 50个值从低纳摩尔（配体介于3）与α，以亚微摩尔v β 3整联蛋白。配体环[DKP3-RGD] 1和环[DKP3-异DGR] 3，带有相同的双功能DKP支架和表示类似α V β 3整联蛋白结合的值，在对人U373成胶质细胞瘤细胞中它们的细胞效应方面进行了比较。化合物1和3对FAK / Akt整合素激活的转导途径和整合素介导的细胞浸润过程显示出重叠的抑制作用，因此尽管RGD和iso DGR序列不同，也可以作为整合素拮抗剂使用。治疗72小时后，两种化合物均诱导神经胶质瘤细胞凋亡。
• Cyclic<i>iso</i>DGR Peptidomimetics as Low-Nanomolar α_vβ₃Integrin Ligands
  作者：Michele Mingozzi、Alberto Dal Corso、Mattia Marchini、Ileana Guzzetti、Monica Civera、Umberto Piarulli、Daniela Arosio、Laura Belvisi、Donatella Potenza、Luca Pignataro、Cesare Gennari

  DOI：10.1002/chem.201204639

  日期：2013.3.11

  the docking best pose of a low‐nanomolar αvβ3 integrin ligand cyclo[DKP‐isoDGR] (atom color tube representation; see figure) into the receptor binding pocket, overlaid on the bound conformation of Cilengitide (green tube representation). The extended isoDGR conformation permits all the important interactions with the extracellular domain of the αvβ3 integrin. The metal ion in the MIDAS region is represented

  一个完美的结合：这里显示的是一个低纳摩尔α的对接最佳姿势v β 3整联蛋白配环[DKP-异DGR]（原子彩色显像管表示;见图）插入受体结合口袋，上的结合构象重叠西仑吉肽（绿色管代表）。扩展异DGR构象允许所有与α的胞外域的重要的相互作用v β 3整联蛋白。MIDAS区域中的金属离子以品红色球表示。