作者:Breidenbach, Julian、Voget, Rabea、Si, Yaoyao、Hingst, Alexandra、Claff, Tobias、Sylvester, Katharina、Wolf, Valentina、Krasniqi, Vesa、Useini, Abibe、Sträter, Norbert、Ogura, Yukino、Kawaguchi, Atsushi、Müller, Christa E.、Gütschow, Michael
DOI:10.1021/acs.jmedchem.4c00053
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investigated peptidomimetic azapeptide nitriles as auspicious, irreversibly acting inhibitors of Mpro. Our systematic approach combined an Mpro active-site scanning by combinatorially assembled azanitriles with structure-based design. Encouraged by the bioactive conformation of open-chain inhibitors, we conceptualized the novel chemotype of macrocyclic azanitriles whose binding mode was elucidated by cocrystallization
鉴于主要蛋白酶 (M pro ) 在 SARS-CoV-2 复制周期中的关键作用,这种病毒半胱氨酸蛋白酶构成了备受瞩目的药物靶点。我们研究了拟肽氮杂肽腈作为 M pro的吉祥的、不可逆作用的抑制剂。我们的系统方法将组合组装的氮腈进行的 M pro活性位点扫描与基于结构的设计相结合。受开链抑制剂生物活性构象的启发,我们概念化了大环氮腈的新化学型,其结合模式通过共结晶得到阐明。该策略为靶标结合提供了有利的熵贡献,并导致了极其有效的 M pro抑制剂84的开发,其 IC 50值为 3.23 nM,二阶灭活速率常数k inac / K i为 448,000 M –1秒–1 。开链 M pro抑制剂58以及广谱抗冠状病毒药物大环化合物83和84表现出最高的抗病毒活性,EC 50值在个位数微摩尔范围内。我们的研究结果有望促进拟肽 M pro抑制剂作为抗 SARS-CoV-2 药物的未来发展。