5-(1-hydroxybutylidene)-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione | 66696-77-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 5-(1-hydroxybutylidene)-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione
• 英文别名: 5-(1-Hydroxybutylidene)-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione
• CAS: 66696-77-3
• 化学式: C₁₀H₁₄O₅
• 分子量: 214.218
• InChiKey: LWHAXRPTOQNUOP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.3
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  72.8
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-(1-hydroxybutylidene)-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione 在 sodium tetrahydroborate 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 丙酮 为溶剂， 反应 10.75h， 生成 3-羟基-2-甲基己酸甲酯
  参考文献：
  名称：

  β-变形杆菌菌株HxN1反硝化，正己烷厌氧降解的代谢物。

  摘要：

  通过反硝化β变形杆菌HxN1菌株在正己烷厌氧降解过程中形成的七种代谢物的组成，通过将它们的GC和MS数据与合成参考标准品进行了比较。4-甲基辛酸衍生物的合成通过将2-甲基己酰氯与麦德鲁姆酸转化而完成。用NaBH4还原β-氧代酸酯，消除羟基，并置换双键，生成4-甲基-3-氧代辛酸酯，3-羟基-4-甲基辛酸酯，（E）-4-甲基酯-2-辛烯酸酯，以及（E）-和（Z）-4-甲基-3-辛烯酸酯。类似地，由丁酰氯和Meldrum酸制备2-甲基-3-氧己酸酯和3-羟基-2-甲基己酸酯的甲酯。然而，通过Horner-Wadsworth-Emmons反应制备（E）-2-甲基-2-己烯酸甲酯，然后异构化为（E）-2-甲基-3-己烯酸甲酯。除了在培养物中无法检测到的4-甲基-3-氧代辛酸酯外，这项研究完成了对正己烷厌氧降解为2-甲基-3-氧代己酰基辅酶A（CoA）的所有中间体的明确鉴定。 ），然后将其硫解切割成

  DOI：

  10.1002/cbic.201900375
• 作为产物：
  描述：

  丙二酸环(亚)异丙酯 、 丁酰氯 在 吡啶 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 20.0h， 生成 5-(1-hydroxybutylidene)-2,2-dimethyl-1,3-dioxane-4,6-dione
  参考文献：
  名称：

  Haloperoxidase Mediated Quorum Quenching by Nitzschia cf pellucida: Study of the Metabolization of N-Acyl Homoserine Lactones by a Benthic Diatom

  摘要：

  硅藻已知能够产生多种卤化化合物，最近的研究表明这些化合物在竞争物种之间的化感作用中起着重要作用。这些化合物的产生与卤过氧化酶活性有关。这项研究表明，该系统可能还通过来自底栖硅藻Nitzschia cf pellucida的天然卤过氧化酶系统，通过H2O2依赖性的失活过程，参与硅藻与细菌的相互作用，这种失活作用针对的是一种类型的群体感应（QS）分子，即N-β-酮基化同型丝氨酸内酯（AHLs）。通过HPLC-MS分析阐明了AHL降解通路及其对应的卤化衍生物，并合成了一系列新型卤化AHL类似物作为参考化合物。此外，其作为群体感应调节剂的生物活性与一系列天然存在的β-酮-AHL进行了直接比较和评估。研究表明，群体感应活性的丧失是由于信号分子的卤化N-酰链的最终裂解。

  DOI：

  10.3390/md12010352

文献信息

• Synthetic libraries of tyrosine-derived bacterial metabolites
  作者：Savvas N. Georgiades、Jon Clardy

  DOI：10.1016/j.bmcl.2007.10.058

  日期：2008.5

  The preparation of a collection of 131 small molecules, reminiscent of families of long chain N-acyl tyrosines, enamides and enol esters that have been isolated from heterologous expression of environmental DNA (eDNA) in Escherichia coli, is reported. The synthetic libraries of N-acyl tyrosines and their 3-keto counterparts were prepared via solid-phase routes, whereas the enamides and enol esters

  据报道，制备了 131 个小分子的集合，让人联想到长链 N-酰基酪氨酸、烯酰胺和烯醇酯家族，这些分子是从大肠杆菌环境 DNA (eDNA) 的异源表达中分离出来的。N-酰基酪氨酸及其3-酮对应物的合成库是通过固相途径制备的，而烯酰胺和烯醇酯是在溶液相中合成的。
• Discovery of a 3-Pyridylacetic Acid Derivative (TAK-100) as a Potent, Selective and Orally Active Dipeptidyl Peptidase IV (DPP-4) Inhibitor
  作者：Yasufumi Miyamoto、Yoshihiro Banno、Tohru Yamashita、Tatsuhiko Fujimoto、Satoru Oi、Yusuke Moritoh、Tomoko Asakawa、Osamu Kataoka、Hiroaki Yashiro、Koji Takeuchi、Nobuhiro Suzuki、Koji Ikedo、Takuo Kosaka、Shigetoshi Tsubotani、Akiyoshi Tani、Masako Sasaki、Miyuki Funami、Michiko Amano、Yoshio Yamamoto、Kathleen Aertgeerts、Jason Yano、Hironobu Maezaki

  DOI：10.1021/jm101236h

  日期：2011.2.10

  Inhibition of dipeptidyl peptidase IV (DPP-4) is an exciting new approach for the treatment of diabetes. To date there has been no DPP-4 chemotype possessing a carboxy group that has progressed into clinical trials. Originating from the discovery of the structurally novel quinoline derivative 1, we designed novel pyridine derivatives containing a carboxy group. In our design, the carboxy group interacted

  抑制二肽基肽酶IV（DPP-4）是治疗糖尿病的令人兴奋的新方法。迄今为止，尚无具有羧基的DPP-4化学型已进入临床试验。从发现结构新颖的喹啉衍生物1出发，我们设计了含有羧基的新型吡啶衍生物。在我们的设计中，羧基与催化区域周围的目标氨基酸残基相互作用，从而增加了抑制活性。经过进一步优化后，我们确定了[5-（氨基甲基）-6-（2,2-二甲基丙基）-2-乙基-4-（4-甲基苯基）吡啶-3-基]乙酸的水合物（30c）作为有效且选择性的DPP-4抑制剂。通过X射线共晶结构分析确认了与关键活性位点残基的所需相互作用，例如与Arg125的盐桥相互作用。此外，化合物30c表现出所需的临床前安全性，编码为TAK-100。
• Short, Efficient Syntheses of Pyrrole α-Amides
  作者：Michael T. Huggins、Patrick S. Barber、David Florian、William Howton

  DOI：10.1080/00397910802323130

  日期：2008.11.3

  available compounds. The diketene adduct, in the presence of an amine nucleophile, provides an excellent method for acetoacetylation. For diversity and versatility, a second method utilizing Meldrum's acid was successfully employed for the preparation of additional acetoacetamide derivatives. Using the Knorr pyrrole synthesis, pyrrole amides were readily prepared from the oxime of the acetoacetamides

  摘要 我们报告了一种廉价的大规模生产各种吡咯酰胺的方法，产率高。合成顺序允许从市售化合物以优异至中等产率制备多种吡咯酰胺衍生物。在胺亲核试剂的存在下，双烯酮加合物提供了一种极好的乙酰乙酰化方法。为了多样性和多功能性，成功地采用了利用 Meldrum 酸的第二种方法来制备额外的乙酰乙酰胺衍生物。使用克诺尔吡咯合成，可以很容易地从乙酰乙酰胺的肟中制备吡咯酰胺。
• Isolation of the antibiotic pseudopyronine B and SAR evaluation of C3/C6 alkyl analogs
  作者：Leah M. Bouthillette、Catherine A. Darcey、Tess E. Handy、Sarah C. Seaton、Amanda L. Wolfe

  DOI：10.1016/j.bmcl.2017.04.067

  日期：2017.6

  for antibacterial activity against Gram-positive and Gram-negative bacteria. We found a direct relationship between antibacterial activity and C3/C6 alkyl chain length. For inhibition of Gram-positive bacteria, alkyl chain lengths between 6 and 7 carbons were found to be the most active (IC50=0.04-3.8µg/mL) whereas short alkyl chain analogs showed modest activity against Gram-negative bacteria (IC50=223-304µg/mL)

  天然产物是具有抗菌活性的结构多样的化合物的丰富来源，可用于开发新型有效的抗生素。一类这样的天然产物是假吡喃酮。在这里，我们介绍了从北卡罗莱纳州西部花园土壤中发现的假单胞菌属物种中分离出假吡喃酮B（2），以及对天然产物的C3和C6烷基类似物对革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌的抗菌活性的SAR评估。我们发现抗菌活性和C3 / C6烷基链长之间存在直接关系。为了抑制革兰氏阳性菌，发现6​​至7个碳原子之间的烷基链长度最活跃（IC50 = 0.04-3.8µg / mL），而短链烷基类似物对革兰氏阴性菌的活性中等（IC50 = 223） -304µg / mL）。
• Haloperoxidase Mediated Quorum Quenching by Nitzschia cf pellucida: Study of the Metabolization of N-Acyl Homoserine Lactones by a Benthic Diatom
  作者：Michail Syrpas、Ewout Ruysbergh、Lander Blommaert、Bart Vanelslander、Koen Sabbe、Wim Vyverman、Norbert De Kimpe、Sven Mangelinckx

  DOI：10.3390/md12010352

  日期：——

  Diatoms are known to produce a variety of halogenated compounds, which were recently shown to have a role in allelopathic interactions between competing species. The production of these compounds is linked to haloperoxidase activity. This research, has shown that this system may also be involved in diatom-bacteria interactions via the H2O2 dependent inactivation of a type of quorum sensing (QS) molecule, i.e., N-β-ketoacylated homoserine lactones (AHLs), by a natural haloperoxidase system from the benthic diatom Nitzschia cf pellucida. The AHL degradation pathway towards corresponding halogenated derivatives was elucidated via HPLC-MS analysis and the synthesis of a broad series of novel halogenated AHL analogues as reference compounds. Furthermore, their biological activity as quorum sensing modulators was directly compared and evaluated against a series of naturally occurring β-keto-AHLs. It has been demonstrated that the loss of the QS activity results from the final cleavage of the halogenated N-acyl chain of the signal molecules.

  硅藻已知能够产生多种卤化化合物，最近的研究表明这些化合物在竞争物种之间的化感作用中起着重要作用。这些化合物的产生与卤过氧化酶活性有关。这项研究表明，该系统可能还通过来自底栖硅藻Nitzschia cf pellucida的天然卤过氧化酶系统，通过H2O2依赖性的失活过程，参与硅藻与细菌的相互作用，这种失活作用针对的是一种类型的群体感应（QS）分子，即N-β-酮基化同型丝氨酸内酯（AHLs）。通过HPLC-MS分析阐明了AHL降解通路及其对应的卤化衍生物，并合成了一系列新型卤化AHL类似物作为参考化合物。此外，其作为群体感应调节剂的生物活性与一系列天然存在的β-酮-AHL进行了直接比较和评估。研究表明，群体感应活性的丧失是由于信号分子的卤化N-酰链的最终裂解。