6-methyl-1,4-dihydro-4-oxo-1-(β-D-ribofuranosyl)quinoline-3-carboxylic acid | 956485-82-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 喹啉及其衍生物
• 英文名称: 6-methyl-1,4-dihydro-4-oxo-1-(β-D-ribofuranosyl)quinoline-3-carboxylic acid
• 英文别名: 1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-6-methyl-4-oxoquinoline-3-carboxylic acid
• CAS: 956485-82-8
• 化学式: C₁₆H₁₇NO₇
• 分子量: 335.313
• InChiKey: JHIZLUYYTPTASL-NMFUWQPSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.8
• 重原子数：
  24
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  128
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  ethyl 1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-dibenzoyloxy-5-(benzoyloxymethyl)oxolan-2-yl]-6-methyl-4-oxoquinoline-3-carboxylate 在 sodium carbonate 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 生成 6-methyl-1,4-dihydro-4-oxo-1-(β-D-ribofuranosyl)quinoline-3-carboxylic acid
  参考文献：
  名称：

  固定在磁性颗粒上的核苷水解酶作为抑制剂的流式筛选和表征工具

  摘要：

  核苷水解酶 (NH) 被认为是开发新型抗原虫剂的目标。用于鉴定 NH 抑制剂的新型自动化筛选方法的开发可以加速药物发现过程的第一阶段。在这项工作中，来自杜氏利什曼原虫的 NH(LdNH) 被共价固定到磁性颗粒 (LdNH-MPs) 上，并被磁铁捕获到 TFE 管中，形成固定化酶反应器 (IMER)。对于自动测定，Ld NH-MP-IMER 串联连接至 HPLC-DAD 系统中的分析柱，通过产物次黄嘌呤的定量来监测酶活性。动力学研究得出肌苷底物的K M值为 2079 ± 87 µmol.L-1使用含有 12 种喹诺酮核糖核苷的文库对LdNH-MP-IMER 进行流动筛选验证。其中，3个被鉴定为新型竞争性LdNH抑制剂，Ki值在83.5至169.4 µmol.L-1。这种新颖的在线筛选测定已被证明可靠、快速、低成本，并且适用于大型化合物库。

  DOI：

  10.1016/j.jpba.2023.115589

文献信息

• Conformational analysis of a quinolonic ribonucleoside with anti-HSV-1 activity
  作者：Julliane D. Yoneda、Marcia Helena R. Velloso、Kátia Z. Leal、Rodrigo B. de V. Azeredo、Makiko Sugiura、Magaly G. Albuquerque、Fernanda da C. Santos、Maria Cecília B.V. de Souza、Anna Claudia Cunha、Peter R. Seidl、Ricardo B. de Alencastro、Vitor F. Ferreira

  DOI：10.1016/j.molstruc.2010.01.044

  日期：2011.1

  synthesized by part of our group indicated that some of them have antiviral activity against HSV-1. The conformational analysis of bioactive compounds is extremely important in order to better understand their chemical structures and biological activity. In this work, we have carried out a nuclear relaxation NMR study of 6-Me ribonucleoside derivative in order to determine if the syn or anti conformation is preferential

  摘要 单纯疱疹病毒引起的感染是成人最常见的疾病来源之一，目前有几种天然核苷类似物用于治疗这些感染。我们小组部分合成的一系列喹诺酮核糖核苷衍生物的体外试验表明，其中一些对HSV-1具有抗病毒活性。生物活性化合物的构象分析对于更好地了解其化学结构和生物活性非常重要。在这项工作中，我们对 6-Me 核糖核苷衍生物进行了核弛豫 NMR 研究，以确定顺式或反式构象是优先的。NMR 分析允许通过使用基于核弛豫和相关现象的技术来确定原子间距离。这些技术是非选择性纵向或自旋晶格弛豫率和 NULL 脉冲序列，它们允许确定氢原子对之间的距离。将核磁共振研究的结果与通过分子模型获得的结果进行比较。
• Molecular design, synthesis and biological evaluation of 1,4-dihydro-4-oxoquinoline ribonucleosides as TcGAPDH inhibitors with trypanocidal activity
  作者：Fabyana A. Soares、Renata Sesti-Costa、João Santana da Silva、Maria Cecília B.V. de Souza、Vitor F. Ferreira、Fernanda da C. Santos、Patricia A.U. Monteiro、Andrei Leitão、Carlos A. Montanari

  DOI：10.1016/j.bmcl.2013.06.029

  日期：2013.8

  The 1,4-dihydro-4-oxoquinoline ribonucleoside, Neq135, is the first low micromolar trypanosomatidae inhibitor to show good ligand efficiency (0.28 kcal mol(-1) atom(-1)) and good ligand lipophilicity efficiency (0.37 kcal mol(-1) atom(-1)) when acting against Trypanosoma cruzi glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase (TcGAPDH). This and other six ribonucleosides were synthesized using our in-house technology, and assayed against the GAPDH NAD(+) site using isothermal titration calorimetry (ITC). Compound Neq135 had acceptable in vitro cytotoxicity, inhibited TcGAPDH with a K-i(app) value of 16 mu M and killed the trypomastigote form of Trypanosoma cruzi Tulahuen strain with a concentration similar to that displayed by the control drug benznidazole. Neq135 is tenfold lower kinetic affinity against hGAPDH and does not kill Balb-c fibroblast nor spleen mouse cells. These results emphasize the possibility of integrating ligand- and target-based designs to uncover potent and selective TcGAPDH inhibitors that expands the opportunity for further medicinal chemistry endeavor towards NAD(+) TcGAPDH site. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Nucleoside hydrolase immobilized on magnetic particles as a tool for onflow screening and characterization of inhibitors
  作者：Pamella Christina Ortega de Oliveira、Millena Santana Ceroullo、Mayane Barbosa dos Santos、Pedro Rodrigues Coelho Medeiros、Bruno Clemente Brandão Marques、Luzineide Wanderley Tinoco、Maria Cecília Bastos Vieira de Souza、Fernanda da Costa Santos Boechat、Marcela Cristina de Moraes

  DOI：10.1016/j.jpba.2023.115589

  日期：2023.10

  immobilized enzyme reactor (IMER). For an automated assay, the LdNH-MP-IMER was connected in-line to an analytical column in an HPLC-DAD system to monitor the enzyme activity through quantification of the product hypoxanthine. Kinetic studies provided a KM value of 2079 ± 87 µmol.L−1 for the inosine substrate. Validation of the LdNH-MP-IMER for onflow screening purposes was performed with a library containing

  核苷水解酶 (NH) 被认为是开发新型抗原虫剂的目标。用于鉴定 NH 抑制剂的新型自动化筛选方法的开发可以加速药物发现过程的第一阶段。在这项工作中，来自杜氏利什曼原虫的 NH(LdNH) 被共价固定到磁性颗粒 (LdNH-MPs) 上，并被磁铁捕获到 TFE 管中，形成固定化酶反应器 (IMER)。对于自动测定，Ld NH-MP-IMER 串联连接至 HPLC-DAD 系统中的分析柱，通过产物次黄嘌呤的定量来监测酶活性。动力学研究得出肌苷底物的K M值为 2079 ± 87 µmol.L-1使用含有 12 种喹诺酮核糖核苷的文库对LdNH-MP-IMER 进行流动筛选验证。其中，3个被鉴定为新型竞争性LdNH抑制剂，Ki值在83.5至169.4 µmol.L-1。这种新颖的在线筛选测定已被证明可靠、快速、低成本，并且适用于大型化合物库。