{2‐[(2R,5R)‐5‐(2,4‐dioxo‐1,2,3,4‐tetrahydropyrimidin‐1‐yl)‐3‐hydroxyoxolan‐2‐yl]ethyl}phosphonic acid | 1363739-81-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 二嗪类
• 英文名称: {2‐[(2R,5R)‐5‐(2,4‐dioxo‐1,2,3,4‐tetrahydropyrimidin‐1‐yl)‐3‐hydroxyoxolan‐2‐yl]ethyl}phosphonic acid
• 英文别名: {2-[(2R,5R)-5-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-1-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]ethyl}phosphonic acid；1-[(3S,4R)-6-(dihydroxyphosphinyl)-2,5,6-trideoxy-β-hexofuranosyl]uracil；1-[2,5,6-trideoxy-6-(dihydroxyphosphinyl)-β-D-hexofuranosyl]uracil
• CAS: 1363739-81-4
• 化学式: C₁₀H₁₅N₂O₇P
• 分子量: 306.212
• InChiKey: RJNCOKMSVJALCN-LKEWCRSYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.25
• 重原子数：
  20.0
• 可旋转键数：
  4.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  141.85
• 氢给体数：
  4.0
• 氢受体数：
  6.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  2-脱氧尿苷 在 fac-tris(2-phenylpyridinato-N,C2')iridium(III) 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 二氢吡啶 、 10 wt% Pd(OH)2 on carbon 、 氢气 、 三苯基膦 、 silver(l) oxide 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 1,2-二氯乙烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 117.0h， 生成 {2‐[(2R,5R)‐5‐(2,4‐dioxo‐1,2,3,4‐tetrahydropyrimidin‐1‐yl)‐3‐hydroxyoxolan‐2‐yl]ethyl}phosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  2'-脱氧5'-的Photoredox催化Deformylative 1,4-加成Ø -phthalimidonucleosides核苷的5'-卡巴类似物的合成5'-磷酸盐

  摘要：

  开发了一种简明的方法，该方法通过可见光介导的脱甲酰基1，4-加成从2'-脱氧-5' - O-邻苯二甲酰亚胺核苷合成核苷5'-磷酸的5'-carba类似物。该方法使得能够快速且容易地生成核苷的4'-碳自由基。而且，该合成策略适用于核苷5'-磷酸的5'-carba类似物以及其他带有甲氧基羰基，氰基和N-甲基氨磺酰基的5'-carba核苷。

  DOI：

  10.1021/acs.joc.8b00637

文献信息

• Synthesis of 5-Substituted 2′-Deoxyuridine-5′- Phosphonate Analogues and Evaluation of their Antiviral Activity
  作者：Sara Van Poecke、Davy Sinnaeve、José C. Martins、Jan Balzarini、Serge Van Calenbergh

  DOI：10.1080/15257770.2012.654876

  日期：2012.3

  A small series of 5-(hetero)aryl-modified nucleoside phosphonates was synthesized via an 8-step procedure including a Wittig reaction and Suzuki–Miyaura coupling. An unanticipated anomerization during phosphonate deprotection allowed us to isolate both anomers of the 5-substituted 2′-deoxy-uridine phosphonates and assess their antiviral activity against a broad panel of viruses.

  通过5-步骤（包括Wittig反应和Suzuki-Miyaura偶联）的一小步步骤，合成了少量的5-（杂）芳基修饰的核苷膦酸酯。膦酸酯去保护过程中出乎意料的异化反应使我们能够分离5位取代的2'-脱氧尿苷膦酸酯的两种异构体，并评估它们对多种病毒的抗病毒活性。
• Small Molecule Inhibition of SAMHD1 dNTPase by Tetramer Destabilization
  作者：Kyle J. Seamon、Erik C. Hansen、Anastasia P. Kadina、Boris A. Kashemirov、Charles E. McKenna、Namandjé N. Bumpus、James T. Stivers

  DOI：10.1021/ja5035717

  日期：2014.7.16

  SAMHD1 is a GTP-activated nonspecific dNTP triphosphohydrolase that depletes dNTP pools in resting CD4+ T cells and macrophages and effectively restricts infection by HIV-1. We have designed a nonsubstrate dUTP analogue with a methylene bridge connecting the a phosphate and 5' carbon that potently inhibits SAMHD1. Although pppCH(2)dU shows apparent competitive inhibition, it acts by a surprising allosteric mechanism that destabilizes active enzyme tetramer.