(2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(6-isobutyramido-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (2-cyanoethyl) phosphate | 1305318-78-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(6-isobutyramido-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (2-cyanoethyl) phosphate
• CAS: 1305318-78-8
• 化学式: C₃₉H₅₂N₉O₁₁PSi
• 分子量: 881.955
• InChiKey: QDSNFGCBMLHGDR-CXPYHOAVSA-N

物化性质

• 密度：
  1.42±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.33
• 重原子数：
  61.0
• 可旋转键数：
  17.0
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.54
• 拓扑面积：
  253.16
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  18.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(6-isobutyramido-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (2-cyanoethyl) phosphate 、 5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯基)-N4-苯甲酰基-2’-脱氧胞苷-3’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 在 四氮唑 、 2,6-二甲基吡啶 、 碘 作用下， 以 乙腈 、 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 反应 1.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  A new and convenient approach for the preparation of β-cyanoethyl protected trinucleotide phosphoramidites

  摘要：

  我们在此报道一种简便的方法，用于制备全保护的三核苷酸合成子，这些合成子将用于基因库的合成。这些三核苷酸合成子在磷酸残基上具有β-氰乙基团，因此可以在标准的寡核苷酸合成中使用，无需额外的去保护和后处理步骤。

  DOI：

  10.1039/c2ob06934b
• 作为产物：
  描述：

  2'-脱氧腺苷 在 吡啶 、 四氮唑 、 4-二甲氨基吡啶 、 三甲基氯硅烷 、 silver nitrate 、 三乙胺 、 三氯乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 7.17h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(4-benzamido-2-oxopyrimidin-1(2H)-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl (((2R,3S,5R)-3-((tert-butyldimethylsilyl)oxy)-5-(6-isobutyramido-9H-purin-9-yl)tetrahydrofuran-2-yl)methyl) (2-cyanoethyl) phosphate
  参考文献：
  名称：

  A new and convenient approach for the preparation of β-cyanoethyl protected trinucleotide phosphoramidites

  摘要：

  我们在此报道一种简便的方法，用于制备全保护的三核苷酸合成子，这些合成子将用于基因库的合成。这些三核苷酸合成子在磷酸残基上具有β-氰乙基团，因此可以在标准的寡核苷酸合成中使用，无需额外的去保护和后处理步骤。

  DOI：

  10.1039/c2ob06934b