1,1'-[[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11aS)-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1c]-[1,4]benzodiazepin-5,11-dione]]

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 苯二氮卓类
• 英文名称: 1,1'-[[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11aS)-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1c]-[1,4]benzodiazepin-5,11-dione]]
• 英文别名: (6aS)-3-[3-[[(6aS)-2-methoxy-8-methylidene-6,11-dioxo-5,6a,7,9-tetrahydropyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-3-yl]oxy]propoxy]-2-methoxy-8-methylidene-5,6a,7,9-tetrahydropyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-6,11-dione
• 化学式: C₃₁H₃₂N₄O₈
• 分子量: 588.617
• InChiKey: OECLPMNVJYLQFN-GOTSBHOMSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.4
• 重原子数：
  43
• 可旋转键数：
  8
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(三甲基硅烷基)乙氧甲基氯 、 1,1'-[[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11aS)-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1c]-[1,4]benzodiazepin-5,11-dione]] 在 正丁基锂 作用下， 以 四氢呋喃 、 正己烷 为溶剂， 以79%的产率得到1,1'-[[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11aS)-7-methoxy-2-methylidene-10-((2-(trimethylsilyl)ethoxy)methyl)-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1c]-[1,4]benzodiazepin-5,11-dione]]
  参考文献：
  名称：

  [EN] PYRROLOBENZODIAZEPINES
  [FR] PYRROLOBENZODIAZÉPINES

  摘要：

  该发明涉及某些吡咯苯并二氮杂环己烷（PBDs），特别是带有C2取代基的吡咯苯并二氮杂环己烷二聚体，包括以下式（T）的化合物：其中：R2为CHR2A，R2A独立选择自H、R、CO2R、COR、CHO、CO2H和卤素；R6和R9独立选择自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR'、NO2、Me3Sn和卤素；R7独立选择自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR'、NO2、Me3Sn和卤素；R8独立选择自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR'、NO2、Me3Sn和卤素；R独立选择自可选择取代的C1-12烷基、C3-20杂环烷基和C5-20芳基；或该化合物是每个单体为式（M）的二聚体，其中每个单体的R7基团或R8基团共同形成具有-X-R"-X-连接单体的二聚体桥，其中R"为C3-I2烷基，该链可以被一个或多个杂原子中断，例如O、S、N（H）和/或芳香环，例如苯或吡啶；每个X独立选择自O、S或N（H）；或从R6到R9的任意相邻基团对共同形成一个基团-O-(CH2)P-O-，其中p为1或2，以及其盐和溶剂化合物，以及它们作为制备其他PBD化合物的中间体的用途。

  公开号：

  WO2010043877A1
• 作为产物：
  描述：

  (2S,4R)-N-(allyloxycarbonyl)-2-(tert-butyldimethylsilyloxymethyl)-4-hydroxypyrrolidine 在 四氢吡咯 、 吡啶 、 bis-triphenylphosphine-palladium(II) chloride 、 四(三苯基膦)钯 、 草酰氯 、 四丁基氟化铵 、 三正丁基氢锡 、 二甲基亚砜 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 tin(ll) chloride 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 为溶剂， 反应 31.25h， 生成 1,1'-[[(propane-1,3-diyl)dioxy]bis[(11aS)-7-methoxy-2-methylidene-1,2,3,10,11,11a-hexahydro-5H-pyrrolo[2,1c]-[1,4]benzodiazepin-5,11-dione]]
  参考文献：
  名称：

  具有高效交联能力和强细胞毒性的新型吡咯并苯并二氮杂卓DNA相互作用剂的设计，合成和评估。

  摘要：

  已经开发了新颖的序列选择性吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体5（SJG-136），其包含两个C 2-外亚甲基取代的DC-81（3）亚基，它们通过惰性丙二氧基接头通过其C 8位进行束缚。此对称分子是高效的小沟链DNA交联剂（XL（50）= 0.045 microM），其效力比美法仑高440倍。热变性研究表明，与小胸腺DNA以5：1的DNA /配体比率孵育18小时后，T（m）值增加了33.6摄氏度，是该测定法中迄今为止记录的最高值。在相同条件下，类似的二聚体4（DSB-120）在C2位置上没有取代/不饱和键，其熔融仅提高了15.1摄氏度，举例说明了引入C2-exo-不饱和键的作用，该作用是使C环变平并在DNA小槽内实现出色的等螺旋配合。这种行为得到分子模型研究的支持，该研究表明：（i）PBD单元与相反链上的鸟嘌呤共价结合形成交联；（ii）5与4相比具有更大的结合能，而（iii）4 5和5具有跨越

  DOI：

  10.1021/jm001064n

文献信息

• PYRROLOBENZODIAZEPINES
  申请人：Spirogen Sàrl

  公开号：EP2350098B1

  公开（公告）日：2013-05-15
• US8487092B2
  申请人：——

  公开号：US8487092B2

  公开（公告）日：2013-07-16
• Design, Synthesis, and Evaluation of a Novel Pyrrolobenzodiazepine DNA-Interactive Agent with Highly Efficient Cross-Linking Ability and Potent Cytotoxicity
  作者：Stephen J. Gregson、Philip W. Howard、John A. Hartley、Natalie A. Brooks、Lesley J. Adams、Terence C. Jenkins、Lloyd R. Kelland、David E. Thurston

  DOI：10.1021/jm001064n

  日期：2001.3.1

  (SJG-136) has been developed that comprises two C2-exo-methylene-substituted DC-81 (3) subunits tethered through their C8 positions via an inert propanedioxy linker. This symmetric molecule is a highly efficient minor groove interstrand DNA cross-linking agent (XL(50) = 0.045 microM) that is 440-fold more potent than melphalan. Thermal denaturation studies show that, after 18 h incubation with calf thymus

  已经开发了新颖的序列选择性吡咯并苯并二氮杂（PBD）二聚体5（SJG-136），其包含两个C 2-外亚甲基取代的DC-81（3）亚基，它们通过惰性丙二氧基接头通过其C 8位进行束缚。此对称分子是高效的小沟链DNA交联剂（XL（50）= 0.045 microM），其效力比美法仑高440倍。热变性研究表明，与小胸腺DNA以5：1的DNA /配体比率孵育18小时后，T（m）值增加了33.6摄氏度，是该测定法中迄今为止记录的最高值。在相同条件下，类似的二聚体4（DSB-120）在C2位置上没有取代/不饱和键，其熔融仅提高了15.1摄氏度，举例说明了引入C2-exo-不饱和键的作用，该作用是使C环变平并在DNA小槽内实现出色的等螺旋配合。这种行为得到分子模型研究的支持，该研究表明：（i）PBD单元与相反链上的鸟嘌呤共价结合形成交联；（ii）5与4相比具有更大的结合能，而（iii）4 5和5具有跨越
• [EN] PYRROLOBENZODIAZEPINES<br/>[FR] PYRROLOBENZODIAZÉPINES
  申请人：SPIROGEN LTD

  公开号：WO2010043877A1

  公开（公告）日：2010-04-22

  The invention relates to certain pyrrolobenzodiazepines (PBDs), and in particular pyrrolobenzodiazepine dimers bearing C2 substitutions, including compounds of formula (T): wherein: R2 is CHR2A, and R2A is independently selected from H, R, CO2R, COR, CHO, CO2H, and halo; R6 and R9 are independently selected from H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn and halo; R7 is independently selected from H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn and halo; R8 is independently selected from H, R, OH, OR, SH, SR, NH2, NHR, NRR', NO2, Me3Sn and halo; R is independently selected from optionally substituted C1-12 alkyl, C3-20 heterocyclyl and C5-20 aryl groups; or the compound is a dimer with each monomer being of formula (M), where the R7 groups or R8 groups of each monomer form together a dimer bridge having the formula -X-R"-X- linking the monomers; wherein R" is a C3-I2 alkylene group, which chain may be interrupted by one or more heteroatoms, e.g. O, S, N(H), and/or aromatic rings, e.g. benzene or pyridine; and each X is independently selected from O, S, or N(H); or any pair of adjacent groups from R6 to R9 together form a group -O-(CH2)P-O-, where p is 1 or 2, and salts and solvates thereof, and their use as intermediates for the preparation of other PBD compounds.

  该发明涉及某些吡咯苯并二氮杂环己烷（PBDs），特别是带有C2取代基的吡咯苯并二氮杂环己烷二聚体，包括以下式（T）的化合物：其中：R2为CHR2A，R2A独立选择自H、R、CO2R、COR、CHO、CO2H和卤素；R6和R9独立选择自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR'、NO2、Me3Sn和卤素；R7独立选择自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR'、NO2、Me3Sn和卤素；R8独立选择自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR'、NO2、Me3Sn和卤素；R独立选择自可选择取代的C1-12烷基、C3-20杂环烷基和C5-20芳基；或该化合物是每个单体为式（M）的二聚体，其中每个单体的R7基团或R8基团共同形成具有-X-R"-X-连接单体的二聚体桥，其中R"为C3-I2烷基，该链可以被一个或多个杂原子中断，例如O、S、N（H）和/或芳香环，例如苯或吡啶；每个X独立选择自O、S或N（H）；或从R6到R9的任意相邻基团对共同形成一个基团-O-(CH2)P-O-，其中p为1或2，以及其盐和溶剂化合物，以及它们作为制备其他PBD化合物的中间体的用途。