6-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)amino-1,2-propanediol

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: 6-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)amino-1,2-propanediol
• 英文别名: 9H-fluoren-9-ylmethyl N-(5,6-dihydroxyhexyl)carbamate
• 化学式: C₂₁H₂₅NO₄
• 分子量: 355.434
• InChiKey: SLKCKAQUPVULLX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.8
• 重原子数：
  26
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.38
• 拓扑面积：
  78.8
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  6-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)amino-1,2-propanediol 在 吡啶 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.5h， 生成 1-O-DMT-6-N-(fluorenylmethoxycarbonyl)-2-O-(methyl-N,N-diisopropylphosphoramido)-6-amino-1,2-hexanediol
  参考文献：
  名称：

  [EN] DIASTEREOMERIC LINKING REAGENTS FOR NUCLEOTIDE PROBES
  [FR] RÉACTIFS DE LIAISON DIASTÉRÉOMÉRIQUES POUR SONDES NUCLÉOTIDIQUES

  摘要：

  一种多功能试剂，具有一个非核苷单体单元，包括一个对映中心和一个配体，以及与非核苷单体单元相连的第一和第二偶联基团。这种试剂可以制备多功能核苷酸/非核苷酸聚合物，具有任何所需的核苷酸和非核苷酸单体单元序列，其中每个后者都带有所需的配体。这些聚合物可以用作探针，可以展示增强的灵敏度和/或能够检测一类核苷酸，其中每个物种都有一个共同的感兴趣的靶核苷酸序列，通过不感兴趣的不同序列连接。

  公开号：

  WO2021061154A1
• 作为产物：
  描述：

  4-(2,2-dimethyl-1,3-dioxolane-4-yl)-1-butanol 在 吡啶 、 lithium aluminium tetrahydride 、 甲酸 、 sodium azide 、 碳酸氢钠 、 2,2,2-trifluoro-N-(2,3-dihydroxypropyl)acetamide 作用下， 以 乙醚 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 、 丙酮 为溶剂， 反应 4.5h， 生成 6-N-(9-fluorenylmethoxycarbonyl)amino-1,2-propanediol
  参考文献：
  名称：

  [EN] DIASTEREOMERIC LINKING REAGENTS FOR NUCLEOTIDE PROBES
  [FR] RÉACTIFS DE LIAISON DIASTÉRÉOMÉRIQUES POUR SONDES NUCLÉOTIDIQUES

  摘要：

  一种多功能试剂，具有一个非核苷单体单元，包括一个对映中心和一个配体，以及与非核苷单体单元相连的第一和第二偶联基团。这种试剂可以制备多功能核苷酸/非核苷酸聚合物，具有任何所需的核苷酸和非核苷酸单体单元序列，其中每个后者都带有所需的配体。这些聚合物可以用作探针，可以展示增强的灵敏度和/或能够检测一类核苷酸，其中每个物种都有一个共同的感兴趣的靶核苷酸序列，通过不感兴趣的不同序列连接。

  公开号：

  WO2021061154A1

文献信息

• HYBRIDIZATION AND MISMATCH DISCRIMINATION USING OLIGONUCLEOTIDES CONJUGATED TO MINOR GROOVE BINDERS
  申请人：Hedgpeth Joel

  公开号：US20110275070A1

  公开（公告）日：2011-11-10

  Conjugates between a minor groove binding molecule, such as the trimer of 1,2-dihydro-(3H)-pyrrolo[3,2- e ]indole-7-carboxylate (CDPI 3 ), and an oligonucleotide form unusually stable hybrids with complementary target sequences, in which the tethered CDPI 3 group resides in the minor groove of the duplex. These conjugates can be used as probes and primers. Due to their unusually high binding affinity, conjugates as short as 8-mers can be used as amplification primers with high specificity and efficiency. MGB conjugation also increases the discriminatory power of short oligonucleotides, providing enhanced detection of nucleotide sequence mismatches by short oligonucleotides. The MGB-conjugated probes and primers described herein facilitate various analytic and diagnostic procedures, such as amplification reactions, PCR, detection of single-nucleotide polymorphisms, gene hunting, differential display, fluorescence energy transfer, hydrolyzable probe assays and others; by allowing the use of shorter oligonucleotides, which have higher specificity and better discriminatory power.

  一种小沟结合分子（例如1,2-二氢-（3H）-吡咯[3,2-e]吲哚-7-羧酸三聚体（CDPI3））与寡核苷酸之间的共轭体形成具有不寻常稳定性的杂交体，其中被拴系的CDPI3基团存在于双链的小沟中。这些共轭体可用作探针和引物。由于它们的结合亲和力异常高，因此即使是8个碱基的共轭体也可用作扩增引物，具有高特异性和高效性。MGB结合还增加了短寡核苷酸的鉴别能力，通过短寡核苷酸提高了核苷酸序列不匹配的检测能力。所述的MGB结合探针和引物促进了各种分析和诊断过程，例如扩增反应、PCR、单核苷酸多态性检测、基因猎取、差异显示、荧光能量转移、可水解探针测定等；通过允许使用更短的寡核苷酸，这些寡核苷酸具有更高的特异性和更好的鉴别能力。
• US7556923B1
  申请人：——

  公开号：US7556923B1

  公开（公告）日：2009-07-07
• US8465921B2
  申请人：——

  公开号：US8465921B2

  公开（公告）日：2013-06-18
• [EN] DIASTEREOMERIC LINKING REAGENTS FOR NUCLEOTIDE PROBES<br/>[FR] RÉACTIFS DE LIAISON DIASTÉRÉOMÉRIQUES POUR SONDES NUCLÉOTIDIQUES
  申请人：BRENTANO BIOTECHNOLOGY ASS

  公开号：WO2021061154A1

  公开（公告）日：2021-04-01

  A versatile reagent with a non-nucleotide monomeric unit comprising an enantiomeric center and having a ligand, and first and second coupling groups that are linked to the non-nucleotide monomeric unit. Such a reagent permits preparation of versatile nucleotide/non-nucleotide polymers, having any desired sequence of nucleotide and non-nucleotide monomeric units, each of the latter of which bear a desired ligand. These polymers can, for example, be used as probes which can exhibit enhanced sensitivity and/or which are capable of detecting a genus of nucleotides each species of which has a common target nucleotide sequence of interest bridged by different sequences not of interest.

  一种多功能试剂，具有一个非核苷单体单元，包括一个对映中心和一个配体，以及与非核苷单体单元相连的第一和第二偶联基团。这种试剂可以制备多功能核苷酸/非核苷酸聚合物，具有任何所需的核苷酸和非核苷酸单体单元序列，其中每个后者都带有所需的配体。这些聚合物可以用作探针，可以展示增强的灵敏度和/或能够检测一类核苷酸，其中每个物种都有一个共同的感兴趣的靶核苷酸序列，通过不感兴趣的不同序列连接。