环戊烯基尿嘧啶 | 90597-20-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 中文名称: 环戊烯基尿嘧啶
• 英文名称: 1-((1R,4R,5S)-4,5-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)cyclopent-2-en-1-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: Cyclopentenyluracil；1-[(1R,4R,5S)-4,5-dihydroxy-3-(hydroxymethyl)cyclopent-2-en-1-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 90597-20-9
• 化学式: C₁₀H₁₂N₂O₅
• 分子量: 240.216
• InChiKey: FCWVOJUKQSHZIV-VDAHYXPESA-N

物化性质

• 密度：
  1.644±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.1
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.4
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  环戊烯基尿嘧啶 在 Uridine-Cytidine Kinase 2 、 potassium chloride 、 ATP disodium salt 、 cytidine monophosphate kinase 1 、 lactate dehydrogenase from porcine heart 、 pyruvate kinase from rabbit muscle type III 、 phosphoenolpyruvic acid monopotassium salt 、 NADH 、 magnesium chloride 、 4-羟乙基哌嗪乙磺酸 、 1,4-二巯基-2,3-丁二醇 作用下， 以 aq. phosphate buffer 为溶剂， 反应 24.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  通过与嘧啶代谢调节剂组合增强 RNA 依赖性 RNA 聚合酶抑制的抗病毒功效。

  摘要：

  对 GSK983（一种有效的抗病毒剂）作用模式的全基因组分析，确定了二氢乳清酸脱氢酶作为其靶标，并发现嘧啶挽救的基因敲低使细胞对 GSK983 敏感。由于 GSK983 在生理尿苷浓度存在下是一种无效的抗病毒药物，因此我们探索了将 GSK983 与嘧啶补救抑制剂联合使用。我们合成并评估了环戊烯基尿嘧啶 (CPU) 的类似物，它是一种尿苷补救抑制剂。我们发现CPU在细胞内转化为三磷酸盐。当与 GSK983 结合使用时，CPU 导致蜂窝 UTP 和 CTP 池大幅下降。因此，CPU-GSK983 在生理浓度的尿苷存在下抑制登革热病毒复制。此外，CPU-GSK983组合显着增强了RNA依赖性RNA聚合酶（RdRp）对病毒感染的抑制作用。我们的研究结果强调了一种新的宿主靶向策略，可增强 RdRp 抑制剂的抗病毒活性。

  DOI：

  10.1016/j.chembiol.2020.05.002
• 作为产物：
  描述：

  (+/-)-2,2-dimethyl-3αβ,6αβ-dihydro-4H-cyclopenta-1,3-dioxol-4-one 在 4-二甲氨基吡啶 、 双(乙腈)氯化钯(II) 、 potassium tert-butylate 、 氨 、 仲丁基锂 、 三乙胺 、 三苯基膦 、 三氟乙酸 、 对苯醌 、 偶氮二甲酸二乙酯 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 正己烷 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 79.5h， 生成 环戊烯基尿嘧啶
  参考文献：
  名称：

  Enantiomeric Synthesis of d- and l-Cyclopentenyl Nucleosides and Their Antiviral Activity Against HIV and West Nile Virus

  摘要：

  Enantiomeric synthesis Of D- and L-cyclopentenyl nucleosides and their antiviral activity against HIV and West Nile virus are described. The key intermediate (-)- and (+)-cyclopentenyl alcohols (7 and 15) were prepared from D-gamma -ribonolactone and D-ribose, respectively. Coupling of 7 with appropriately blocked purine and pyrimidine bases via the Mitsunobu reaction followed by deprotection afforded the target L-(+)-cyclopentenyl nucleosides (24-28, 31, 33, and 36). D-(-)Cyclopentenyl nucleosides (1, 40, 43, and 52-56) were also prepared by a similar procedure for L-isomers from 15. The synthesized compounds were evaluated for their antiviral activity against two RNA viruses: HIV and West Nile virus. Among the synthesized D-(-)-nucleosides, adenine (1, neplanocin A), cytosine (55, CPE-C), and 5-fluorocytosine (56) analogues exhibited moderate to potent anti-HIV activity (EC50 0.1, 0.06, and 5.34 muM, respectively) with significant cytotoxicity in PBM, Vero, and CEM cells. Also, cytosine (55) and 5-fluorocytosine (56) analogues exhibited the most potent anti-West Nile virus activity (EC50 0.2-3.0 and 15-20 muM, respectively). Among L-(+)-nucleosides, only the cytosine (27) analogue exhibited weak anti-HIV activity (EC50 58.9 muM).

  DOI：

  10.1021/jm010256v

文献信息

• [EN] 3-DEAZANEPLANOCIN DERIVATIVES<br/>[FR] DÉRIVÉS 3-DÉSAZANÉPLANOCINE
  申请人：AGENCY SCIENCE TECH & RES

  公开号：WO2010036213A1

  公开（公告）日：2010-04-01

  This invention describes the series of compounds based on the 3-deazaneplanocin A (DZNep) core structure designed to inhibit the function of Polycomb repressive complex 2 (PRC2) proteins.

  这项发明描述了基于3-去氮烯普拉辛A（DZNep）核心结构的一系列化合物，旨在抑制Polycomb抑制性复合物2（PRC2）蛋白的功能。
• An improved method of synthesis of neplanocin and related cyclopentenyl-containing nucleosides
  作者：Christopher K.H. Tseng、Victor E. Marquez

  DOI：10.1016/s0040-4039(00)89219-9

  日期：1985.1

  condensation of the cyclopentenyl α,-tosylate with the alkali metal salts of 6-chloropurine and uracil, afforded the protected carbocyclic nucleosides and , respectively, which were converted to neplanocin a () and cyclopentenyl uracil () by established methods.

  环戊烯基α-甲苯磺酸酯与6-氯嘌呤和尿嘧啶的碱金属盐的简便一步缩合反应分别提供了受保护的碳环核苷和，通过既定方法分别转化为neplanocin a（）和环戊烯基尿嘧啶（） 。
• 3-Deazaneplanocin Derivatives
  申请人：Chai Christina L. L.

  公开号：US20110237606A1

  公开（公告）日：2011-09-29

  This invention describes the series of compounds based on the 3-deazaneplanocin A (DZNep) core structure designed to inhibit the function of Polycomb repressive complex 2 (PRC2) proteins.

  这项发明描述了基于3-去氮依普利新A（DZNep）核心结构的一系列化合物，旨在抑制多能性组蛋白抑制复合物2（PRC2）蛋白的功能。
• [EN] ENHANCING THE ANTIVIRAL EFFICACY OF RNA VIRUS INHIBITION BY COMBINATION WITH MODULATORS OF PYRIMIDINE METABOLISM<br/>[FR] AMÉLIORATION DE L'EFFICACITÉ ANTIVIRALE DE L'INHIBITION D'UN VIRUS À ARN PAR COMBINAISON AVEC DES MODULATEURS DU MÉTABOLISME DE LA PYRIMIDINE
  申请人：UNIV LELAND STANFORD JUNIOR

  公开号：WO2021011572A1

  公开（公告）日：2021-01-21

  Compounds and methods are provided for the treatment of pathogenic virus infections. Compositions and methods are provided for inhibiting RNA viruses.

  提供了用于治疗致病病毒感染的化合物和方法。提供了用于抑制RNA病毒的组合物和方法。
• Enantioselective synthesis of new analogs of neplanocin A and their biological activity
  作者：Masafumi Arita、Takeki Okumoto、Tadamasa Saito、Yukio Hoshino、Kiyofumi Fukukawa、Satoshi Shuto、Masatoshi Tsujino、Hideo Sakakibara、Masaji Ohno

  DOI：10.1016/s0008-6215(00)90890-5

  日期：1987.12