syringolin B methyl ester | 1227203-77-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: syringolin B methyl ester
• 英文别名: methyl (2S)-2-[[(2S)-1-[[(3E,5S,8S)-2,7-dioxo-5-propan-2-yl-1,6-diazacyclododec-3-en-8-yl]amino]-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamoylamino]-3-methylbutanoate
• CAS: 1227203-77-1
• 化学式: C₂₅H₄₃N₅O₆
• 分子量: 509.646
• InChiKey: OHJNVCRTTHMUEQ-ZDMHAGRFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.6
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.72
• 拓扑面积：
  155
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  syringolin B methyl ester 在 水 、 lithium hydroxide 、 盐酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 水 为溶剂， 以100%的产率得到syringolin B
  参考文献：
  名称：

  丁香脂素A和B的全合成

  摘要：

  据报道，两种最近发现的蛋白酶体抑制剂丁香脂素A和丁香酚B的总合成。我们方法的关键是通过分子内Horner-Wadsworth-Emmons反应生成α，β-不饱和12元内酰胺。这种反应已被广泛用于制备大内酯，但是这项工作为大内酰胺提供了一个罕见的例子。最终步骤包括使用肽偶联方法，包括基于未保护的缬氨酸N-羧酸酐的方法连接双（戊烯基）脲侧链。通过交叉复分解产生了丁香环素A的另外的烯烃。

  DOI：

  10.1021/ol100761z
• 作为产物：
  描述：

  N-alpha-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 四甲基乙二胺 、 氢溴酸 、 zinc trifluoromethanesulfonate 、 sodium carbonate 、 戴斯-马丁氧化剂 、 溶剂黄146 、 三乙胺 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 二氯甲烷 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 37.25h， 生成 syringolin B methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Syntheses and cytotoxicity of syringolin B-based proteasome inhibitors

  摘要：

  The concise and modular total synthesis of the bacterial natural product and irreversible proteasome inhibitor syringolin B has been achieved. This synthesis has enabled the ready preparation of three diverse, structurally modified syringolin derivatives. The actions of these compounds in inhibiting the proliferation of neuroblastoma cell lines was evaluated, and significant enhancements in potency compared to the natural product were realized. (C) 2011 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.tet.2011.09.048

文献信息

• [EN] NOVEL SYRINGOLIN ANALOGUES AND METHODS OF MAKING AND USING SAME<br/>[FR] NOUVEAUX ANALOGUES DE SYRINGOLINE ET PROCÉDÉS DE FABRICATION ET D'UTILISATION DE CEUX-CI
  申请人：UNIV BROWN

  公开号：WO2016182968A1

  公开（公告）日：2016-11-17

  The present invention provides, in certain aspects, novel syringolin analogues, In certain embodiments, the compounds of the invention are proteasome inhibitors, In other embodiments, the compounds treat or prevent a cancer such as, but not limited to, leukemia in a subject,

  本发明在某些方面提供了新颖的西林类似物。在某些实施方式中，本发明的化合物是蛋白酶体抑制剂。在其他实施方式中，这些化合物用于治疗或预防主体中的癌症，如但不限于白血病。
• Rational Design of Selective and Bioactive Inhibitors of the <i>Mycobacterium tuberculosis</i> Proteasome
  作者：Kyle A. Totaro、Dominik Barthelme、Peter T. Simpson、Xiuju Jiang、Gang Lin、Carl F. Nathan、Robert T. Sauer、Jason K. Sello

  DOI：10.1021/acsinfecdis.6b00172

  日期：2017.2.10

  The 20S core particle of the proteasome in Mycobacterium tuberculosis (Mtb) is a promising, yet unconventional, drug target. This multimeric peptidase is not essential, yet degrades proteins that have become damaged and toxic via reactions with nitric oxide (and/or the associated reactive nitrogen intermediates) produced during the host immune response. Proteasome inhibitors could render Mtb susceptible

  结核分枝杆菌（Mtb）中蛋白酶体的20S核心颗粒是有前途的但非常规的药物靶标。该多聚体肽酶不是必需的，而是通过与宿主免疫应答过程中产生的一氧化氮（和/或相关的反应性氮中间体）反应，降解已受损且有毒的蛋白质。蛋白酶体抑制剂可以使Mtb对免疫系统敏感，但只有在不抑制人类必需的20S对应物的情况下，它们才在治疗上可行。Mtb的选择性抑制剂设计和合成20S是基于其独特的底物偏好和模仿丁香脂素的真核蛋白酶体的模拟底物的共价抑制剂的结构。与亲本丁香脂素不同，设计的类似物弱抑制人类20S（Hs 20S）蛋白酶体，比人类对应物优先抑制Mtb 20S多达74倍。此外，它们可以穿透分枝杆菌的细胞包膜并使Mtb易受一氧化氮介导的压力的影响。重要的是，它们不会在体外抑制人细胞系的生长，因此可能是结核药物开发的起点。
• Syringolin analogues and methods of making and using same
  申请人：BROWN UNIVERSITY

  公开号：US10597368B2

  公开（公告）日：2020-03-24

  The present invention provides, in certain aspects, novel syringolin analogues, In certain embodiments, the compounds of the invention are proteasome inhibitors, In other embodiments, the compounds treat or prevent a cancer such as, but not limited to, leukemia in a subject.

  在某些实施方案中，本发明的化合物是蛋白酶体抑制剂；在其他实施方案中，本发明的化合物可以治疗或预防受试者的癌症，例如但不限于白血病。
• Substrate-guided optimization of the syringolins yields potent proteasome inhibitors with activity against leukemia cell lines
  作者：Kyle A. Totaro、Dominik Barthelme、Peter T. Simpson、Robert T. Sauer、Jason K. Sello

  DOI：10.1016/j.bmc.2015.07.041

  日期：2015.9

  Natural products that inhibit the proteasome have been fruitful starting points for the development of drug candidates. Those of the syringolin family have been underexploited in this context. Using the published model for substrate mimicry by the syringolins and knowledge about the substrate preferences of the proteolytic subunits of the human proteasome, we have designed, synthesized, and evaluated syringolin analogs. As some of our analogs inhibit the activity of the proteasome with second-order rate constants 5-fold greater than that of the methyl ester of syringolin B, we conclude that the substrate mimicry model for the syringolins is valid. The improvements in in vitro potency and the activities of particular analogs against leukemia cell lines are strong bases for further development of the syringolins as anti-cancer drugs. (c) 2015 Elsevier Ltd. All rights reserved.
• Macrocyclic proteasome inhibitors
  申请人：BROWN UNIVERSITY

  公开号：US20160130257A1

  公开（公告）日：2016-05-12

  Compositions are provided for selectively inhibiting bacterial proteasome. Also provided are methods for assaying the compositions, methods for treating bacterial infection, and methods for inducing apoptosis in tumor cells using the compositions.