N6-[4-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-benzyl]-2'-deoxyadenosine | 1030006-25-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: N6-[4-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-benzyl]-2'-deoxyadenosine
• 英文别名: 2,2,2-trifluoro-N-[3-[4-[[[9-[(2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]amino]methyl]phenyl]prop-2-ynyl]acetamide
• CAS: 1030006-25-7
• 化学式: C₂₂H₂₁F₃N₆O₄
• 分子量: 490.442
• InChiKey: SSTXCLUFLHSRSC-GVDBMIGSSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.9
• 重原子数：
  35
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  134
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N6-[4-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-benzyl]-2'-deoxyadenosine 在 三氯氧磷 作用下， 以 磷酸三甲酯 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 4.08h， 生成 6-FAM labeled N6-[4-(3-amino-1-propyl)benzyl]-2'-deoxyadenosine-5'-triphosphate
  参考文献：
  名称：

  3′-OH unblocked nucleotides and nucleosides base modified with non-cleavable, terminating groups and methods for their use in DNA sequencing

  摘要：

  提供的是本文描述的新型核苷酸、核苷和它们的衍生物，可用于DNA测序技术和其他类型的DNA分析。在一个实施例中，未保护的3'-OH基团的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生，包括通过连接剂连接到不可切断终止基团的荧光染料。不可切断的荧光基团被设计为终止DNA合成，以便DNA寡聚体可以以并行格式高效测序。这些试剂和方法将导致对多态性和其他有价值的遗传信息更准确的识别。

  公开号：

  US07893227B2
• 作为产物：
  描述：

  4-碘苄基溴 在 四(三苯基膦)钯 copper(l) iodide 、 四丁基氟化铵 、 silica gel 、 sodium hydride 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 53.0h， 生成 N6-[4-(3-trifluoroacetamido-1-propynyl)-benzyl]-2'-deoxyadenosine
  参考文献：
  名称：

  3′-OH unblocked nucleotides and nucleosides base modified with non-cleavable, terminating groups and methods for their use in DNA sequencing

  摘要：

  提供的是本文描述的新型核苷酸、核苷和它们的衍生物，可用于DNA测序技术和其他类型的DNA分析。在一个实施例中，未保护的3'-OH基团的核苷酸或核苷在核碱基上被衍生，包括通过连接剂连接到不可切断终止基团的荧光染料。不可切断的荧光基团被设计为终止DNA合成，以便DNA寡聚体可以以并行格式高效测序。这些试剂和方法将导致对多态性和其他有价值的遗传信息更准确的识别。

  公开号：

  US07893227B2