3-[[4-[(1-methyl-4-piperidyl)oxy]phenoxy]methyl]aniline

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚醚
• 英文名称: 3-[[4-[(1-methyl-4-piperidyl)oxy]phenoxy]methyl]aniline
• 英文别名: 3-[[4-(1-Methylpiperidin-4-yl)oxyphenoxy]methyl]aniline；3-[[4-(1-methylpiperidin-4-yl)oxyphenoxy]methyl]aniline
• 化学式: C₁₉H₂₄N₂O₂
• 分子量: 312.412
• InChiKey: XIACPJUILPPKKS-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.3
• 重原子数：
  23
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  47.7
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-甲基-4H-噻吩并[3,2-b]吡咯-5-羧酸 、 3-[[4-[(1-methyl-4-piperidyl)oxy]phenoxy]methyl]aniline 在 氯化亚砜 、 N,N-二甲基甲酰胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 、 吡啶 为溶剂， 反应 3.25h， 以50%的产率得到4-methyl-N-[3-[[4-[(1-methyl-4-piperidyl)oxy]phenoxy]methyl]-phenyl]thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Thieno [3,2 - b ]吡咯-5-羧酰胺是组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM1A / LSD1的新型可逆抑制剂。第1部分：高通量筛选和初步探索

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01018
• 作为产物：
  描述：

  3-硝基溴苄 在 盐酸 、 platinum(IV) oxide 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 氢气 、 sodium cyanoborohydride 、 potassium carbonate 、 溶剂黄146 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 水 、 丙酮 为溶剂， 70.0 ℃ 、101.33 kPa 条件下， 反应 8.5h， 生成 3-[[4-[(1-methyl-4-piperidyl)oxy]phenoxy]methyl]aniline
  参考文献：
  名称：

  Thieno [3,2 - b ]吡咯-5-羧酰胺是组蛋白赖氨酸脱甲基酶KDM1A / LSD1的新型可逆抑制剂。第1部分：高通量筛选和初步探索

  摘要：

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。

  DOI：

  10.1021/acs.jmedchem.6b01018

文献信息

• Thienopyrroles as histone demethylase inhibitors
  申请人：IEO - Istituto Europeo di Oncologia Srl

  公开号：EP2993175A1

  公开（公告）日：2016-03-09

  The present invention relates to thienopyrrole derivatives, wherein R, R1, R2 and R3 are as defined in the specification, pharmaceutical compositions containing such compounds and to their use in therapy.

  本发明涉及噻吩吡咯衍生物（其中 R、R1、R2 和 R3 如说明书中所定义）、含有此类化合物的药物组合物及其在治疗中的用途。
• [EN] THIENOPYRROLES AS HISTONE DEMETHYLASE INHIBITORS<br/>[FR] THIÉNOPYRROLES COMME INHIBITEURS DE L'HISTONE DÉMÉTHYLASE
  申请人：ISTITUTO EUROP DI ONCOLOGIA S R L

  公开号：WO2016034946A3

  公开（公告）日：2016-05-12
• THIENOPYRROLES AS HISTONE DEMETHYLASE INHIBITORS
  申请人：Istituto Europeo di Oncologia S.r.l.

  公开号：EP3189059A2

  公开（公告）日：2017-07-12
• Thieno[3,2-<i>b</i>]pyrrole-5-carboxamides as New Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1. Part 2: Structure-Based Drug Design and Structure–Activity Relationship
  作者：Paola Vianello、Luca Sartori、Federica Amigoni、Anna Cappa、Giovanni Fagá、Raimondo Fattori、Elena Legnaghi、Giuseppe Ciossani、Andrea Mattevi、Giuseppe Meroni、Loris Moretti、Valentina Cecatiello、Sebastiano Pasqualato、Alessia Romussi、Florian Thaler、Paolo Trifiró、Manuela Villa、Oronza A. Botrugno、Paola Dessanti、Saverio Minucci、Stefania Vultaggio、Elisa Zagarrí、Mario Varasi、Ciro Mercurio

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01019

  日期：2017.3.9

  The balance of methylation levels at histone H3 lysine 4 (H3K4) is regulated by KDM1A (LSD1). KDM1A is overexpressed in several tumor types, thus representing an emerging target for the development of novel cancer therapeutics. We have previously described (Part 1, DOI 10.1021.acs.jmedchem.6b01018) the identification of thieno[3,2-b]pyrrole-5-carboxamides as novel reversible inhibitors of KDM1A, whose preliminary exploration resulted in compound 2 with biochemical IC50 = 160 nM. We now report the structure-guided optimization of this chemical series based on multiple ligand/KDM1A-CoRest cocrystal structures, which led to several extremely potent inhibitors. In particular, compounds 46, 49, and 50 showed single-digit nanomolar IC50 values for in vitro inhibition of KDM1A, with high selectivity in secondary assays. In THP-1 cells, these compounds transcriptionally affected the expression of genes regulated by KDM1A such as CD14, CD11b, and CD86. Moreover, 49 and SO showed a remarkable anticlonogenic cell growth effect on MLL-AF9 human leukemia cells.
• Thieno[3,2-<i>b</i>]pyrrole-5-carboxamides as New Reversible Inhibitors of Histone Lysine Demethylase KDM1A/LSD1. Part 1: High-Throughput Screening and Preliminary Exploration
  作者：Luca Sartori、Ciro Mercurio、Federica Amigoni、Anna Cappa、Giovanni Fagá、Raimondo Fattori、Elena Legnaghi、Giuseppe Ciossani、Andrea Mattevi、Giuseppe Meroni、Loris Moretti、Valentina Cecatiello、Sebastiano Pasqualato、Alessia Romussi、Florian Thaler、Paolo Trifiró、Manuela Villa、Stefania Vultaggio、Oronza A. Botrugno、Paola Dessanti、Saverio Minucci、Elisa Zagarrí、Daniele Carettoni、Lucia Iuzzolino、Mario Varasi、Paola Vianello

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.6b01018

  日期：2017.3.9

  increasingly recognized as a potential therapeutic target in oncology. We report on a high-throughput screening campaign performed on KDM1A/CoREST, using a time-resolved fluorescence resonance energy transfer (TR-FRET) technology, to identify reversible inhibitors. The screening led to 115 hits for which we determined biochemical IC50, thus identifying four chemical series. After data analysis, we have

  赖氨酸特异性脱甲基酶1 KDM1A（LSD1）调节组蛋白甲基化，并日益被认为是肿瘤学中潜在的治疗靶标。我们报告了使用时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术在KDM1A / CoREST上进行的高通量筛选活动，以鉴定可逆抑制剂。筛选导致115个结果，我们确定了它们的生化IC 50，从而确定了四个化学系列。经过数据分析，我们确定了N-苯基-4 H-噻吩并[3，2- b ]吡咯-5-羧酰胺的化学系列的优先级，为此，我们获得了最有力的X射线结构（化合物19，IC 50= 2.9μM）与酶复合。该化学类别的最初扩展，包括修饰核心结构和修饰苯甲酰胺部分，都指向负责与酶相互作用的部分的定义。初步优化产生了化合物90，该化合物具有亚微摩尔IC 50（0.162μM）抑制酶，能够抑制细胞中的靶标。