N-叔丁氧羰基-N'-[(烯丙氧基)羰基]-L-鸟氨酸 | 171820-74-9

• 物质功能分类: 生物化工 - 氨基酸及其衍生物 - BOC-氨基酸
• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 中文名称: N-叔丁氧羰基-N'-[(烯丙氧基)羰基]-L-鸟氨酸
• 英文名称: Boc-(S)-Orn(Alloc)-OH
• 英文别名: Boc-L-Orn(Alloc)-OH；Boc-Orn(Alloc)-OH；Boc-(S)Orn-(Alloc)-OH；(2S)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-5-(prop-2-enoxycarbonylamino)pentanoic acid
• CAS: 171820-74-9
• 化学式: C₁₄H₂₄N₂O₆
• 分子量: 316.354
• InChiKey: OSIUYHBPBBOKMJ-JTQLQIEISA-N

物化性质

• 沸点：
  504.9±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.153

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.6
• 重原子数：
  22
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.64
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

安全信息

• WGK Germany：
  3
• 海关编码：
  2924199090
• 危险性防范说明：
  P261,P280,P301+P312,P302+P352,P305+P351+P338
• 危险性描述：
  H302,H315,H319,H335

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-叔丁氧羰基-N'-[(烯丙氧基)羰基]-L-鸟氨酸 在 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 64.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  伪肽化合物，用于在水性介质中生成化学变化的大环化合物的动态组合库†

  摘要：

  简单的四步合成导致制备包含中心芳族核和氨基酸侧链的C 2对称二硫醇。这些构件允许在水性介质中制备假肽大环化合物的动态共价文库，该库涵盖了广泛的极性，官能团和体积，反映了天然肽的多样性。生成的动态库的多功能性已通过在两个生物学相关模板的作用下从同一库中扩增出两个不同成员来说明。

  DOI：

  10.1039/c6ob02441f
• 作为产物：
  描述：

  N-叔丁氧羰基-N'-苄氧羰基-L-鸟氨酸 在 palladium 10% on activated carbon 、 甲酸铵 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 乙醚 、 水 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 N-叔丁氧羰基-N'-[(烯丙氧基)羰基]-L-鸟氨酸
  参考文献：
  名称：

  烯丙基保护和改进的纯化策略可以合成功能化的膦酰胺盐肽

  摘要：

  摘要 对于现代生物物理方法，例如等温滴定热法，目标抑制剂的高纯度是必不可少的。在本文中，我们描述了一种合成和纯化功能化膦酰胺酸肽的程序，该程序能够生成金属蛋白酶嗜热菌蛋白酶的抑制剂，用于生物物理实验。该方法利用了烯丙基酯/分配保护策略，并利用了快速有效的固相萃取（SPE）纯化步骤。应用该策略，我们能够合成一系列具有极高纯度的氨基和羟基官能化侧链的高极性抑制剂。 对于现代生物物理方法，例如等温滴定热法，目标抑制剂的高纯度是必不可少的。在本文中，我们描述了一种合成和纯化功能化膦酰胺酸肽的程序，该程序能够生成金属蛋白酶嗜热菌蛋白酶的抑制剂，用于生物物理实验。该方法利用了烯丙基酯/分配保护策略，并利用了快速有效的固相萃取（SPE）纯化步骤。应用该策略，我们能够合成一系列具有极高纯度的氨基和羟基官能化侧链的高极性抑制剂。

  DOI：

  10.1055/s-0036-1588393

文献信息

• Synthesis of orthogonally protected optically pure ketopiperazine, diketopiperazine, ketodiazepane, and 3-aminopyrrolidone building blocks for peptidomimetic combinatorial chemistry
  作者：Gary Gellerman、Eran Hazan、Marina Kovaliov、Amnon Albeck、Shimon Shatzmiler

  DOI：10.1016/j.tet.2008.12.046

  日期：2009.2

  convenient synthesis of orthogonally protected multi-tethered, optically pure 2-ketopiperazine, diketopiperazine, 2-ketodiazepane and 3-aminopyrrolidone scaffolds for Fmoc combinatorial chemistry has been developed. It utilizes accessible chiral amino acid precursors, sequentially applying reductive alkylation, dipeptide coupling and regioselective ring formation as key steps. These scaffolds are expansion

  已经开发了一种简单且方便的用于Fmoc组合化学的正交保护的多链光学纯净的2-ketopiperazine，diketopiperazine，2-ketodiazepane和3-aminopyrrolidone支架的合成方法。它利用可及的手性氨基酸前体，依次应用还原性烷基化，二肽偶联和区域选择性环形成作为关键步骤。这些支架是我们“特权构件库”的扩展，可以通过“围绕支架”的药物优化，在三个独立的方向上将有价值的类似药物的性质引入任何与医学相关的哌嗪，二氮杂环庚烷和吡咯烷酮基序。这项工作中报道的合成途径是通用的，可用于制备多种骨架，控制手性，臂的位置和长度，以及臂上功能部分的性质，以便在三个独立方向上进一步多样化。此外，这些组成部分在组合化学和药物设计领域中管理快速高效的多循环优化过程中具有广泛的应用范围。
• [EN] HETEROCYCLIC SCAFFOLDS USEFUL FOR PREPARATION OF COMBINATORIAL LIBRARIES, LIBRARIES AND METHODS OF PREPARATION THEREOF<br/>[FR] ECHAFAUDAGES HÉTÉROCYCLIQUES UTILES POUR LA PRÉPARATION DE BIBLIOTHÈQUES COMBINATOIRES, BIBLIOTHÈQUES ET LEURS PROCÉDÉS DE PRÉPARATION
  申请人：ARIEL THE UNIVERSITY COMPANY F

  公开号：WO2009037642A1

  公开（公告）日：2009-03-26

  Disclosed are heterocyclic scaffolds useful, for example, for solid-phase organic synthesis of combinatorial libraries and methods for the preparation thereof. Also disclosed are libraries, including combinatorial libraries, and methods for preparation thereof. Exemplified are the following scaffolds (I):

  揭示了有用的杂环支架，例如用于组合库的固相有机合成以及其制备方法。还公开了包括组合库在内的库以及其制备方法。以下是示例支架（I）:
• Peptidic Inhibitors and a Fluorescent Probe for the Selective Inhibition and Labelling of Factor XIIIa Transglutaminase
  作者：Eric W. J. Gates、Kian Mansour、Sahar Ebrahimi Samani、Sammir Shad、Mari T. Kaartinen、Jeffrey W. Keillor

  DOI：10.3390/molecules28041634

  日期：——

  Factor XIIIa (FXIIIa) is a transglutaminase of major therapeutic interest for the development of anticoagulants due to its essential role in the blood coagulation cascade. While numerous FXIIIa inhibitors have been reported, they failed to reach clinical evaluation due to their lack of metabolic stability and low selectivity over transglutaminase 2 (TG2). Furthermore, the chemical tools available for the study of FXIIIa activity and localization are extremely limited. To combat these shortcomings, we designed, synthesised, and evaluated a library of 21 novel FXIIIa inhibitors. Electrophilic warheads, linker lengths, and hydrophobic units were varied on small molecule and peptidic scaffolds to optimize isozyme selectivity and potency. A previously reported FXIIIa inhibitor was then adapted for the design of a probe bearing a rhodamine B moiety, producing the innovative KM93 as the first known fluorescent probe designed to selectively label active FXIIIa with high efficiency (kinact/KI = 127,300 M−1 min−1) and 6.5-fold selectivity over TG2. The probe KM93 facilitated fluorescent microscopy studies within bone marrow macrophages, labelling FXIIIa with high efficiency and selectivity in cell culture. The structure–activity trends with these novel inhibitors and probes will help in the future study of the activity, inhibition, and localization of FXIIIa.

  因子 XIIIa（FXIIIa）是一种转谷氨酰胺酶，在血液凝固级联过程中起着至关重要的作用，因此对抗凝剂的开发具有重要的治疗意义。虽然已有许多 FXIIIa 抑制剂的报道，但由于它们缺乏代谢稳定性，而且对转谷氨酰胺酶 2 (TG2) 的选择性较低，因此未能进行临床评估。此外，用于研究 FXIIIa 活性和定位的化学工具也极为有限。为了克服这些不足，我们设计、合成并评估了一个包含 21 种新型 FXIIIa 抑制剂的文库。我们改变了小分子和多肽支架上的亲电弹头、链接长度和疏水单元，以优化同工酶的选择性和效力。随后，对之前报道的一种 FXIIIa 抑制剂进行了改良，设计出了一种带有罗丹明 B 分子的探针，从而产生了创新性的 KM93，它是第一个已知的荧光探针，可选择性地标记活性 FXIIIa，具有高效率（kinact/KI = 127,300 M-1 min-1）和比 TG2 高 6.5 倍的选择性。KM93 探针有助于在骨髓巨噬细胞内进行荧光显微镜研究，在细胞培养中高效、选择性地标记 FXIIIa。这些新型抑制剂和探针的结构-活性趋势将有助于今后研究 FXIIIa 的活性、抑制和定位。
• Introduction of constrained Trp analogs in RW9 modulates structure and partition in membrane models
  作者：Camille Lozada、Simon Gonzalez、Rémy Agniel、Mathilde Hindie、Luca Manciocchi、Liuba Mazzanti、Tap Ha-Duong、Federica Santoro、Alfonso Carotenuto、Steven Ballet、Nadège Lubin-Germain

  DOI：10.1016/j.bioorg.2023.106731

  日期：2023.10

  series of peptides containing these building blocks has been synthesized by varying the type, position, and number of modifications. The membranotropic activity of the RW9 analogs was studied by spectrofluorescence titration of the peptides in presence of liposomes (DMPG), allowing to calculate partition coefficients (Kp). Our results indicate that the partitioning of the modified peptides depends on

  在过去的几十年里，人们对许多细胞穿透肽（CPP）的穿过细胞膜的能力进行了研究，主要是为了改善细胞对治疗药物的摄取。尽管已经描述了疏水性和阴离子 CPP，但由于存在几个精氨酸 (Arg) 残基，其中许多是聚阳离子的。然而值得注意的是，CPP 中色氨酸 (Trp) 等芳香族氨基酸的存在似乎在实现高促膜活性方面发挥着重要作用。RW9 (RRWWRRRWRR) 是一种源自聚精氨酸 R9 的设计 CPP，具有这两种特性。一般来说，当与膜相互作用时，CPP 采用膜相互作用的最佳构象——在RW9的情况下为两亲性螺旋二级结构。在此，我们假设在肽序列中掺入局部受限的氨基酸可以通过促进其在与膜接触时的结构化来提高RW9的亲膜活性，同时保留一定的可塑性。因此，合成了两种环化色氨酸衍生物（Tcc和Aia ）作为色氨酸残基的替代物掺入RW9中。因此，通过改变修饰的类型、位置和数量，合成了一系列含有这些结构单元的肽。通过在脂质体
• Indoloazepinone-Constrained Oligomers as Cell-Penetrating and Blood-Brain-Barrier-Permeating Compounds
  作者：Olivier Van der Poorten、Baptiste Legrand、Lubomir L. Vezenkov、Júlia García-Pindado、Nadir Bettache、Astrid Knuhtsen、Daniel Sejer Pedersen、Macarena Sánchez-Navarro、Jean Martinez、Meritxell Teixidó、Marcel Garcia、Dirk Tourwé、Muriel Amblard、Steven Ballet

  DOI：10.1002/cbic.201700678

  日期：2018.4.4

  AbstractNon‐cationic and amphipathic indoloazepinone‐constrained (Aia) oligomers have been synthesized as new vectors for intracellular delivery. The conformational preferences of the [l‐Aia‐Xxx]n oligomers were investigated by circular dichroism (CD) and NMR spectroscopy. Whereas Boc‐[l‐Aia‐Gly]2,4‐OBn oligomers 12 and 13 and Boc‐[l‐Aia‐β3‐h‐l‐Ala]2,4‐OBn oligomers 16 and 17 were totally or partially disordered, Boc‐[l‐Aia‐l‐Ala]2‐OBn (14) induced a typical turn stabilized by C5‐ and C7‐membered H‐bond pseudo‐cycles and aromatic interactions. Boc‐[l‐Aia‐l‐Ala]4‐OBn (15) exhibited a unique structure with remarkable T‐shaped π‐stacking interactions involving the indole rings of the four l‐Aia residues forming a dense hydrophobic cluster. All of the proposed FITC‐6‐Ahx‐[l‐Aia‐Xxx]4‐NH2 oligomers 19–23, with the exception of FITC‐6‐Ahx‐[l‐Aia‐Gly]4‐NH2 (18), were internalized by MDA‐MB‐231 cells with higher efficiency than the positive references penetratin and Arg8. In parallel, the compounds of this series were successfully explored in an in vitro blood–brain barrier (BBB) permeation assay. Although no passive diffusion permeability was observed for any of the tested Ac‐[l‐Aia‐Xxx]4‐NH2 oligomers in the PAMPA model, Ac‐[l‐Aia‐l‐Arg]4‐NH2 (26) showed significant permeation in the in vitro cell‐based human model of the BBB, suggesting an active mechanism of cell penetration.