(2R,3S,5R)-5-(6-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-9H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate | 1064690-06-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘌呤核苷
• 英文名称: (2R,3S,5R)-5-(6-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-9H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
• CAS: 1064690-06-7
• 化学式: C₃₈H₃₆N₆O₈
• 分子量: 704.739
• InChiKey: OKFHAROCGHCVKA-DCMFLLSESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.68
• 重原子数：
  52.0
• 可旋转键数：
  12.0
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.29
• 拓扑面积：
  183.86
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3S,5R)-5-(6-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-9H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate 、 5’-(4,4’-二甲氧基三苯基)-3’-脱氧胸苷 2’-(2-氰乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺 在 四氮唑 、 碘 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 、 四氢呋喃 、 吡啶 、 水 为溶剂， 反应 1.5h， 以89%的产率得到
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD

  摘要：

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。

  公开号：

  US20130017973A1
• 作为产物：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl (4-((9-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)carbamoyl)benzyl)carbamate 在 2-二甲氨基吡啶 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 吡啶 为溶剂， 反应 8.0h， 生成 (2R,3S,5R)-5-(6-(4-(((((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonyl)amino)methyl)benzamido)-9H-purin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-3-yl 4-oxopentanoate
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD

  摘要：

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。

  公开号：

  US20130017973A1

文献信息

• Nucleic acid synthesizing dimer amidite and nucleic acid synthesizing method
  申请人：Fujihara Tsuyoshi

  公开号：US08889843B2

  公开（公告）日：2014-11-18

  To provide an excellent dimer amidite which can be subjected to purification, preferably, whose protective groups can be removed under mild conditions, and a method for synthesizing a nucleic acid using the dimer amidite, a dimer amidite having a structure represented by the following General Formula (1) and a method for synthesizing a nucleic acid including performing condensation reaction of the dimer amidite are provided: wherein in General Formula (1), R1 and R2 each independently represent any one of groups selected from General formulas (2) to (4) and Structural Formulas (12) to (15) with a compound where R1 and R2 are each represent Structural Formulas (12) being excluded:  and wherein in the General Formulas (2) to (4), R3 represents any one group represented by the following Structural Formulas (16) to (25):

  提供一种优质的二聚体酰胺，可进行纯化，最好是其保护基在温和条件下可被去除，并提供一种使用该二聚体酰胺合成核酸的方法，所述二聚体酰胺具有以下一般式（1）所代表的结构，以及包括对二聚体酰胺进行缩合反应的核酸合成方法： 在一般式（1）中，R1和R2分别独立地代表从一般式（2）到（4）和结构式（12）到（15）中选择的任一组，并且排除R1和R2分别代表结构式（12）的化合物： 并且在一般式（2）到（4）中，R3代表以下结构式（16）到（25）中所代表的任一组：