(9H-fluoren-9-yl)methyl (4-((9-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)carbamoyl)benzyl)carbamate | 1064690-05-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: (9H-fluoren-9-yl)methyl (4-((9-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)carbamoyl)benzyl)carbamate
• CAS: 1064690-05-6
• 化学式: C₅₄H₄₈N₆O₈
• 分子量: 909.011
• InChiKey: ZTONHIFSBXHMEX-OFHDNNAJSA-N

物化性质

• 密度：
  1.34±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  8.79
• 重原子数：
  68.0
• 可旋转键数：
  15.0
• 环数：
  10.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  168.18
• 氢给体数：
  3.0
• 氢受体数：
  12.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl (4-((9-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)carbamoyl)benzyl)carbamate 在 N-羟基丁二酰亚胺 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 7.5h， 生成 N-(9-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)-4-((2-phenylacetamido)methyl)benzamide
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD

  摘要：

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。

  公开号：

  US20130017973A1
• 作为产物：
  描述：

  (9H-fluoren-9-yl)methyl (4-((9-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)carbamoyl)benzyl)carbamate 、 4,4'-双甲氧基三苯甲基氯 以 吡啶 为溶剂， 反应 4.0h， 以92%的产率得到(9H-fluoren-9-yl)methyl (4-((9-((2R,4S,5R)-5-((bis(4-methoxyphenyl)(phenyl)methoxy)methyl)-4-hydroxytetrahydrofuran-2-yl)-9H-purin-6-yl)carbamoyl)benzyl)carbamate
  参考文献：
  名称：

  FUNCTIONAL MOLECULE, FUNCTIONAL MOLECULE SYNTHESIZING AMIDITE AND TARGET SUBSTANCE ANALYSIS METHOD

  摘要：

  提供一种包括具有引入基团的修饰核苷酸单元的功能分子，其中该基团可被可拆卸地引入到基部；一种合成酰胺基的功能分子合成物，其具有可拆卸地引入到其基部的基团，并用于制造功能分子；以及一种目标物质分析方法，包括：使用功能分子合成酰胺基准备功能分子的随机池；从随机池中筛选出与目标物质有亲和力的功能分子；扩增具有与目标物质有亲和力的功能分子，其中该方法在扩增步骤之前还包括从具有与目标物质有亲和力的功能分子中去除基团。

  公开号：

  US20130017973A1

文献信息

• Nucleic acid synthesizing dimer amidite and nucleic acid synthesizing method
  申请人：Fujihara Tsuyoshi

  公开号：US08889843B2

  公开（公告）日：2014-11-18

  To provide an excellent dimer amidite which can be subjected to purification, preferably, whose protective groups can be removed under mild conditions, and a method for synthesizing a nucleic acid using the dimer amidite, a dimer amidite having a structure represented by the following General Formula (1) and a method for synthesizing a nucleic acid including performing condensation reaction of the dimer amidite are provided: wherein in General Formula (1), R1 and R2 each independently represent any one of groups selected from General formulas (2) to (4) and Structural Formulas (12) to (15) with a compound where R1 and R2 are each represent Structural Formulas (12) being excluded:  and wherein in the General Formulas (2) to (4), R3 represents any one group represented by the following Structural Formulas (16) to (25):

  提供一种优质的二聚体酰胺，可进行纯化，最好是其保护基在温和条件下可被去除，并提供一种使用该二聚体酰胺合成核酸的方法，所述二聚体酰胺具有以下一般式（1）所代表的结构，以及包括对二聚体酰胺进行缩合反应的核酸合成方法： 在一般式（1）中，R1和R2分别独立地代表从一般式（2）到（4）和结构式（12）到（15）中选择的任一组，并且排除R1和R2分别代表结构式（12）的化合物： 并且在一般式（2）到（4）中，R3代表以下结构式（16）到（25）中所代表的任一组：
• Amidite for synthesizing modified nucleic acid and method for synthesizing modified nucleic acid
  申请人：Fujitsu Limited

  公开号：US07910726B2

  公开（公告）日：2011-03-22

  The disclosure provides an excellent amidite for synthesizing a modified nucleic acid, which enables a protective group therein to be removed under a moderate condition, thereby stably producing a hydroxyl group-containing modified nucleic acid. The disclosure also provides a method for synthesizing a modified nucleic acid using the amidite. Specifically, an amidite for synthesizing the modified nucleic acid is expressed by General Formula (I): where X represents a base, Y represents a substituent, Z represents a protective group for protecting a hydroxyl group in the substituent, and Q represents one of a hydrogen atom, a hydroxyl group and a hydroxyl group protected by a protective group, wherein the protective group can be removed in an aprotic solvent, and when the protective group is removed, the hydroxyl group emerges in the substituent.

  该披露提供了一种优良的胺酰胺，用于合成修饰的核酸，该胺酰胺使其中的保护基在适度条件下得以去除，从而稳定地产生含有羟基的修饰核酸。该披露还提供了一种使用该胺酰胺合成修饰核酸的方法。具体地，用于合成修饰核酸的胺酰胺由通式（I）表示：其中X代表一种碱基，Y代表一种取代基，Z代表用于保护取代基中的羟基的保护基，Q代表氢原子、羟基或由保护基保护的羟基中的一种，其中保护基可以在无极性溶剂中去除，当保护基被去除时，羟基出现在取代基中。