1-Deoxy-6-O-phosphono-D-threo-hexo-2,5-diulose

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机氧化合物
• 英文名称: 1-Deoxy-6-O-phosphono-D-threo-hexo-2,5-diulose
• 英文别名: 1-deoxy-D-threo-hexo-2,5-diulose 6-phosphate；[(3S,4S)-3,4-dihydroxy-2,5-dioxohexyl] dihydrogen phosphate
• 化学式: C₆H₁₁O₈P
• 分子量: 242.122
• InChiKey: XBUYIELOLLPBOC-PHDIDXHHSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.3
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  141
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  1-羟基-3-(磷酰氧基)-2-丙酮 、 丙酮醛 在 咪唑 、 Escherichia coli K-12 aldolase YdjI 作用下， 以 重水 为溶剂， 生成 1-Deoxy-6-O-phosphono-D-threo-hexo-2,5-diulose
  参考文献：
  名称：

  YdjI（一种在大肠杆菌K12中未知特异性的醛缩酶）的结构和功能表征。

  摘要：

  该YDJ基因簇的测序的80％中发现大肠杆菌的基因组和人类微生物等密切相关的物种。基于位于该簇中的酶的注释，预期它们一起催化未知碳水化合物的分解代谢。这项研究的重点是YdjI，它位于大肠杆菌K-12的ydj基因簇中。据预测是未知功能的II类醛缩酶。在这里，我们描述了这种酶的结构和功能表征。YdjI催化亲的氢/氘交换小号氢在磷酸二羟基丙酮酯（DHAP）的C3。在DHAP存在下，YdjI催化与多种醛糖的醛醇缩合。YdjI对具有特定羟基立体化学和带负电荷的末端（羧酸根或磷酸根）的高阶（七碳，八碳和九碳）单糖表现出强烈的偏爱。最好的底物是l-阿拉伯糖醛酸，表观k cat为3.0 s –1。该产品，升-甘油基-升-半乳-octuluronate -1-磷酸，具有ķ猫/ ķ米的2.1×10值3中号-1小号-1与YdjI后向醛醇缩合反应。这是第一次记录合成升-甘油基-升-半乳-octuluronate -

  DOI：

  10.1021/acs.biochem.9b00326