N-(tert-butoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-benzyl-2-deoxy-2-nitro-α-D-galactopyranosyl)-L-threonine methyl ester | 552888-37-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: N-(tert-butoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-benzyl-2-deoxy-2-nitro-α-D-galactopyranosyl)-L-threonine methyl ester
• 英文别名: O-(3,4,6-tri-O-benzyl-2-deoxy-2-nitro-α-D-galactopyranosyl)-N-(tert-butoxycarbonyl)-L-threonine methyl ester；N-boc-L-threonine methyl ester 3,4,6-O-tri-benzyl-2-deoxy-2-nitro-α-D-galactopyranoside；methyl (2S,3R)-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-[(2S,3R,4R,5R,6R)-3-nitro-4,5-bis(phenylmethoxy)-6-(phenylmethoxymethyl)oxan-2-yl]oxybutanoate
• CAS: 552888-37-6
• 化学式: C₃₇H₄₆N₂O₁₁
• 分子量: 694.779
• InChiKey: SMIMNFQWTXBFKL-ABPXIICBSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5
• 重原子数：
  50
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.46
• 拓扑面积：
  157
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N-(tert-butoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-benzyl-2-deoxy-2-nitro-α-D-galactopyranosyl)-L-threonine methyl ester 在 Raney-Ni T₄/Pt 、 氢气 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 48.0h， 以86%的产率得到O-(2-amino-3,4,6-tri-O-benzyl-2-deoxy-α-D-galactopyranosyl)-N-(tert-butoxycarbonyl)-L-threonine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  O-糖基氨基酸通过 2-硝基半乳糖连接 - 粘蛋白型 O-聚糖的合成

  摘要：

  N-Boc 和 N-Fmoc 保护的丝氨酸和苏氨酸酯的碱基促进迈克尔型加成到 2-硝基半乳糖衍生物 2 和 26 分别导致高度选择性地生成 α-糖苷 4a-d 和 27a,c。随后苏氨酸衍生物4d和丝氨酸衍生物4a、b的转化产生用作赖氨酸和二肽模拟物的化合物。27a,c 的 6-O-脱甲硅烷基化，然后 6-O-唾液酸化，并将半乳糖部分的硝基转化为 2-乙酰氨基官能团，得到 N-Boc 保护的丝氨酸和苏氨酸叔丁酯 31a,c在羟基上携带 O 保护的 STN 抗原。然后将苏氨酸衍生物 31c 转化为 N-Fmoc 保护的氨基酸结构单元 33，其用于合成粘蛋白重复单元部分结构 Ac-GS(STN)-TAPPAHG-NH2 (1)。

  DOI：

  10.1002/ejoc.200390142
• 作为产物：
  描述：

  BOC-苏氨酸甲酯 、 3,4,6-tri-O-benzyl-2-nitro-D-galactal 在 3 Angstroem MS 、 potassium tert-butylate 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 以96%的产率得到N-(tert-butoxycarbonyl)-O-(3,4,6-tri-O-benzyl-2-deoxy-2-nitro-α-D-galactopyranosyl)-L-threonine methyl ester
  参考文献：
  名称：

  O-糖基氨基酸通过 2-硝基半乳糖连接 - 粘蛋白型 O-聚糖的合成

  摘要：

  N-Boc 和 N-Fmoc 保护的丝氨酸和苏氨酸酯的碱基促进迈克尔型加成到 2-硝基半乳糖衍生物 2 和 26 分别导致高度选择性地生成 α-糖苷 4a-d 和 27a,c。随后苏氨酸衍生物4d和丝氨酸衍生物4a、b的转化产生用作赖氨酸和二肽模拟物的化合物。27a,c 的 6-O-脱甲硅烷基化，然后 6-O-唾液酸化，并将半乳糖部分的硝基转化为 2-乙酰氨基官能团，得到 N-Boc 保护的丝氨酸和苏氨酸叔丁酯 31a,c在羟基上携带 O 保护的 STN 抗原。然后将苏氨酸衍生物 31c 转化为 N-Fmoc 保护的氨基酸结构单元 33，其用于合成粘蛋白重复单元部分结构 Ac-GS(STN)-TAPPAHG-NH2 (1)。

  DOI：

  10.1002/ejoc.200390142

文献信息

• Stereoselective Glycosylation of 2-Nitrogalactals Catalyzed by a Bifunctional Organocatalyst
  作者：Sandra Medina、Matthew J. Harper、Edward I. Balmond、Silvia Miranda、Giacomo E. M. Crisenza、Diane M. Coe、Eoghan M. McGarrigle、M. Carmen Galan

  DOI：10.1021/acs.orglett.6b01962

  日期：2016.9.2

  The use of a bifunctional cinchona/thiourea organocatalyst for the direct and α-stereoselective glycosylation of 2-nitrogalactals is demonstrated for the first time. The conditions are mild, practical, and applicable to a wide range of glycoside acceptors with products being isolated in good to excellent yields. The method is exemplified in the synthesis of mucin type Core 6 and 7 glycopeptides.

  首次证明了双功能金鸡纳/硫脲有机催化剂用于2-硝基半乳糖的直接和α-立体选择性糖基化的用途。条件温和，实用，适用于各种糖苷受体，分离产物的收率良好至极佳。该方法在合成粘蛋白型核心6和7糖肽中得到了例证。
• Synthesis of novel d-α-galactopyranosyl-l-seryl/l-threonyl-l-alanyl-l-alanine as useful precursors of new glycopeptide antibiotics with computational calculations studies
  作者：Ahmed I. Khodair、Shaymaa E. Kassab、Nabila A. Kheder、Asmaa M. Fahim

  DOI：10.1016/j.carres.2022.108546

  日期：2022.4

  of the new glycopeptide derivatives 10a,b is confirmed by assessing the physical character, HOMO-LUMO gap energy, ESP, and the corresponding correlation of 2D-NMR analysis. Furtherly, the target precursors are investigated via the DFT/B3LYP/6–311(G) basis set.

  描述了用于制备新型糖肽抗生素的新的、简单的合成路线。合成化合物的结构通过红外、二维核磁共振光谱和质谱进行了阐明。新糖肽衍生物10a、b的稳定性通过评估物理特性、HOMO-LUMO 间隙能量、ESP 和 2D-​​NMR 分析的相应相关性得到证实。此外，通过DFT/B3LYP/6-311(G) 基组研究目标前体。
• Methyl esters: an alternative protecting group for the synthesis of O-glycosyl amino acid building blocks
  作者：Carlos Mayato、Rosa L. Dorta、Jesús T. Vázquez

  DOI：10.1016/j.tetlet.2007.12.078

  日期：2008.2

  are fundamental building blocks for glycopeptide synthesis, Schmidt’s synthesis method often being chosen for this purpose. Methyl esters used as orthogonal carboxylic acid protecting group in this procedure were found to be an efficient and inexpensive alternative to other groups. The mild selective methyl ester deprotection by LiI improved the efficiency of the synthesis method.

  糖基氨基酸α-GalNAc-Ser和α-GalNAc-Thr是糖肽合成的基本构件，为此经常选择施密特的合成方法。发现在该方法中用作正交羧酸保护基的甲酯是其他基团的有效且廉价的替代物。LiI温和的选择性甲酯脱保护提高了合成方法的效率。
• O-Glycosyl Amino Acids by 2-Nitrogalactal Concatenation − Synthesis of a Mucin-Type O-Glycan
  作者：Gottfried A. Winterfeld、Ahmed I. Khodair、Richard R. Schmidt

  DOI：10.1002/ejoc.200390142

  日期：2003.3

  N-Fmoc-protected serine and threonine esters to 2-nitrogalactal derivatives 2 and 26 led highly selectively to α-glycosides 4a−d and 27a,c, respectively. Ensuing transformation of threonine derivative 4d and serine derivatives 4a,b resulted in compounds useful as lysine and dipeptide mimetics. 6-O-Desilylation of 27a,c, then 6-O-sialylation, and transformation of the nitro group of the galactose moiety into a 2-acetamido

  N-Boc 和 N-Fmoc 保护的丝氨酸和苏氨酸酯的碱基促进迈克尔型加成到 2-硝基半乳糖衍生物 2 和 26 分别导致高度选择性地生成 α-糖苷 4a-d 和 27a,c。随后苏氨酸衍生物4d和丝氨酸衍生物4a、b的转化产生用作赖氨酸和二肽模拟物的化合物。27a,c 的 6-O-脱甲硅烷基化，然后 6-O-唾液酸化，并将半乳糖部分的硝基转化为 2-乙酰氨基官能团，得到 N-Boc 保护的丝氨酸和苏氨酸叔丁酯 31a,c在羟基上携带 O 保护的 STN 抗原。然后将苏氨酸衍生物 31c 转化为 N-Fmoc 保护的氨基酸结构单元 33，其用于合成粘蛋白重复单元部分结构 Ac-GS(STN)-TAPPAHG-NH2 (1)。